Końcowy etap utleniania węglowodanów, aminokwasów i kwasów
tłuszczowych, ściśle powiązany z łańcuchem oddechowym. Zachodzi
wyłącznie w warunkach tlenowych.
CYKL KREBSA
CYKL KREBSA
LOKALIZACJA –
matrix mitochondrium
FUNKCJE
• rozkłada acetyloCoA
powstający podczas
katabolizmu
węglowodanów,
lipidów, białek
• dostarcza
równoważników
redukcyjnych –
NADH+H
+
i FADH
2
zamienianych na ATP
w ŁO oraz GTP (=ATP)
• dostarcza substratów
do procesów syntezy
różnych związków (np.
glukozy, hemu,
kwasów tłuszczowych)
AcetyloCoA
Fumaran
CO
2
CO
2
GTP
NAD
+
NAD
+
NAD
+
FAD
3 NADH + H
+
FADH
2
fosforylacja oksydacyjna
AA
AA
Glukoza
Cytrynian
Izocytrynian
α
ketoglutaran
BursztynyloCoA
Bursztynian
Jabłczan
Szczawiooctan
AA
ŁAŃCUCH ODDECHOWY
1.
Reduktaza NADH/CoQ
FMN, Fe-S
2.
koenzym Q
1.
Reduktaza cytochromowa
cytochrom b – hem b
cytochrom c
1
– hem c
1
Fe-S
4.
Cytochrom c (hem c)
1.
Oksydaza cytochromowa
hem a
1
z Fe
+3
, Cu
+2
,
hem a
3
z Fe
+3
, Cu
+2
,
6.
tlen
1.
Dehydrogenaza
bursztynianowa
FAD, Fe-S
1
1
7
7
2
2
3
3
4
4
5
5
6
6
ŁAŃCUCH ODDECHOWY
Jabłczan (dehydrogenaza jabłczanowa)
Jabłczan (dehydrogenaza jabłczanowa)
Izocytrynian (dehydrogenaza izocytrynianowa)
Izocytrynian (dehydrogenaza izocytrynianowa)
Glutaminian (dehydrogenaza glutaminianowa)
Glutaminian (dehydrogenaza glutaminianowa)
β
β
-hydroksyacyloCoA (dehydrogenaza
-hydroksyacyloCoA (dehydrogenaza
β
β
-hydroksyacyloCoA)
-hydroksyacyloCoA)
β
β
-hydroksymaślan (dehydrogenaza
-hydroksymaślan (dehydrogenaza
β
β
-hydroksymaślanowa)
-hydroksymaślanowa)
dihydroliponian (dehydrogenaza dihydroliponianowa)
dihydroliponian (dehydrogenaza dihydroliponianowa)
ŁAŃCUCH ODDECHOWY
Glicerolo-3-fosforan (dehydrogenaza glicerolo-3-fosforanowa)
Glicerolo-3-fosforan (dehydrogenaza glicerolo-3-fosforanowa)
AcyloCoA (dehydrogenaza acyloCoA)
AcyloCoA (dehydrogenaza acyloCoA)
SYNTAZA ATP
SYNTAZA ATP
ADP + P
ADP + P
i
i
ATP + H
ATP + H
2
2
O
O
Proces syntezy ATP zachodzący w wyniku
Proces syntezy ATP zachodzący w wyniku
przeniesienia elektronów z NADH i FADH
przeniesienia elektronów z NADH i FADH
2
2
na
na
O
O
2
2
przez szereg przenośników elektronów
przez szereg przenośników elektronów
(łańcuch oddechowy) nazywa się
(łańcuch oddechowy) nazywa się
FOSFORYLACJĄ OKSYDACYJNĄ.
FOSFORYLACJĄ OKSYDACYJNĄ.
Produktem końcowym ŁO jest H
Produktem końcowym ŁO jest H
2
2
O
O
2 H
2 H
2
2
+ O
+ O
2
2
H
H
2
2
O
O
martiks
martiks
Pirogronian
Pirogronian
FOSFORYLACJA SUBSTRATOWA
Fosforylacja substratowa
jest to synteza ATP z wykorzystaniem
energii zawartej w niektórych związkach wysokoenergetycznych.
