TERMINACJA TRANSLACJI
Kodony terminacji translacji (stop)
• UAG – amber
• UAA – orche
• UGA – opal
Częstość użycia kodonów w E.coli
UAA>UGA>UAG
Czynniki terminacji translacji (Release Factors)
klasy I
RF1-
bakteryjny czynnik rozpoznający kodony UAA i UAG
RF2 -
bakteryjny czynnik rozpoznający kodony UAA i UGA
eRF1 – eukariotyczny czynnik terminacji translacji
klasy II
RF3 – bakteryjny czynnik podobny to EF-G. Uwalnia on
czynniki RF1 i RF2 związane z rybosomem. GTPaza
eRF3 –
eukariotyczny czynnik uwalniający peptydylo-tRNA.
GTPaza.
Budowa czynników RF1 i RF2
Korostelev i wsp., 2008, PNAS, 105, 19684-19689
W funkcjonowaniu czynników RF ważną rolę odgrywa rRNA oraz białko L11
Kutner, 2007, Postępy Biochemii, 53, 420-430
Budowa eRF1
Song i wsp, 2000, Cell, 100, 311-321
Kilka czynników wiąże się w miejscu A rybosomu
Podobieństwo eRF1 i tRNA
Mechanizm terminacji translacji
Mechanizm terminacji translacji u Prokariota
Kutner, 2007, Postępy Biochemii, 53, 420-430
RRF- ribosome recycling
factor. Uwalania mRNA,
tRNA, podjednostki 30S i
50S
Rola czynnika RRF
Mechanizm terminacji translacji u Eukariota
Kutner, 2007, Postępy Biochemii, 53, 420-430
Polirybosomy (polisomy)