Untitled 2

MARKERY MOLEKULARNE

1Z0ENZYMY I IZOFORMY BIAŁEK - różne (pod względem molekularnym i pod względem właściwości fizykochemicznych) formy białka, katalizujące tę samą reakcję biochemiczną (IZOENZYMY) lub pełniące tę samą funkcję białka strukturalne lub zapasowe (IZOFORMY BIAŁEK).

Izofr:*my białek i izoenzymy są bezpośrednimi produktami genów, segregują zgodnie z prawami Mendla, i jako takie są wygodnymi markerami genetycznymi.

Wadami markerów białkowych są:

stosunkowo niewielki polimorfizm (małe zróżnicowanie)

konieczność dopracowywania, osobno dla każdego rodzaju białka, metodyki izolacji, rozdziału na żelach oraz detekcji (barwienia).

Identyfikacja markerów białkowych polega na odpowiedniej ekstrakcji białka z tkanki, rozdziale elektroforę tycznym oczyszczonego białka na żelu skrobiowym bądź poliakrylamidowym oraz jego detekcji za pomocą różnych metod wizualizacji (barwienia). Cząsteczki białka widoczne są na żelu jako prążki. Charakterystyka markera białkowego obejmuje m.in. masę cząsteczkową białka (widocznego na żelu w postaci prążka), określaną długością drogi migracji'w żelu w porównaniu z drogą migracji cząsteczek wzorcowych.

MARKERY DNA - to określonej długości fragmenty DNA uzyskiwane w formie prążków na żelach lub membranach będące efektem końcowym reakcji enzymatycznych lub hybrydyzacji.

Pierwszym etapem uzyskania markerów DNA jest proces izolacji i oczyszczania DNA. Dysponując DNA, o znanym stężeniu i jakości, stosując odpowiednie enzymy i stwarzając określone warunki reakcji możemy poddać je dalszej analizie i zidentyfikować różnego rodzaju markery molekularne.

Podstawowe rodzaje markerów DNA:

1.    markery będące fragmentami DNA powstałymi w wyniku trawienia enzymami restrykcyjnymi - markery RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)

2.    markery (fragmenty DNA) powstające w wyniku łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR -Polymerase Chain Reaction),

markery specyficzne np. STS (Seąuence Tagged Site)

markety' losowe np. RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA)

3.    markery (fragmenty DNA) powstające w wyniku połączenia kilku technik: np. AFLP {Amplified Fragment Length Polymorphism)

Nazwa markera pochodzi od nazwy techniki, w wyniku której jest uzyskiwany.