18.03.2009, wykład nr 4., - Organella komórkowe skała chemiczny, budowa,
podstawowe funkcje, siateczka, endoplazmatyczne, rybosomy, układ
Golgiego, mitochondrium
Siateczka endoplazmatyczna.
ER – Endoplasmatic reticulum
RER - siateczka endoplazmatyczna szorstka
SER - siateczka endoplazmatyczna gładka
–
odkryta w latach 40-tych XX wieku przez Claude’a i Portera przy pomocy mikroskopu elektronowego
–
zobaczyli oni złożony, trójwymiarowy system błon elementarnych tworzących kanaliki, cysterny i
wakuole
–
cysterny siateczki są pokryte od zewnątrz rybosomami
–
zbudowana jest z omofilnych błon o grubości 5-6 nm, zawierających specyficzne białka (ryboforyna
odpowiadająca za przyłączanie rybosomów)
–
głównym jej zadaniem jest synteza i modyfikacja bielak eksportowych
–
ryboforyna łączy się z siateczką podjednostki większej
–
syntetyzowane przez nie białko jest magazynowane w kanalikach siateczki w pęcherzykach
przesuwnikowych, które następnie wędrują do aparatów Golgiego
–
zawiera więcej białek (enzymatycznych i strukturalnych) niż plazmolemma, mniejsze ilości lipidów,
niewielką ilość cholesterolu i jego estrów oraz głównie nienasycone kwasy tłuszczowe
–
wzajemny stosunek siateczki ziarnistej (RER) i gładkiej (SER) jest zmienny i zależny od rodzaju
procesów metabolicznych zachodzących w komórce
–
rozbudowa RER jest obserwowana w komórkach syntetyzujących białko, przeznaczone do wydalenia
przez komórkę i spożytkowania poza jej terenem
–
występuje we wszystkich komórkach eukariotycznych za wyjątkiem dojrzewających erytrocytów
ssaków
–
w obrębie tej samej komórki ER występuje w różnych postaciach: pęcherzyki, wakuole, cysterny,
rureczki, (30-300 nm)
–
ich ściana ma 3 warstwy, SER ma wyższy poziom cholesterolu
–
na rybosomach ER są syntetyzowane białka je budujące
–
składniki lipidowe ER są tworzone w ścianach całej siateczki, niezależnie od jej podziału na RER i SER
–
na terenie ER zachodzą procesy oksydo-redukcyjne, także procesy detoksykacji z udziałem cytochromu
P450
–
RER – cysterny tej siateczki pokryte są rybosomami od zewnątrz, główną rolą jest synteza i
modyfikacja białek ektotropowych
–
SER – tworzy rozgałęzioną sieć kanalików, bierze udział przede wszystkim w tworzeniu lipidów
–
w błonie siateczki śródplazmatycznej mają większą zawartość fosfolipidów niż błona komórkowa,
zawierają mniej cholesterolu i sfingomieliny, brak również warstwy glikoprotein
–
w błonie siateczki gładkiej stwierdza się wyższy poziom cholesterolu
–
uczestniczy w syntezie i magazynowanie potrzebnych do życia składników
–
stanowi podporę dla substancji koloidalnych cytoplazmy podstawowej
–
przyjmuje określoną formę morfologiczną w zależności od rodzaju komórek
–
włókna mięśniowe – siateczka tworzy charakterystyczny układ wokół sarkomerów
–
włókna nerwowe – występują ziarnistości, jądra blisko w postaci rozetowato ułożonych cystern,
tworzących tzw. tigroid znane też jako ciałka Nissla, ziarenka Nissla
Siateczka endoplazmatyczna gładka.
–
t
worzy połączenia z siateczka ziarnistą
–
rożni się od niej budową i funkcją
–
zaangażowana w syntezę kwasów tłuszczowych, cholesterolu i steroidów
–
bierze udział w detoksykacji szkodliwych metabolitów i ksenobiotyków
–
występują cytochromy P450 – powodują:
1
–
hydroksylację
–
dealkilacje
–
utlenianie azotu ksenobiotyków
–
przypuszcza się ze uczestniczy w procesie glikogenolizy, syntetyzuje i gromadzi tłuszcze obojętne, a
także triglicerydy
–
jest miejscem syntezy obu warstw lipidowych błony komórkowej
–
we włóknach mięśniowych jest dobrze rozwinięta (tzw. system kanalików T)
Dynamika przemian siateczki endoplazmatycznej szorstkiej.
