290 Ro/D/IAł 18
Genotypy |
Częstość stanu równowagi |
Częstość rzeczywista |
AA |
0,12 |
0,06 |
Aa |
0,46 |
0,58 |
aa |
0,42 |
0,36 |
Suma |
1,00 |
1,00 |
Badana populacja nie jest w stanie równowagi genetycznej, ponieważ częstości odpowiadające stanowi równowagi nie są zgodne z częstościami obserwowanymi.
Uwaga!
Przeprowadzając badanie populacji, możemy policzyć osobniki o określonym fenotypie czy genotypie, dysponując tymi danymi liczbowymi, musimy sami wyliczyć ich częstości. Częstość genotypu wyraża stosunek danego genotypu do ogólnej ilości genotypów, np. mamy populację liczącą 1000 osobników w tym AA - 350; Aa - 550; aa - 100.
Częstość genotypu AA: fAJ = 350/1000 = 0,35 (identycznie obliczamy pozostałe częstości).
Do określenia, czy istnieje duże odchylenie od równowagi Hardy'ego-Wein-berga w populacji wykorzystujemy test zgodności %2.
(fo-f.)2
f,
f - częstość obserwowana f - częstość teoretyczna
Liczba stopni swobody wynosi n-1, gdzie n oznacza liczbę rozpatrywanych klas. Powróćmy do naszego przykładu:
Genotypy |
f O |
f, |
(fo-f,)2 |
(fo-f,)2 f, |
AA |
0,06 |
0,12 |
0,0036 |
0,03 |
Aa |
0,58 |
0,46 |
0,0144 |
0,0313 |
aa |
0,36 |
0,42 |
0,0036 |
0,0086 |
Suma |
1,00 |
1,00 |
X2 = 0,0699 |
Z tabeli yj odczytujemy*, że wartość = 0,0699 przy dwu stopniach swobody wskazuje na zgodność w granicach 95%, czyli prawdopodobieństwo, że ba-
* Tabelę %2 zamieszczono w: B. Piątkowska, G. Dąbrowska, A. Goc, Zbiór zadań i pytań z genetyki, cz. 1: Genetyka ogólna, Wyd. UMK, Toruń 1998, s. 114.
dana populacja wykazuje odchylenie od równowagi Hardyego-Weinberga wynosi 5%.
Mała wartość %2 wskazuje na małe odchylenie (dużą zgodność) z częstościami spodziewanymi, duża wartość %2 świadczy o dużym odchyleniu (małej zgodności).
Różnice w sposobach ustalania częstości alleli w populacji zależą od:
- sposobu dziedziczenie się alleli (dominacja całkowita lub niecałkowita),
- lokalizacji genów (autosomy czy chromosomy płci),
- liczby alleli danego genu (tylko 2 lub więcej alleli),
- stanu populacji (zrównoważona czy niezrównoważona).
Analizując strukturę genetyczną populacji, zawsze powinniśmy wybierać taki sposób analizy, aby uzyskać wynik obarczony jak najmniejszym błędem.
Matematyczne ustalenie, czy populacja jest w równowadze Hardy'ego-We i u berga jest możliwe tylko wówczas, gdy znamy liczebność każdego z możliwych genotypów.
W przypadku całkowitej dominacji jednego genu nad drugim fenotypy homozy-got dominujących i heterozygot są identyczne. Obliczanie częstości zarówno alleli, jak i genotypów jest w takiej sytuacji utrudnione, dlatego nasze obliczenia opieramy wyłącznie na częstości homozygot recesywnych, gdyż z całą pewnością wiemy, że mają one tylko jeden rodzaj alleli.
Pamiętamy, że w populacji zrównoważonej frekwencja homozygot resesywnych
zaś p = 1 - q
W stadzie 1000 krów kojarzących się losowo naliczono 910 czarnych i 90 czerwonych (C - barwa czarna, c - barwa czerwona). Krowy czarne mają dwa różne genotypy CC lub Cc, a krowy czerwone cc. Częstość genotypu recesywne-go wynosi 90/1000 = 0,09. Ponieważ populacja spełnia warunki populacji zrównoważonej:
częstość allelu c : q = 0,09 = 0,3
częstość allelu C : p = 1 - 0,3 = 0,7.