[9] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND 4H
B + La ^ BLab
+ |
+ |
L„ |
Lb |
Kb U |
Kba U K |
BLb + La ^ BLbLa
gdzie L oznacza ligand związany z podłożem chromatograficznym, L —
ligand wolny, K — stałe asocjacji kompleksów rozpuszczalnych, K — stałe asocjacji dla kompleksów unieruchomionych. Objętość wypływu białka V oblicza się z równania:
(Vq - VP) (Ka [La] + KbKba [L„] [La]}
1 + Kb [Lb]
(równanie 8)
gdzie Vp — oznacza pustą objętość kolumny, V0 — objętość wypływu w razie braku oddziaływania białka z ligandami.
W opisanych układach ligand związany z żelem oraz ligand wolny to całkowicie różne substancje. Większość zastosowań praktycznych oparto jednak na zjawisku kompetycji między ligandem rozpuszczalnym a unieruchomionym ligandem o podobnej naturze chemicznej. W najprostszym przypadku białka mono walencyjnego rozważa się zatem dwie równowagi:
K
B + L ^ BL
K
B + L ^ BL
W obecności ligandu rozpuszczalnego w stężeniu [L] białko jest wymywane z kolumny w objętości V, określonej równaniem (69):
1 _ (1+K[B]> K[L]
V-V0 f-1(V0-Vp) K. [L] f_1(V0-VP)K[L] (rownanie 9)
gdzie f oznacza frakcję fazy nieruchomej dostępną dla białka a znaczenie pozostałych symboli podano w opisie równania 8. Parametry wiązania odczytuje się z wykresu -—— ([L]). Objętość wypływu białka V można
wyznaczyć metodą ciągłego wymywania (69—72), w której roztwory o stałych stężeniach białka wprowadza się w sposób ciągły na kolumnę do chwili otrzymania dobrze wykształconych frontów elucji, wykorzystywanych do obliczania stałych wiązania. Opisano wariant metodyczny, w którym oznacza się nie objętość elucji lecz ilość związanego białka (73). Wadą wszystkich metod wymywania ciągłego jest stosunkowo duże zużycie białka.
Inny sposób wyznaczania objętości V polega na zrównoważeniu ko-