Bad. mikroskopowe - na podstawie cech morfologicznych nie można odróżnić patogennych E. histolytica od niepatogennych E. dispar
• 3 x badanie kału co 2 -3 dni
• w kale płynnym trofozoity zawierające lawinki czerwone, w kale uformowanym cysty
• Decydują badania izoenzymatyczne i molekularne (PCR)