widmo masowe identyfikowanej substancji z widmami masowymi znajdującymi się w komercyjnej bibliotece wirtualnej komputera.
Podstawowa zaleta układu GC/MS polega na tym, że nie wymaga on wydzielania i oczyszczania komponentów mieszaniny w celu ich identyfikacji, gdyż fundamentalne informacje uzyskuje się z ich widm masowych, otrzymywanych w trakcie elucji tych składników z kolumny chromatograficznej. Samo widmo dostarcza wielu jednoznacznych informacji o budowie badanych związków, przede wszystkim umożliwiając określenie masy cząsteczkowej każdego składnika mieszaniny na podstawie stosunku m/z jonu molekularnego, jak również pozwalając na identyfikację pewnych charakterystycznych grup funkcyjnych związków organicznych pochodzących z odszczepienia niewielkich fragmentów od jonu molekularnego. Inne jony obecne w widmie można uszeregować w pewnej kolejności, wynikającej z tzw. dróg fragmentacji, czyli sekwencji reakcji fragmentacji jonu macierzystego, które są charakterystyczne dla określonych grup związków. Analiza ilościowa w metodzie GC/MS ma drugorzędne znaczenie, choć jest także możliwa. Wykorzystuje się ją najczęściej do oznaczeń śladowych zawartości pojedynczych substancji w złożonych mieszaninach.
Metoda GC/MS jest najefektywniejszą metodą oznaczenia śladowych ilości lotnych związków organicznych w złożonych matrycach naturalnych. Wykorzystuje się ją do badania substancji o złożonej budowie, takich jak np. składniki tkanek i płynów ustrojowych organizmów żywych, leki i ich metabolity, a także do rozwiązywania problemów z zakresu analizy zanieczyszczeń i ochrony środowiska naturalnego (np. do oznaczania pozostałości pestycydów w środkach spożywczych, w glebie i w wodzie). Oprócz tego metoda GC/MS jest stosowana w petrochemii, kosmetyce, biochemii, czy chemii klinicznej, a układ GC/MS oddaje nieocenione usługi w przypadku opracowywania rutynowych analiz dla potrzeb przemysłu. Jednorazowe określenie jakościowego składu mieszaniny surowców lub produktów pochodzących z danej syntezy organicznej daje możliwość wykonywania seryjnych ilościowych analiz tych mieszanin już przy użyciu chromatografu z prostszym, klasycznym detektorem, gdyż zwykle skład jakościowy tego typu mieszanin nie ulega zmianom [41, 47-51].
38