kach: adeninę w 1 M roztworze H2S04, deoksyguanozynę w 1 M roztworze mrówczanu amonu o pH 6,8, a cytozynę w 1 M roztworze H2S04 oraz w 1 M roztworze mrówczanu amonu o pH 6,8.
Ćwiczenie 10.28. Oscylopolarograficzna charakterystyka DNA Zasada: Patrz ćwiczenie 10.27.
Materiał: Roztwór DNA z grasicy bydlęcej o stężeniu 200 pg w I ml roztworu 0.1 xSSC.
Odczynniki:
1) Roztwór 0,1 xSSC: 10-krotnic rozcieńczony roztwór SSC (0,14 M NaCI w 0,014 M cytrynianie sodu).
2) 1 M roztwór HCOONH4 o pH 6,8.
Wykonanie: Należy zbadać zależność głębokości wgięcia anodowego i katodowego od stężenia preparatu DNA natywnego i zdenaturowanego. Denaturację DNA przeprowadzić ogrzewając roztwór natywnego DNA o stężeniu 200 pg w 1 ml roztworu 0,1 x SSC (w temp. 100°C przez 10 min), a następnie szybko oziębić go w łaźni lodowej. Szereg rozcieńczeń DNA przygotować według tab. 10.3. Dla każdego stężenia DNA, podobnie jak w przypadku zasad azotowych, wykonać 4 6 zdjęć i wyliczyć średnią wartość głębokości wgięcia przy danym stężeniu.
Tabela 10.3. Zestawienie rozcieńczeń roztworu DNA badanego oscylopolarograficznie
Lp. |
Stężenie DNA (Wt/ml) |
Wzorzec DNA (ml) |
Elektrolit podstawowy (ml) |
H,0 (ml) |
I |
100 |
2,5 |
2,5 |
— |
2 |
80 |
2,0 |
2,5 |
0.5 |
3 |
60 |
1,5 |
2,5 |
1.0 |
4 |
40 |
1,0 |
2.5 |
1.5 |
5 |
20 |
0,5 |
2,5 |
2.0 |
Ćwiczenie 10.29. Badanie metodą pulsopolarograficzną uszkodzeń strukturalnych DNA wywołanych muta genami chemicznymi (R. Wiaderkiewicz, Z. Walter 1990: Acta Untoersitatis Lodziensis,Folia Biochimica et Biophysica, 7:27 40)
Zasada: Insektycydy fosforoorganiczne są czynnikami mutagennymi. Po inkubacji in vitro uszkadzają natywną strukturę DNA. W doświadczeniu zbadano działanie DDVP [0,0-dimethyl-0-(2,2-dichlorovinyl)phosphate] — dimetylodichlorowinylo-fosforanu na DNA z grasicy. Pomiar przeprowadza się na pulsopolarografie z użyciem kroplowej elektrody rtęciowej. Warunki oznaczania: atmosfera azotu, 1 V/15 min, amplituda 50 mV, czas opóźnienia 2 s. Stężenie DNA 400 (.tg/ml w roztworze: 0,3 M HCOONH4 - 0,1 M bufor fosforanowosodowy o pH 6,9. Pomiar pulsopołarograficznych szczytów II i III (patrz pełny opis metody).
Materiał: DNA / grasicy bydlęcej otrzymany metodą fenolową (patrz ćw. 10.1)
Odczynniki:
1) Roztwór DNA (1 mg/ml) w 0,1 M buforze fosforanowosodowym (pH 6,9).
2) 0,2 M roztwór HCOONII4 o pH 6,9.
414