antybiotyków jonoforowych pozbawione są możliwości kontroli nad wymianą składników z otoczeniem. Walinomycyna koordynacyjnie wiąże jon K+ z 6 atomami tlenu reszt walin centralnej przestrzeni cząsteczki i jako nośnik przenosi je na drugą stronę błony.
• Gramicydyna S jest cyklicznym dziesięciopeptydem, w strukturze którego występują 2 reszty D-fenyloalaniny.
• Gramicydyna A jest również polipepetydowym antybiotykiem jonoforowym, zbudowanym z 15 naprzemiennie występujących reszt L- i D-aminokwasowych, który na N-końcu posiada grupę formylową. Przyjmuje strukturę |i-helisy. Poprzez N-formylowe końce dwa takie polipeptydy łączą się, tworząc dimeryczny, funkcjonalny kanał jonowy dla kationów jednowartościowych, np. Na+, lecz nie dla dwu wartościowych. Kanał ten spontanicznie otwiera się i zamyka, przepuszczając w ciągu sekundy ponad 107 kationów. Por tego kanału wyścielony jest polarnymi grupami karboksylowymi peptydu, a hydrofobowe łańcuchy boczne ustawione są na obwodzie kanału. Ułożenie to umożliwiają zestawione naprzemiennie reszty L i D-aminokwasowe.
OHC-NH- (L)-Val-Gly - (L)-Ala - (D)-Leu - (L)-Ala - (D)-Val -(l>Val - (D>Val-|- (L)-Trp - (D>Leu-)3- (L)-Trp -CO-NH-CH2-CH2-OH gramicydyna A
3. Białka
a) klasyfikacja
• Ze względu na kształt cząsteczki i rozpuszczalność w wodzie białka dzieli się na:
> globularne - o współczynnikach osiowych < 3-4, a więc w przybliżeniu kuliste, dobrze rozp. w wodzie,
> fibrylarne - o współczynnikach osiowych > 10 (kształt wydłużony), nierozpuszczalne w wodzie.
• Ze względu na stan skupienia dzieli się białka na: stałe (kolagen, elastyna), półpłynne (cytoplazmatyczne) oraz płynne (białka osocza).
• Ze względu na budowę cząsteczki - obecność dodatkowych składników - na:
> białka proste (proteiny) - zbudowane wyłącznie z aa i nie posiadające dodatkowych elementów, m. in.: albuminy, globuliny, histony, protaminy, skleroproteiny,
> białka złożone (proteidy) - zawierające dodatkowe składniki niebiałkowe, np. cząsteczki węglowodanów (glikoproteiny), lipidów (lipoproteiny), resztę kwasu fosforowego (fosfoproteiny), atom metalu (metaloproteiny), cząsteczkę barwnika (chromoproteiny) lub związane z kwasem nukleinowym (nukleoproteiny).
• Ze względu na pełnione w organizmie funkcje:
> enzymatyczne - np. dehydrogenaza mleczanowa (LDH), transaminaza asparaginianowa (AspAT), cyklooksygenaza (COX),
> hormonalne - np. hormony przedniego płata przysadki (GH, PRL, ACTH, TSH, FSH, LH), hormony trzustki (insulina, glukagon), parathormon (PTH),
> strukturalne - np. kolagen, elastyna, keratyna,
> transportowe - np. transferryna, hemoglobina (HGB), ceruloplazmina (CER), transkobalamina (TC),
> zapasowe - np. mioglobina, ferrytyna,
> odpornościowe - np. immunoglobuliny, białka układu dopełniacza (C), białka ostrej fazy,
> kurczliwe lub pośrednio biorące udział w ruchu - np. aktyna, miozyna, tropomiozyna, troponina,
> toksyny - np. tężcowa (tetanospazmina i tetanolizyna), botulinowa, toksyna cholery.
• Białka pokarmowe dzieli się ze względu na przydatność dla organizmu na: pełnowartościowe -zawierające aa egzogenne oraz niepełnowartościowe - złożone z aa endogennych.