• Średnica zewnętrzna: 2nm
• Średnica wewnętrzna (między sparowanymi zasadami): lnm
• Duża bruzda i mała bruzda oddziałują z białkami, zwłaszcza duża bruzda umożliwia łatwiejszy dostęp do zasad azotowych (łatwiejszy dostęp czynników wiążących się z DNA)
DNA- program genetyczny dla 2 podstawowych funkcji:
1) samopowielanie- replikowanie
2) produkcja różnych komponentów komórkowych potrzebnych do wzrostu, rozwoju i rozmnażania
• generowanie zmian genetycznych
Informacja genetyczna u bakterii występuje w formie chromosomalnego DNA, który występuje w 1 kopii, ewentualnie w 2 (zaraz po replikacji, ale przed cytokinezą).
Wiele bakterii posiada nie zintegrowany z chromosomem dodatkowy DNA- minichromosom (plazmid).
Informacja genetyczna w plazmidach jest istotna dla funkcjonowania, nadaje określone cechy fenotypowe, ułatwia przeżycie. W przeciwieństwie do cliromosomu plazmidy nie są niezbędne do życia.
U większości Procaryota występuje chromosom kolisty, natomiast u Eukariota chromosom liniowy.
U Procaryota można sztucznie in vitro uzyskać formę liniową. Również sztucznie można uzyskać zrelaksowaną formę DNA, ale w żywych komórkach nić DNA jest zawsze superskręcona.
Stopień skręcenia jest różny, zależy np. od stanu fizjologicznego komórki i warunków środowiska.
Okrągłe DNA:
L= 20 liczba sprzężeń, liczba skrętów helikalnych w DNA w stanie zrelaksowanym T= 20 aktualna liczba sprzężeń, różne czynniki zewnętrzne powodują zmianę liczby skrętów helikalnych. Te czynniki to: temperatura, stężenie jonów, obecność czynników łączących się z DNA, stopień hydratacji.
W= 0 liczba superskretów
zakładamy, że ten plazmid ma 210 pz, podwójna prawoskrętna helisa. 210/10,5=20 skrętów DNA.
L= T+W— W= L-T L= T, więc W= 0
Negatywnie superskręcony DNA:
L= 20 T= 21
W= -1, W<0 kiedy liczba skrętów helikalnych ulega zwiększeniu na skutek różnych czynników
Pozytywnie superskręcony DNA:
L= 20 T= 19
W= +1, W>0 kiedy liczba skrętów helikalnych ulega zmniejszeniu
Superskręcenie dotyczy nie tylko plazmidów, ale i cliromosomów.