Dwunciowe DNA
Kolonie
I lin komórek I (chloroform)
Przeciwciała przyczepione do zlzowartych komórek zawierających
-Ca-
• Hybrydyzacja heterologiczna w obrębie gatunku ma na celu zbadanie podobieństw w obrębie rodzin tych samych białek.
Szukamy ostatniej sytuacji...
Mamy sondę, która tylko częściowo hybrydyzuje z sekwencją docelową. Podobieństwo białek należących do rodziny nigdy nie jest 100%.
Te same aminokwasy - DNA może się różnić. Doświadczenia te doprowadziły do wielu odkryć rodzin, np. kinaz, białek homeolycznych.
Hybryda dwóch związanych ze sobą nld ONA
Parowanie wystarczające do uformowania stabilnej struktury
• przypadek w którym nie dysponujemy informacją na temat sekwencji DNA, czy białek. W tym celu musimy dysponować pizeciwciałami do określonych białek oraz 1211 taką. w której
klony podlegają ekspresji.
Wjaki sposób otrzymujemy bibliotekę ekspresyjną?
Potrzebujemy wektory, które posiadają promotor aktywny w komórce bakteryjnej. Pod jego kontrolą znajdują się inserty. Otrzymuje się cDNA. Następnie biblioteka ta jest ligowana z wektorem ekspresyjnym. Oczywiście mamy przeróżne fragmenty DNA, ale niektóre cDNA pod kontrolą promotora bakteryjnego ulegają ekspresji takiej, źc dają produkt polipeptydowy. Istotą znalezienia sekwencji kodującej jest odnalezienie klonu, w którym ta ekspresja zachodzi
IAtUch sttcłcy ends, igJte
Jedyna różnica między biblioteką eksresyjną, a zwykłą jest ni i li miliw
Przeszukiwanie za pomocą przeciwciał:
Immunoscreening
1 Dodanie specyficznych przeciwciał
Białko A - zaznakowane izotopem jodu, pochodzenie bakteryjne, bardzo silnie wiąże immunoglobuliny.
Fagcmid - wektor, który zawiera fragmenty i faga i plazmidu.
ampidlin cecha nadająca oporność na ampicilinę ori - miejsce z wektora pUC P lac - promotor, który jest pochodną promotora z operonu laktozowego (promotor aktywny w komórce bakteryjnej)
lac Z’ zatem może służyć do selekcji biało niebieskiej MCS - sekwencja wielokrotnego klonowania (zawiera również promotory polimerazy T2 i T3).