• reszty fosforanowe 3 związków (fosfoenolopirogronian, 1,3-
bisfosfoglicerynian, fosfokreatyna) mają energię wiązania
wystarczającą by mogły zostać przeniesione na ADP.
X ~ P + ADP Y + ATP
• rozpad wiązania w związku wysokoenergetycznym
(bursztynyloCoA) wyzwala energię wystarczającą do syntezy ATP z
ADP i P
i
X ~ P + GTP + P
i
Y + GTP
GTP + ADP GDP + ATP
ŹRÓDŁA ACETYLOCoA
cukry proste
(glukoza)
acetyloCoA
aminokwasy
kwasy tłuszczowe
+ glicerol
białka
tłuszcze
węglowodany
pirogronian
O
//
CH
3
─ C ~ SCoA
lipoliza
deaminacja,
oksydacja
β
-oksydacja
glikoliza
glikogenoliza
proteoliza
oksydacyjna
dekarboksylacja
trawienie
trawienie
ciała ketonowe
aminokwasy
OKSYDACYJNA DEKARBOKSYLACJA
α
-KETOKWASÓW
COO
-
|
C = O
|
CH
3
COO
-
|
C = O
|
CH
2
|
CH
2
|
COO
-
COO
-
|
C = O
|
CH
2
|
CH
3
COO
-
|
CH
2
|
C = O
|
CH
3
PIROGRONIAN
α
-KETOGLUTARAN
α
-KETOMASLAN
ACETOOCTAN
α
- ketokwasy
β
- ketokwas
OKSYDACYJNA
DEKARBOKSYLACJA
PIROGRONIANU
enzym
dekarboksylującylub
dehydrogenaza
pirogronianowa
witamina B
1
,
TPP
acetylotransferaza
dihydroliponianowa
kwas liponowy,
lipoamid,
B
5
,
HSCoA
dehydrogenaza
dihydroliponianowa
B
2
,
FAD,
PP,
NAD
+
pirogronian + NAD
+
+ HSCoA
acetyloCoA + NADH+H
+
+ CO
2
KOMPLEKS
DEHYDROGENAZY
PIROGRONIANOWEJ
FADH
2
+ NAD
+
→
FAD + NADH + H
+
WITAMINY i KOENZYMY BIORĄCE UDZIAŁ W
OKSYDACYJNEJ DEKARBOKSYLACJI
α
-
KETOKWASÓW
• TPP (pirofosforan
tiaminy
witamina B
1
, tiamina
• lipoamid
kwas liponowy, wit B
7
• koenzym A
B
5
, kwas pantotenowy
• FAD
B
2
, ryboflawina
• NAD
B
3
, PP, niacyna
TTP
Lipoamid
Kompleks wieloenzymatyczny
– dehydrogenaza
α
-ketokwasów (3 typy)
O
||
R ─ C ─ COO
-
FAD
NAD
+
NADH+H
+
zredukowany
lipoamid
SH
L
SH
utleniony lipoamid
S
L
S
FADH
2
hydroksyetyloTPP
OH
|
R ─ C ─ TPP
CO
2
HSCoA
O
||
R ─ C ~ CoA
acetylo-
lipoamid
TPP
1
2
3
dehydrogenaza
pirogronianowa
acetylotransferaza
dihydroliponianowa
dehydrogenaza
dihydro-
liponianowa
REGULACJA DEHYDROGENAZY PIROGRONIANOWEJ
• AcetyloCoA i NADH+H
+
są również allosterycznymi inhibitorami
nieufosforylowanej (aktywnej) formy dehydrogenazy
pirogronianowej.
