> wiązania wodorowe
Mechanizm katalizy enzymatycznej
1. Zetknięcie cząsteczek substratów z powierzchnią cząsteczek enzymów.
2 Oddziaływanie elektrostatyczne S i E prowadzące do powstania wzbudzonej, formy kompleksu ES.
3. Zajście reakcji enzymatycznej - kompleks ES ulega przekształceniu w enzym - produkt.
4. Uwalnia się produkt i wolny enzym.
Budowa centmm katalitycznego (aktywnego)
> Miejsce wiązania substratu - grupy pomocnicze (kontaktowe)
> Miejsce katalityczne - grupa katalityczna
Modele CA
> Wg Fischera - „klucz i zamek"
> Wg Koshlanda - „ręka i rękawiczka"
Kataliza enzymatyczna Substrai —» produkt (spadek energii)
Wolna energia (G) - opisuję potencjalną energię (zmiana w reakcji z enzymem)
Np. biosynteza - wymaga energii Energia aktywacji - obniżana przez enzymy
Bariera energetyczna (szczyt - energia stanu przejściowego)(zmiana kształtu)
Substrat wpływa na różnicę energii pomiędzy substratem i produktem
Czynniki wpływające na aktywność enzymu
r Temperatura (niewielki wzrost 1-2°C powoduje wzrost szybkości reakcji aż do momentu denaturacji) r Stężenie jonów wodorowych (odstępstwa od pH naturalnego —> zmiany w CA —> spowolnienie reakcji)
> Potencjał oksydo-redukcyjny (np. -SH)
> Modulatory (w zależności od rodzaju inhibitora np. leki. trucizny i inne substancje egzogenne)
Enzymy allosteryczne mają CA i centrum regulatorowe (CR). Przyłączają aktywatory i modulatory.
Np. ATP i AMP - fosforylacja lub defosforylacja aminokwasu w CA KINETYKA ENZYMATYCZNA
Zajmuje się zagadnieniami związanymi z szybkością i mechanizmem reakcji
Szybkość reakcji mierzymy zmianą stężenia C reagujących substancji (substrat lub produkt) w jednostce czasu t.
Stała szybkości reakcji (stała proporcjonalności k) - zależy od rodzaju reakcji chemicznej, warunków jej przebiegu i jest charakterystyczna dla danej temperatury Liczbowo równa jest szybkości takiej reakcji, w której stężenie wszystkich reagujących substancji są równe 1 moll Jest wyznaczana doświadczalnie.
Reakcja wyrażona ogólnym wzorem stechiometrycznym
oraz równaniem kinetycznym
Klasyfikacja kinetyczna reakcji chemicznych
Rząd reakcji - suma wykładników potęgowanych ze stężenia reagentów. Wykładniki dobierane są doświadczalnie i nie