–
w przebiegu mitozy RER ulega fragmentacji w stopniu zróżnicowanym w różnych typach komórek
–
w komórkach z dużym nasileniem fragmentacji RER rozpada się na pęcherzyki o zmiennej średnicy
0,3-1,0 μm
–
hipoteza zakłada, że powstałe z fragmentacji pęcherzyki nieodejmujące funkcje w mitozie, służą także
jako zbiornik Ca
2+
niezbędnego w regulowaniu funkcji wrzeciona kariokinetycznego
Rybosomy.
–
odkryte w 1953 przez Robinsona w komórkach fasoli, a później także w komórkach zwierzęcych
–
są to struktury nieobłonione
–
u eukariontów podjednostki rybosomowe powstałe w jadrze przez asocjacje świeżo zsyntetyzowanego
rRNA z białkami rybosomowymi (powstałymi w cytoplazmie i przetransportowanymi do jadra)
–
obecne nie tylko w cytoplazmie podstawowej, ale także w organellach cytoplazmatycznych i w jąderku
–
występują jako wolne rybosomy (biologicznie nieaktywne – 10%) oraz jako związane z ER lub
polirybosomy (aktywne biologicznie – 90%) – polirybosomy są powiązane z mRNA
–
w zależności od lokalizacji wytwarzają one określone białka:
–
wolne polirybosomy – białka komórkowe
–
polirybosomy związane – białka sekrecyjne, np.:
–
kolagen
–
immunoglobuliny
–
hormony
–
w komórkach tych występuje intensywny proces syntezy białka np. komórki plazmatyczne trzustki,
wątroby zawierają 75% rybosomów w postaci polirybosomów związanych z siateczka
–
rybosomy eukariotyczne i prokariotyczne są podobne pod względem budowy i funkcji
–
w skład obu rodzajów wchodzi duża i mała podjednostka – tworzą one kompletny rybosom o masie kilu
milionów daltonów
–
mniejsza podjednostka jest spłaszczona i można ja porównać do czapeczki nałożonej na podjednostka
większa – dopasowuje one cząsteczki tRNA do kodonów mRNA
–
tylko duża podjednostka łączy się z błonami siateczki śródplazmatycznej – katalizuje ona powstawanie
wiązań peptydowych
–
spoistość podjednostek uwarunkowana jest obecnością jonów magnezowych (brak ich prowadzi do
rozpadu podjednostek rybosomu)
–
przy rozpoczęciu syntezy białka, obie podjednostki łączą się ze sobą obejmując mRNA zwykle w
pobliżu jego końca 5'
–
cząsteczki tRNA dopasowują odpowiednie aminokwasy (antykodony) do kodonów znajdujących się na
mRNA
–
kodon rozpoczynający translację to AUG kodon metioniny
–
Rodzaje RNA wytwarzanego w komórkach:
–
mRNA – kodują białka
–
rRNA – stanowi część struktury i uczestniczy w syntezie białka
–
tRNA - przyłączanie wolnych aminokwasów w cytoplazmie i transportowanie ich do rybosomów
–
pojedynczy rybosom w ciągu 1 sekundy w komórce eukariotycznej przyłącza 2 aminokwasy a w
komórce prokariotycznej około 20 aminokwasów
–
podczas syntezy aminokwasy są łączone w określonej kolejności w polipeptydy przy udziale rRNA,
mRNA
–
każdy rybosom składa się z dwóch podjednostek
–
w zależności od lokalizacji rybosomy wytwarzają określone białka, wolne polirybosomy syntetyzują
białka komórkowe a polirybosomy związane z RER – białka sekrecyjne np. kolagen
2
–
w procesie tworzenia rybosomów biorą udział 4 kwasy nukleinowe i 80 różnych białek, a proces
wymaga współdziałania około 100 genów zasadowych i szeregu o charakterze molekularnym
–
w dużej podjednostce rybosomu występuje 48 białek a w małej 33
–
RNA zawarty w rybosomie stanowi 75-90% całości RNA w komórce
–
mRNA ma zakodowaną informację w postaci trójki nukleotydów – tzw. kodon
–
cząsteczki tRNA dopasowują odpowiednie aminokwasy do kodonów na mRNA
–
kodon rozpoczynający translację to AUG, a powodujące jej zakończenie to kodony UAA, UAG, UGA
–
białka wchodzące w skład rybosomów są białkami heterogennymi - większość z nich stanowi białka
kwaśne, niewielka ilość to zasadowe i obojętne - na ogol znajdują się na powierzchni rybosomu
–
występują lipidy i węglowodany w ilościach śladowych
–
rybosom zawiera także enzym RNA-zę w postaci nieaktywnej oraz kationy Mg
2+
Ca
2+
–
w rRNA oprócz typowych dla RNA zasad jak adenina, guanina, uracyl i cytozyna występują również
zasady mające zemtylowane grupy OH lub NH
2
–
w 2000 roku - ustalenie pełnej struktury przestrzennej dużej i malej podjednostki, która potwierdziła, że
to rRNA a nie białka decydują o:
–
o całościowej strukturze rybosomów
–
zdolności umieszczania aminokwasów na mRNA
Aparat Golgiego.