kompleks
dehydrogenazy
pirogronianowej
AKTYWNA
─
P
─
AcetyloCoA
NADH
Pirogronian
kompleks
dehydrogenazy
pirogronianowej
NIEAKTYWNA
+
+
kinaza białkowa
HSCoA
pirogronian
NAD
+
ATP
acetyloCoA
NADH
ATP
ADP
Ca
2+
fosfataza białkowa
H
2
O
P
i
REAKCJE CYKLU KREBSA
COO
-
|
C = O
|
CH
2
|
COO
-
COO
-
|
CH
2
|
HO ─ C ─ COO
-
|
CH
2
|
COO
-
COO
-
|
CH
2
|
HO ─ C ─ COO
-
|
CH
2
|
C = O
|
SCoA
O
//
CH
3
─ C ~ SCoA
HSCoA
Enzym:
SYNTAZA CYTRYNIANOWA
SYNTAZA CYTRYNIANOWA
klasa IV (liazy)
klasa IV (liazy)
Typ reakcji:
KONDENSACJA
KONDENSACJA
reakcja nieodwracalna
reakcja nieodwracalna
enzym regulatorowy
enzym regulatorowy
+ H
2
O
1
REAKCJE CYKLU KREBSA
COO
-
|
CH
2
|
C ─ COO
-
||
CH
|
COO
-
Enzym:
AKONITAZA (HYDRATAZA
AKONITAZA (HYDRATAZA
cisAKONITANOWA)
cisAKONITANOWA)
klasa IV (liazy)
klasa IV (liazy)
Typ reakcji:
DEHYDRATACJA/HYDRATACJA
DEHYDRATACJA/HYDRATACJA
reakcja odwracalna
reakcja odwracalna
białko zawierajace Fe-S
białko zawierajace Fe-S
+ H
2
O
- H
2
O
COO
-
|
CH
2
|
HO ─ C ─ COO
-
|
CH
2
|
COO
-
COO
-
|
CH
2
|
HC ─ COO
-
|
HO ─ CH
|
COO
-
2
2
REAKCJE CYKLU KREBSA
Enzym:
DEHYDROGENAZA
DEHYDROGENAZA
IZOCYTRYNIANOWA
IZOCYTRYNIANOWA
klasa I (oksydoreduktazy)
klasa I (oksydoreduktazy)
Typ reakcji:
UTLENIANIE i DEKARBOKSYLACJA
UTLENIANIE i DEKARBOKSYLACJA
reakcja nieodwracalna
reakcja nieodwracalna
izoenzymy
izoenzymy
enzym regulatorowy
enzym regulatorowy
COO
-
|
CH
2
|
HC ─ COO
-
|
HO ─ CH
|
COO
-
COO
-
|
CH
2
|
HC ─
COO
-
|
O =
CH
|
COO
-
COO
-
|
CH
2
|
CH
2
|
O = CH
|
COO
-
CO
2
NAD
+
NADH+H
+
3
REAKCJE CYKLU KREBSA
Enzym:
KOMPLEKS DEHYDROGENAZY
KOMPLEKS DEHYDROGENAZY
α
α
-KETOGLUTARANOWEJ
-KETOGLUTARANOWEJ
klasa I (oksydoreduktazy)
klasa I (oksydoreduktazy)
Typ reakcji:
UTLENIANIE i DEKARBOKSYLACJA
UTLENIANIE i DEKARBOKSYLACJA
reakcja nieodwracalna
reakcja nieodwracalna
enzym regulatorowy
enzym regulatorowy
COO
-
|
CH
2
|
CH
2
|
C ~ SCoA
||
O
COO
-
|
CH
2
|
CH
2
|
O = CH
|
COO
-
CO
2
NAD
+
, HSCoA
NADH+H
+
4
REAKCJE CYKLU KREBSA
Enzym:
SYNTETAZA BURSZTYNYLOCoA
SYNTETAZA BURSZTYNYLOCoA
klasa VI (syntetazy)
klasa VI (syntetazy)
Typ reakcji:
FOSFORYLACJA SUBSTRATOWA
FOSFORYLACJA SUBSTRATOWA
reakcja odwracalna
reakcja odwracalna
COO
-
|
CH
2
|
CH
2
|
C ~ SCoA
||
O
GDP + P
i
GTP
HSCoA
COO
-
|
CH
2
|
CH
2
|
COO
-
5
REAKCJE CYKLU KREBSA
Enzym:
DEHYDROGENAZA
DEHYDROGENAZA
BURSZTYNIANOWA
BURSZTYNIANOWA
