47
W strukturze p wiązania wodorowe powstają między wiązaniami peptydowymi różnych łańcuchów polipeptydowych lub różnych części tego samego łańcucha polipeptydowego. Płaskie wiązanie peptydowe sprawia, że łańcuch polipeptydowy przyjmuje postać pofałdowanej kartki (harmonijki) z łańcuchami bocznymi aminokwasów znajdującymi się powyżej lub poniżej jej płaszczyzny.
CH
H
N
R O
I II
CH N C
H
CH- N-C
wiązanie
wodorowe
H 1 1 |
R |
0 1 1 i |
H 1 ł j |
R |
0 I 1 i | |
>1 1 1 0 |
i 1 1 H |
R |
9 1 1 0 |
i 1 1 H | ||
i |
II | |||||
V O —O 1 |
i —o =n i |
-N — |
CH |
—C—N- |
CH C |
-N |
H R O
H R O
r o
I II
CH N C
Rys. 33. Fałdowanie się łańcucha polipeptydowego w strukturę p.
A - wiązania wodorowe między dwoma częściami łańcucha polipeptydowego;
B - widok z boku na łańcuch pofałdowany w strukturę p.
Łańcuchy polipeptydowe sąsiadujące ze sobą w strukturze p mogą być równoległe lub antyrównoległe, zależnie od tego, czy przebiegają one odpowiednio: w tym samym kierunku lub w kierunku przeciwnym.
1 1 1 1 |
-1 L ! równoległa 1 | |||
- |
antyrównoległa KI |
Rys. 34. Polarność łańcucha polipeptydowego