W 23.04
Interferencja RNA - kompleksy enzymatyczne są niszczone
Regulacja postranskrypcyjna
-składanie mRNA
splicing Sharp dostał Nobla za snRNA występują w kompleksach z białkami (snRP) i służą jako podpórka gdy pęknie egzon - intron; tworzy strukturę, by ligaza połączyła egzony ze sobą
Alternatywne składanie mRNA... nie zawsze
Tom Cech (nobel 1989)- wykrył, że są przypadki w genie rRNA jest intron, który się sam wycina; self-splicing samoskładanie RNA; atak nukleofilowy, bez udziału enzymów.Sklonował ten gen na RNA E.Coli bo u prokariota nie ma intronów, i te introny były wycinane. Wycinanie intronów to relikt prehistoryczny
- rybozymy - enzymy z RNA
Edytowanie RNA
gotowa cząsteczka nie koduje białka i zyskuje sensowny zapis kiedy dodane są głównie uryny i powstaje białko o innym składzie aminokwasowym
guide RNA - naprowadzające RNA u Trypanosoma zmienność białek
u wyższych organizmów edytowanie mRNA apolipoproteiny B
kodon CAA może być zmieniony na UAA (stop) powstanie krótsze białko
edytowanie zachodzi tylko w jelitach a w wątrobie powstaje normalne białko
Modyfikacje białek
dołączenie ubikwityny
acetylacja
metylacja
małe białka działąją i łacza się - sumoilacja powstają z określonymi białkami
ubikwitynowane białko jest sumoilowane i to białko jest likwidowane przez proteazy (SUMOilacja)
białka chaperoniny - ochraniają białka przed degradajcą procesy zachodzące na poziomie białka
wyciszanie genów
Wirusy onkogeniczne u zwierząt poznano dużo wcześniej niż u człowieka
-wirus RSV - mięsak - komórki rakowe dzielą się w sposób niekontrolowany i nie mają inhibicji konaktowej; powstaje ognisko komórek nowotworowych; bezładny podział (guzy); powstają naczynia oplatające guzy, bo muszą być one odżywione
linie komórek 3T3 - mysie fibroblasty - łątwo ulegają transformacji nowotworowej; można na nich sprawdzać czy coś jest rakotwórcze czy nie
wprowadzanie do badań nagich myszy - mają słąby system immunologiczny; łatwiej zapadjaa na choroby nowotworowe; komórki nowotworowe mają antygeny i system obronny (limfocyty) rozpoznają ją i niszczą
z wiekiem układ odpornościowy słabnie i nie niszczy kom. rakowych
nagim myszom wstrzykuje się coś i sprawdza czy coś jest rakotwórcze
p 53 - supresor nowotworowy wirusy onkogeniczne
z DNA na RNA
DNA - sr40,adenowirusy, herpes i papiloma (rak szyjki macicy) w pewnym czasie po infekcji transformacja komórek nowotworowych trudne do wyleczenia
Ludzie który przeszli żółtaczkę mają większą szansę na zachorowanie na żółtaczkę
Sr40
wirus nerki małpiej
DNA
2 antygeny T - późny i T-wczesny; onkogenne
powoduje zniszczenie komórek nerki małpiej,a u człowieka nie niszczy ale powoduje transformację nowotworową
Adenowirus
2 geny (E1a i E1b) z których powstają transkrypty i białka powodują transformacje używane jako wektory w terapii genowej
DNA- wirus; może przetrwać w komórce w formie DNA razem z genem, który wszczepiony (leczenie SCIT)
Retrowirus
materiałem jest RNA i są najważniejszą grupą wirusów onkogenicznych
ma 2 otoczki : zewnętrzną i wewnętrzną (z białek błony komórkowej gospodarza - zewnętrzna i wewnętrzna z białek kodowanych przez gen gag ) w środku 2 kopie RNA; odwrotna transkryptaza - potrafi przepisać informację z RNA na DNA (enzym) przepisuje swoje RNA na DNA
Drzewo filogenetyczne retrowirusów
odwrotna transkryptaza RNADNARNA
powtarzają się sekwencje ppt, U3 i U 5 na końcach
starter RNA wozi się w wirusie
starter przeskakuje na drugą nić powstaje 2- niciowe DNA zintegrowane z chromosomem gospodarza
odwrotna transkryptaza - Baltimore ja wyizolował i dostal Nobla ; ważne narzędzie
Genom retrowirusa
geny gag
- pol - polimeraza - gen na nią
env - gen na otoczkę wewnętrzną
LTR - długie terminalne powtórzenia na końcach by cząsteczka mogła się integrować z DNA gospodarza
transpozony - ruchome elementy genetyczne
retrowirusy też są ruchomymi elementami (retrotranspozony) w genomach organizmów wyższych
H.E. Varmus - Nobel za pochodzenie wirusowych onkogenów. Retrowirusy to łągodne onkogeny i mogą przechodzić w formy ostre.