klasa I (oksydoreduktazy)
klasa I (oksydoreduktazy)
Typ reakcji:
UTLENIANIE
UTLENIANIE
jest częścią błony mitochondrialnej
jest częścią błony mitochondrialnej
reakcja odwracalna
reakcja odwracalna
białko zawierające Fe-S
białko zawierające Fe-S
FAD
FADH
2
COO
-
|
CH
2
|
CH
2
|
COO
-
COO
-
|
CH
||
CH
|
COO
-
6
REAKCJE CYKLU KREBSA
Enzym:
HYDRATAZA FUMARANOWA
HYDRATAZA FUMARANOWA
(FUMARAZA)
(FUMARAZA)
klasa IV (liazy)
klasa IV (liazy)
Typ reakcji:
HYDRATACJA
HYDRATACJA
reakcja odwracalna
reakcja odwracalna
H
2
O
COO
-
|
HC ─ OH
|
CH
2
|
COO
-
COO
-
|
CH
||
CH
|
COO
-
7
REAKCJE CYKLU KREBSA
Enzym:
DEHYDROGENAZA
DEHYDROGENAZA
JABŁCZANOWA
JABŁCZANOWA
klasa I (oksydoreduktazy)
klasa I (oksydoreduktazy)
Typ reakcji:
UTLENIANIE
UTLENIANIE
reakcja odwracalna
reakcja odwracalna
NAD
+
NADH+H
+
COO
-
|
HC ─ OH
|
CH
2
|
COO
-
COO
-
|
C = O
|
CH
2
|
COO
-
8
BILANS ENERGETYCZNY CYKLU KREBSA
• 3 NADH + H
+
×
3 ATP = 9
ATP
• 1 FADH
2
×
2 ATP = 2
ATP
• 1 GTP (FS) = 1 ATP = 1
ATP
=
12 ATP
z jednej cząsteczki acetyloCoA
GTP + ADP
GTP + ADP
↔
↔
GDP + ATP
GDP + ATP
enzym: kinaza difosfonukleozydowa
enzym: kinaza difosfonukleozydowa
REGULACJA CYKLU KREBSA
1.
SYNTAZA CYTRYNIANOWA
- enzym allosteryczny
(+) Ca
2+
, ADP
(─) ATP, NADH, acyloCoA,
bursztynyloCoA
2.
DEHYDROGENAZA
IZOCYTRYNIANOWA
- enzym allosteryczny
(+) ADP, Ca
2+
(─) ATP, NADH
3.
DEHYDROGENAZA
α
KETOGLUTARANOWA
- aktywny nieufosforylowany
(+) Ca
2+
(─) ATP, GTP, NADH,
bursztynyloCoA
1
1
2
2
3
3
INHIBITORY:
fluorooctan
- hamuje akonitazę
malonian
- inhibitor kompetycyjny
dehydrogenazy bursztynianowej
arszenik
- hamuje enzymy współdziałające z
kwasem liponowym – kompleksy
katalizujące oksydacyjną
dekarboksylację pirogronianu i
α
-
ketoglutaranu
POWIĄZANIA CYKLU KREBSA Z INNYMI SZLAKAMI
METABOLICZNYMI
Niektóre szlaki metaboliczne kończą się na metabolicie cyklu Krebsa a
niektóre wywodzą się z tego cyklu. Szczególne znaczenie odgrywa w wątrobie
gdzie nazywany jest „cyklem otwartym”: w czasie sytości (
↑
węglowodanów)
przeważa udział cyklu w procesie lipogenezy, w tworzeniu aminokwasów, w
czasie głodu (
↓
węglowodanów) w procesie glukoneogenezy. Prawie
wszystkie metabolity cyklu Krebsa są potencjalnie glukogenne (najbardziej
szczawiooctan), ponadto niektóre aminokwasy są glukogenne dzięki
możliwości przekształcenia ich w metabolit cyklu Krebsa lub w pirogronian.
