Do celów badawczych prowadzi się bardzo szerokie prace, mające na celu oznaczenia sekwencji nukleotydowej całego genu kodującego 16S rRNA lub jego zmiennych części bardzo wielu drobnoustrojów. Bergey’s Manuał of Systematic Bacteriology (II wydanie), podstawowa praca opisująca systematykę drobnoustrojów, traktuje analizę sekwencji 16S rRNA jako podstawę systematyki. Uważa się, że dobrze wykonana analiza podobieństwa sekwencji 16S rRNA pozwala prawidłowo ustalić stopień pokrewieństwa między drobnoustrojami.
region polimorficzny DNA
6