Dichroizm kołowy jest zjawiskiem polegającym na zróżnicowanym oddziaływaniu cząsteczek (chiralnych) ze światłem o różnej polaryzacji kołowej. Kwasy nukleinowe ze względu na strukturę helikalną i określoną skręcalność, bardzo dobrze nadają się do badań metodą CD. Metoda ta pozwala różnicować struktury zawierające pętle oraz wykazujące różną skręcalność. Widmo CD zależy od siły jonowej i rodzaju roztworu, w którym się znajduje. Zmiany konformacyjne w kwasach nukleinowych można badać jako funkcje temperatury, pH, rozpuszczalnika. Technika ta jest szeroko stosowana w badaniu przejść konformacyjnych DNA takich jak denaturacja i zmiana form B-»A oraz B-»A czy rozróżnienie DNA dwuniciowego od trójniciowego. Spektroskopia znajduje także szerokie zastosowanie w badaniu oddziaływań kwasów nukleinowych z substancjami małocząsteczkowymi jak chromofory czy leki. Technika ta znalazła także zastosowanie w badaniu oddziaływań typu: białko-białko czy białko-DNA.
6