Cykl Krebsa powiązany jest z następującymi przemianami:
glukoneogeneza (ze szczawiooctanu, pirogronianu, aminokwasów)
synteza niektórych aminokwasów
synteza hemu
synteza ciał ketonowych
synteza kwasów tłuszczowych
synteza neurotransmiterów (mózg)
cykl mocznikowy
POWIĄZANIA CYKLU KREBSA Z INNYMI SZLAKAMI
METABOLICZNYMI
Pirogronian
Pirogronian
AcetyloCoA
AcetyloCoA
Cytrynian
Cytrynian
α
α
-ketoglutaran
-ketoglutaran
bursztynyloCoA
bursztynyloCoA
fumaran
fumaran
szczawiooctan
szczawiooctan
Synteza kwasów
Synteza kwasów
tłuszczowych,
tłuszczowych,
Regulator
Regulator
metabolizmu
metabolizmu
węglowodanów
węglowodanów
Aminokwasy
Aminokwasy
Neurotransmitery
Neurotransmitery
Synteza hemu,
Synteza hemu,
porfiryny
porfiryny
Glukoza
Glukoza
Aminokwasy
Aminokwasy
Cykl mocznikowy
Cykl mocznikowy
POWIĄZANIA CYKLU KREBSA Z CYKLEM
MOCZNIKOWYM
Liaza arginino-
bursztynianowa
Szczawiooctan
Szczawiooctan
Jabłczan
Jabłczan
Fumaran
Fumaran
Asparaginian
Asparaginian
α
α
-ketokwas
-ketokwas
amino
amino
kwas
kwas
Karbamoilofosforan
Karbamoilofosforan
Ornityna
Ornityna
mocznik
mocznik
Cytrulina
Cytrulina
Arginino-
Arginino-
bursztynian
bursztynian
Arginina
Arginina
CK
CK
REAKCJE ANAPLEROTYCZNE CYKLU KREBSA
Reakcje w których powstają metabolity cyklu, nie będące
reakcjami cyklu. Usunięcie któregokolwiek metabolitu
powoduje spadek ilości szczawiooctanu potrzebnego do
kondensacji z acetyloCoA.
1.
1.
COO
COO
-
-
|
|
C = O
C = O
|
|
CH
CH
3
3
CO
CO
2
2
, ATP
, ATP
ADP, P
ADP, P
i
i
COO
COO
-
-
|
|
C = O
C = O
|
|
CH
CH
2
2
|
|
COO
COO
-
-
biotyna (wit.H), Mg
biotyna (wit.H), Mg
2+
2+
ENZYM
ENZYM
KARBOKSYLAZA
KARBOKSYLAZA
PIROGRONIANOWA
PIROGRONIANOWA
(+) acetyloCoA
(+) acetyloCoA
(
(
─) acyloCoA
─) acyloCoA
największa aktywność w wątrobie
największa aktywność w wątrobie
ze względu na glukoneogenezę
ze względu na glukoneogenezę
Brak lub niedostatek karboksylazy
Brak lub niedostatek karboksylazy
pirogronianowej
prowadzi
do
pirogronianowej
prowadzi
do
kwasicy mleczanowej, uszkodzeń
kwasicy mleczanowej, uszkodzeń
mózgu i śmierci podobnie jak brak
mózgu i śmierci podobnie jak brak
dehydrogenazy pirogronianowej.
dehydrogenazy pirogronianowej.
Dodatkowo brak syntezy glukozy z
Dodatkowo brak syntezy glukozy z
alaniny, seryny, mleczanu
alaniny, seryny, mleczanu
REAKCJE ANAPLEROTYCZNE CYKLU KREBSA
2
2
. Przekształcanie alaniny w metabolit cyklu Krebsa przy udziale
. Przekształcanie alaniny w metabolit cyklu Krebsa przy udziale
aminotransferazy.
aminotransferazy.
COO
COO
-
-
|
|
HC ─ NH
HC ─ NH
2
2
|
|
CH
CH
2
2
|
|
CH
CH
2
2
|
|
COO
COO
-
-
+
+
COO
COO
-
-
|
|
C = O
C = O
|
|
CH
CH
3
3
COO
COO
-
-
|
|
C = O
C = O
|
|
CH
CH
2
2
|
|
CH
CH
2
2
|
|
COO
COO
-
-
COO
COO
-
-
|
|
HC ─ NH
HC ─ NH
2
2
|
|
CH
CH
3
3
+
+
AMINOTRANSFERAZA
AMINOTRANSFERAZA
ALANINOWA
ALANINOWA
REAKCJE ANAPLEROTYCZNE CYKLU KREBSA cd.
3.
Karboksykinaza fosfoenolopirogronianowa
PEP + GDP
Szczawioctan
+ CO
2
+ GTP
4.
mutaza metylomalonyloCoA
5.
liaza argininobursztynianowa
arginina
fumaran
+ mocznik
metylomalonyloCoA
metylomalonyloCoA bursztynyloCoA
bursztynyloCoA