Działalność Instytutu prowadzona jest przez specjalistyczne zakłady badawcze i wspomagające je inne jednostki organizacyjne Instytutu.
ZASTĘPCA NACZELNEGO DYREKTORA DS. BADAŃ I WDROŻEŃ
ZAKŁAD OCHRONY POWIERZCHNI I OBIEKTÓW BUDOWLANYCH ZAKŁAD AEROLOGII GÓRNICZEJ
ZAKŁAD TECHNOLOGII EKSPLOATACJI I OBUDÓW GÓRNICZYCH ZAKŁAD GEOLOGII I GEOFIZYKI ZAKŁAD BADAŃ URZĄDZEŃ MECHANICZNYCH ZAKŁAD AKUSTYKI TECHNICZNEJ I TECHNIKI LASEROWE
ŚLĄSKIE CENTRUM RADIOMETRII ŚRODOWISKOWEJ IM. MARII GOEPPERT MAYER ZAKŁAD TĄPAŃ I MECHANIKI GÓROTWORU
ZAKŁAD ZARZĄDZANIA BEZPIECZEŃSTWEM PRACY I ZAGROŻEŃ TECHNICZNYCH