wali inne szczepy bakteryjne, w których poprzez rewersję mutacji można oceni*,
substancji chemicznych. Test na rewersję mutacji w systemie Eschcrichia coli lac's rr>u'*k»,
---- .. --------- —--^ *<>st*i, "
w ]990 roku. Jest on alternatywą dla testu Amesa Do oceny mutagenności został ^ szczepy E. coli łacZ-. Bakterie z allelem lacZ- kodują nieaktywną formę (ł-galoktozyd*xyvu7 id laktozy jako źródła węgla, bakterie te wymagają do wzrostu aktywnej formy tego erizvr^
l l l. . . . i____J_ i____j _l.L.___t_____ 1.__.... rnv
i
£
hydrolizuje laktozę do glukozy i galaktozy. Rewersja do formy lacZ+ pozwala na wzrost
a podłożu zawierającym laktozę. Innym testem używanym w ocenie mutagenności substancji ^ test rewersji mutacji w systemie E. coli WP2. Procedura jest taka sama jak w teście Ames'a z tym*?
wzrost bakterii wymaga tryptofanu a nie histydyny, ponieważ £. coli WP2 nie potrafią rosnąć na podłożu nie zawierającym tryptofanu w wyniku mutacji w operonie tego aminokwasu.
Standardowy test Amesa oparty jest na wykorzystaniu zdolności do rewersji histydyno-zależnych auksotroficznych mutantów bakterii Salmonella typhimurium do form prototroficznych. które posiadają zdolność do wzrostu na podłożu minimalnym, pozbawionym czynnika wzrostowego (w tym przypadku aminokwasu L-histydyny). Skonstruowano wiele szczepów testowych zawierający różne mutacje w operonie biosyntezy histydyny (9 genów - 9 enzymów). Działanie czynnika mutagennego na komórki takiego szczepu może powodować rewersję mutacji dającą w efekcie przywr tnie funkcjonalnego genu i w konsekwencji, zdolności komórek do wzrostu na podłożu nie zawierającym histydyny.
Szczepy Salmonella typhimurium stosowane w teście Amesa:
TA 1535 - mutant z substytucją, która powoduje mutację mylną w genie kodującym pierwszy enzym w szlaku syntezy histydyny. Zmutowany enzym ma prolinę podstawioną w miejscu leucyny w normalnym białku;
TA 100 - ma podobny defekt do szczepu TA 1535, ale wykrywa szerszy zakres mutagenow,
TA 1537 - ma mutację typu przesunięcia ramki odczytu (delecja 1 nukleotydu) w innym genie niż TA 1535;
TA 1538 - ma mutację typu przesunięcia ramki odczytu (insercja 1 nukleotydu) w tym samym genie co szczep TA 1537;
TA 98 - jest podobny do szczepu TA 1538, ale wykrywa szerszy zakres mutagenów;
TA 102 i TA 104 w miejscu zapisu rewersji zawierają mutacje ochrę (kodon „stop”).
Oprócz opisanych mutacji każdy z tych szczepów ma jeszcze dodatkowe mutacje takie jak;
1. Mutanty nie mają systemów naprawy7 uszkodzeń typu „reperacji przez wycinanie nukleotydów” --— NER, które w dzikich szczepach są odpowiedzialne za naprawę uszkodzeń DNA powstałych pod wpływem mutagenów7. W efekcie, uszkodzenia DNA powstałe pod wpływem kontaktu 7 badanym w teście .Ames a mutagenem nie są naprawiane i wszystkie mutacje punktowe są widoczne fenotypowo.
2. Mutant}’ posiadają defekty7 wt budowie lipopolisacharydu (LPS) co pozwala na łatwiejszą penetrację związków chemicznych do wnętrza komórki w porównaniu z dzikim szczepem.
Podłoże minimalne używane do testu zawiera śladowe ilości histydyny7 dodawane tylko do tzw. to-p-agaru, tworzącego wierzchnią warstwę agaru. Te śladowe ilości histydyny7 są konieczne, ponieważ niektóre mutageny działają tylko na replikujące DNA. Kiedy mutanty Amesa są wysiewane na takie podłoże, rosną tylko dotąd dokąd nie wyczerpią histydyny (2-3 podziały7 komórkowe trwające ok. wł godziny) i tworzą ledwie widoczne zmętnienie w miękkim agarze. W przeciwieństwie do nich rewertanty tworzą duże kolonie, ponieważ ich wzrost nie jest limitowany ilością histydyny w podłożu.
Wiele związków chemicznych występujących w7 przyrodzie nie jest mutagenna dopóki nie zostanie skonsumowana przez zwierzę (lub człowieka). Jedną z przyczyn jest fakt, że w wątrobie w procesie detoksykacji niektórych związków7 chemicznych powstają związki, które są bardzo silnymi mutagenami. Z tego powodu wiele związków7 badanych w teście Ames a powinno być rutynowo inkubowanyćh z wyciągiem z wątrób)7 szczura (frakcja S9) w środowisku tlenowym, aby oksygenazy wątroby „aktywowały” badany związek. Dopiero zaktywowany związek powinien być stosowany do testu na bakteriach.