Bakterie dzieli się na trzy podstawowe kształty:
1. Bakterie o kształcie kulistym:
- ziarenkowce
- gronkowce
- paciorkowce
- dwoinki
- pakietowce
2. Bakterie o kształcie laseczkowatym:
- pałeczki
- laseczki
3. Bakterie o kształcie spiralnym:
- śrubowce
- przecinkowce
- krętki