3240962990

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L

⁼ Mj “ł" ^ ^ Pjl*U "ł" £»ji»

1=1

ou les valeurs du SNP l xu sont dans {0,1,2} pour Z = 1,..., L, est la moyenne generale des individus pour le phenotype j, est 1’efFet du marąueur l sur le carac-tere j et £ij est un bruit que Ton suppose gaussien. Sous formę matricielle, le modele peut s’ecrire comme :

Ynxq ⁼ -^nx(L+l)^(L-H)xę ~ł~ £nxq)    (3-1)

ou X est la matrice de design decrivant les marąueurs avec 1’ordonnee a 1’origine. La nouvelle approche PCH_g, comme celle de Klei, cherche a reduire la dimension de la matrice des phenotypes Y par la specification d’un nouveau caractere y* avec maximum d’heritabilite. L’heritabilite s’exprime ainsi par

= argmax w

WE_GW WEW *

ou

E_g = Var(0^TX) = /3^TE_x/3,

avec E_g est la matrice de variances-covariances des L SNPs. On redefinit 1’algorithme de l’analyse en composantes principales d^łheritabilite pour inclure les effets joints des marąueurs comme suit Algorithme de 1’approche PCH_g (3.1).

—    Definir la matrice des phenotypes Y_nxp et la matrice X_nx^i₊i).

—    Estimer les parametres du modele /?.