Udowodnienie, że alfR jest genem regulatorowym:
• Porównano ekspresję genów w typie dzikim i z delecją aflR A. parasiticus z zastosowaniem mikromacierzy (5002 elementów)
O Brak ekspresji (w przypadku 2 genów - aflR koniecznie potrzebny) lub jej spadek większości genów w szczepie w delaflR. co oznacza, że aflR jest niezbędne do ich transkrypcji - oznaczone jako strzałka w dół
o 6 genów ma niezależną regulację (nc - nie ma wpływu) ekspresja regulowana w inny sposób niż aflR
5.2 aflS:
• geny aflR i aflS leżą blisko siebie, ale są transkrybowane w przeciwną stronę i mają niezależne promotory
• mogą jednak mieć wspólne miejsca wiążące dla czynników transkrypcyjnych lub innych elementów regulatorowych
Rola aflS nie jest jednoznaczna:
• U szczepów z delecją aflS powstają produkty pośrednie, ale nie są przekształcane do AF
• U A. parasiticus AflS wiąże się z AflR i jest niezbędne do jego aktywacji (do aktywacji białka AflS).
3 najważniejsze funkcje białek AflS i AflR:
1. AflR jest niezbędny do inicjacji transkrypcji na wczesnych, pośrednich i późnych etapach szlaku biosyntezy AF
2. AflS nasila transkrypcję genów na wczesnych i środkowych etapach syntezy (pomoc w transporcie produktów pośrednich?)
3. Ponieważ AflS wiąże się z AflR sugeruje, że AflS moduluje ekspresję AF poprzez interakcję z AflR.
W niekorzystnych warunkach środowiskowych
O 37 stC,
O obecność laktozy, o obecność azotanów o pH 8.0
• ekspresja aflR i aflS nie zawsze wyraźnie się różni od warunków permisywnych (nc = no changes)
Regulacja ekspresji genów klastra AF jest skomplikowana Transkrypt aflS jest zalezny od aflR
5.3 Inne mechanizmy regulacji klastra AF:
• Istnieje tzw. Namrallyoccuring Antisensetranscript (NAT) - ekspresja 1 z NAT jest odwracalnie skorelowana z ekspresją genu aflD. Wyższa ekspresja NAT dla aflD jest powiązana z niższą produkcją AF.
• Wewnątrz klastra istnieją miejsca wiążące dla innych czynników transkrypcyjnych, które mogą być ważne w regulacji transkrypcji klastra AF
• Nowy element cAM P- zależny - CRE1 (A. parasiticus).
Kontrola zewnętrzna klastra aflatoksyny - globalna regulacja metabolizmu w tórnego
1. Przekazywanie sygnału przez heterotrimeryczne białko G i PKA
2. Przekazywanie sygnału przez cAMP
3. Przekazywanie sygnału przez Ras i GTPazę
4. Rearanżacja (remodeling) chromatyny