Omówić właściwości alfa~helisy i struktury pofałdowanej.
Cechy a-helisy białkowej
• strukturę a-helisy stabilizują wiązania wodorowe utworzone pomiędzy atomem H grupy -NH- i atomem grupy karbonylowej
• każde wiązanie peptydowe łańcucha uczestniczy w formowaniu wiązania wodorowego co zapewnia tej strukturze maksimum trwałości (1 do 4; 3.6 reszt aminokwasowych)
• prawoskrętna a-helisa jest bardziej stabilna niż lewoskrętna
• a-helisa powstaje spontanicznie, ponieważ jest konformacją najbardziej stabilną dla łańcucha polipeptydowego
Struktura harmonijkowa
• Wiązania wodorowe łączą leżące obok siebie równoległe lub antyrównoległe łańcuchy polipeptydowe
• Białko o strukturze beta może być traktowane jako układ sztywnych płaszczyzn ustawionych względem siebie pod pewnym kątem.
• Strukturę tę mają fibroina, beta-keratyna
• W tworzeniu struktury beta uczestniczą zazwyczaj dwa lub więcej łańcuchów białkowych.
Zwrot B
W miejscu występowania zwrotu b obserwuje się zmianę kierunku łańcucha o 180 stopni.
Częstym powodem zagięcia łańcucha jest obecność proliny.