Tabela 4.11. /.MlRMicnit najc/ę&cicj Klonowanych (wg katalogów Amersham Pharmacia Biotcch ora/ |
/lo/ >«'|| ilu lim Mml nn l«W i |
kowalencyjnego wią/uniu ligami .) | |
(•rupu | |||
l.p. |
Ugand |
funkcyjna liguiidu użyta do wią/uniu /. nocnikiem |
Na/.wa handlowa /loża |
1 |
Białka, peptydy, aminokwasy, kwasy nukleinowe, polinukleotydy |
aminowa |
CNBr-activatcd Sepharose III Activated CM-Scpharosc 4H Epoxy-activated Sepharose Ml CH-Scpharose 4B Affi-Gel 10 AfTi-Prep 10 |
2 |
Białka, peptydy, aminokwasy |
karboksylowa |
AH-Scpharosc 4B Affi-Gel 102 |
3 |
Cukrowce |
hydroksylowa |
Epoxy-activatcd Sepharose Ml Affi-Gel Hz |
4 |
Białka, peptydy, aminokwasy, nuklcotydy zawierające siarkę |
tiolowa |
Thiopropyl Sepharose 6B Activatcd Thiol Sepharose III Affi-Gel 501 |
5 |
Antybiotyki, hormony, koenzymy, inne małocząstcc/.kowc biomolckuły |
grupy dystansowe: aminowa, tiolowa hydroksylowa, karboksylowa |
CH-Sepharose 4B AH-Scpharose 4B Epoxy-activated Sepharose Ml Activatcd Thiol Sepharose III Thiopropyl Sepharose 6B Affi-Gel 601 |
W tabeli 4.12 zestawiono obecnie dostępne złoża przeznaczone do izolował różnych grup biopolimerów. Warto zauważyć, że chromatografii powinowaci można z powodzeniem użyć również w celu usunięcia niepotrzebnych substaiu / interesującego nas preparatu. Na przykład końcowym etapem izolowania lii rynogenu jest przepuszczenie izolatu przez złoża Gelatin Sepharose 4B i l.ysu Scpharose 4B. dzięki czemu otrzymuje się preparat fibrynogenu wolny od śladowy* ilości fibronektyny i plazminogcnu. W innych sytuacjach dobrze jest zastosown dodatkowe oczyszczanie preparatów tak, aby pozbyć się endotoksyn (AfTi-P polymyxin) lub proteaz serynowych (Benzamidine Sepharose 6B, Arginine Se| ha rosę 4B). Prawidłowo używane i przechowywane złoże można stosować wici krotnie w ciągu wielu miesięcy, bez zauważalnych zmian w zdolności takiego złoi do wiązania odpowiednich substancji.
Ćwiczenie 4.21. Aktywowanie żelu Sepharose w reakcji z bromocyjanem i wiązani liga udu białkowego (P. Cuatrecasas i wsp. 1968: Proc. Nat. Acad. Sci. USA. M 636 643)
Zasada: Dokładny mechanizm tej reakcji nie jest znany. Uważa się, że w reakcji bromocyjanu z grupami wodorotlenowymi reszt cukrowych agarozy tworzą i\ cykliczne i niecykliczne ugrupowania karboimidowe. Te grupy aktywne są nietrwało w środowisku wodnym, więc powstałych pochodnych należy natychmiast użyć do
hi lula 4.12. Zestawienie złóż najczęściej stosowanych w chroniutourHfll |>owlnowaclwu (wg katalogów Amersham Pharmacia Biotcch ora/. Bio-Rad na 1999 r.)
l.p. |
Swoistość w stosunku do ligandu |
Nit/w u handlowa /loża |
I |
Region Ft immunoglobulin G. umożliwia frakcjonowanie podklas IgG |
Protein A Sepharose CL-4B Protein A Sepharose 4FF Protein A Sepharose 6MB Protein G Sepharose 4B Protein G Sepharose 4FF Protein G Sepharose CL-6B Affi-Gel protein A Affi-Prep protein A |
2 |
a-D-mannoza. a-t>-glukoza i strukturalnie podobne cząsteczki |
Lcntil Lcctin Sepharose 4B Con A Sepharose 4B Affi-Gel 600 |
3 |
iV-acctylo-D-glukozamina. a-2-makroglobulina, ccruloplazmina, polimer haptoglobina hemoglobina |
Wheat Germ Lcctin Sepharose 6MB |
4 |
Eukariotyczny mRNA Dehydrogenazy zależne od NADP Dehydrogenazy zależne od NAD Polimeraza DNA, polimeraza RNA, białka wiążące DNA. nukleotydy poli(A) i poli(U), białka wiążące RNA, interferon, mRNA i rybosomy |
7-Mcthyl-GTP Sepharose 4B 2'5'-ADP Sepharose 4B 5'-AMP Sepharose 4B DNA-Agarosc (/denaturowany DNA) DNA-Cellulosc (natywny DNA) 01igo(dT)-Cellulose Poly(U)-Scpharosc 4B Po!y(A)-Scpharose 4B AGPoly-(I)- Poly(C) Typc 6 AGPoly(U) Typc 6 |
5 |
Rybosomowy RNA, podwójna nić DNA. plazminogcn, aktywator plazminogenu |
Łysinę Sepharose 4B |
6 |
Enzymy zależne od nukleotydów, albumina i inne białka |
Blue Sepharose CL-6B Affi-Gel blue |
7 |
Proteazy, albuminy |
DEAE Affi-Gel blue CM Affi-Gel blue |
8 |
Endoksyny |
Affi-Prep polymyxin |
9 |
Czynniki wzrostu, czynniki krzepnięcia, lipoprotciny, proteazy |
Heparin Sepharose CL-6B Affi-Gel Heparin |
10 |
Białko A i białko G oraz ich koniugaty |
IgG Sepharose 6FF |
II |
Fibroncktyna |
Gelatin Sepharose 4B |
12 |
Białka oddziałujące z kalmoduliną, neurotransmitery, kinazy białkowe |
Calmodulin Sepharose 4B |
13 |
Białka zależne od glutationu, S-transferazy |
Glutathionc Sepharose 4B |
14 |
Proteazy serynowc |
Bcnzamidinc Sepharose 6B Arginine Sepharose 4B |
151