3) transkrypcja i translacja niekoniecznie czasowo rozdzielone
4) syntezy wszystkich rodzajów RNA dokonuje 1 polimeraza RNA zależna od DNA* (RNAP) zbudowana z 5 podjednostek:
-2 podjednostki a - składanie enzymu - odpowiada za funkcjonalnośd enzymu;
-0 - podjednostka katalityczna - odpowiada za
procesywnośd enzymu i stabilnośd kompleksu
-0* - odpowiada za wiązanie matrycy DNA z enzymem i
stabilnośd kompleksu
-oj - utrzymywanie aktywności enzymu
-o - odpowiada za rozpoznawanie określonego,
konkretnego promotora i wiązanie z nim polimerazy
5)rozpoznawany przez podjednostkę o polimerazy bakteryjnej region promotorowy poprzedza sekwencję kodującą od strony 5'; polimeraza RNA łączy się z promotorem bezpośrednio
6) terminator - sekwencja w RNA „zatrzymująca" polimerazę; może leżeć za genami transkrybowanymi lub zaraz za promotorem, a nawet wewnątrz genu - wówczas reguluje poziom ekspresji genu
7) lnicjacja - rozpoznanie sekwencji promotora (sekwencja -35**, tzw. ramka Pribnowa) i rozcinanie par zasad (sekwencja -10; obie sekwencje są bogate w pary AT; znajdują się po tej samej stronie podwójnej helisy, co umożliwia ich jednoczesne oddziaływanie z podjednostką polimerazy RNA) przez polimerazę RNA i przyłączenie enzymu do promotora;
Promotor w operonie bakteryjnym - seria ok. 50 par nukleotydowych bezpośrednio przylegających do miejsca inicjacji transkrypcji, po jego proksymalnej stronie
a)Powstanie zamkniętego kompleksu promotorowego (in. kompleksu preinicjacyjnego - odcinek DNA stanowiący promotor w postaci dsDNA)
3) TRANSKRYPCJA I TRANSLACJA CZASOWO ROZDZIELONE!!!!!!!!!!
4) bogactwo klas i form polimeraz RNA oraz współdziałających z nimi białek pomocniczych.
Polimerazy zbudowane są 8-12 podjednostek. Zawierają dwie duże podjednostki: RPB1 i RBB2 odpowiadające prokariotycznym podjednostkom 0 i 0‘. Podobnie jak polimerazy prokariotyczne, nie posiadają aktywności nukleazowej. Jądro komórkowe zawiera 3 typy polimeraz RNA: polimerazy klasy I (oznaczane też jako A), klasy II (B) i klasy III (C).
o Do genów klasy I, transkrybowanych przez polimerazę I RNA należą sekwencje kodujące 18S, 5.8S i 28S rRNA rybosomów cytopłazmatycznych; o Polimeraza II katalizuje transkrypcję genów mRNA oraz niektórych snRNA;
o Polimeraza III transkrybuje geny tRNA, 5S rRNA, wirusowe RNA i małe cytoplazmatyczne RNA (scRNA)
Sjregion promotorowy poprzedza sekwencję kodującą od strony 5‘ lub jest wewnątrz niej (promotor wewnętrzny); rozpoznawany przez czynniki transkrypcyjne; polimeraza RNA łączy się z platformą utworzoną przez białka wiążące DNA;
każda z 3 polimeraz RNA rozpoznaje różne sekwencje promotorowe;
region regulatorowy składa się z 3 rodzajów elementów genetycznych o odrębnych sekwencjach regulatorowych jeden z tych elementów, położony w pobliżu regionu kodującego, działa podobnie jak promotor bakteryjny, jest to tzw. promotor rdzeniowy (podstawowy), od niego polimeraza RNA rozpoczyna transkrypcję
6) sekwencje terminatorowe są różne dla różnych klas polimerazy
7) Budowę promotora polimerazy I cechują raptowne i wielokrotnie powtarzające się przejścia od sekwencji bardzo bogatych w pary GC do sekwencji złożonych z par AT.
Region promotora podstawowego polimerazy II zawiera sekwencję podobną do ramki Pribnowa i wyprzedza miejsce inicjacji o ok. 25 pz. Jest to tzw. „sekwencja TATA". Drugi segment promotora podstawowego stanowi sekwencja inicjatorowa - Inr.
III Najpierw z promotorem łączą się czynniki transkrypcyjne, jak TFIID (in. GTF) (P. pyt 10) - i to zarówno w przypadku polimerazy RNA I, II, jak i III. Promotor genów kłasy III jest złożony z 2 odległych od siebie sekwencji nukleotydowych. Region promotorowy dla tych genów stanowi część sekwencji kodującej