–
odkrył go Golgi w 1981 roku
–
podstawowa jednostka to diktiosom
–
diktiosom (część aparatu Golgiego) składa się z 5-8 spłaszczonych cystern
–
ułożonych względem siebie równolegle z zachowaniem odległość 20-30 nm
–
liczne nagromadzone pęcherzyki - 30-50 nm
–
duże wakuole o średnicy 500-3000 nm zawierające materiał bezstrukturalny lub ziarnisty
–
posiada kształt półksiężycowaty po stronie wypuklej znajduje się powierzchnia formowania (cis), a po
stronie wklęsłej powierzchnia dojrzewania (trans)
–
w pobliżu powierzchni dojrzewania (trans) obserwuje się wakuole zagęszczające o średnicy 500 – 3000
nm oraz mniejszy pęcherzyk okryte
–
w sąsiedztwie powierzchni formowania (cis) znajdują się pęcherzyki o średnicy 30-50 nm zwane
pęcherzykami transportującymi
–
pod względem struktury i składu chemicznego błona aparatu Golgiego stanowi element przejściowy
między błoną siateczki endoplazmatycznej ziarnistej, a błoną komórkową
–
w obrębie aparatu Golgiego zachodzi synteza glikoprotein pokrywających powierzchnie komórek
zwierzęcych, a w komórkach roślinnych, synteza pektyn oraz hemicelulozy
–
bierze on udział w wydalaniu produktów komórek wydzielniczych (wydzielina zostaje zagęszczona i
opakowana w błony)
–
na jego powierzchni formowania występują enzymy charakterystyczne dla siateczki endoplazmatycznej
(między innymi glukozo-6-fosfataza, oksydoreduktazy, NADH, NADPH)
–
na powierzchni dojrzewania występują enzymy markerowe błony komórkowej (ATP-azy, 5-
nukleotydaza, Mg
2+
-zależne, 5-nukleaza i inne)
–
skład chemiczny błon cystern układu Golgiego jest zróżnicowany
Budowa chemiczna aparatu Golgiego.
–
we frakcjach aparatu Golgiego stwierdzono 60% białek i 40% lipidów
–
duża zawartość fosfoflipidów
–
sfingomieliny
–
chlesterol
–
estry cholesterolu
–
triglicerydy
–
enzymy jak:
–
pirofosfataza tiaminowa
–
glikozylotransferazy
–
fosfataza kwaśna
–
inne enzymy lizosomalne
3
Rola apratu golgiego.
–
zachodzi w nim synteza glikoprotein i glikopoprotein
–
uczestniczy w wydzielaniu białek i lipoprotein
–
powstają lizosomy pierwotne
–
uczestniczy w wewnątrzkomórkowej regulacji wodnej
–
zagęszczanie substancji np. proteoglikany
Zmiany morfologiczne i czynnościowe.
–
zmniejszenie liczby diktiosomów (temperatura powyżej 30 stopni Celsjusza i poniżej 0 stopni Celsjusza
)
–
rozproszenie aparatu Golgiego w komórce (pod wpływem kolchicyny i winkrystyny)
–
hamowanie aktywności glikozylotransferazy (pod wplywem puromycyny i cyklofosfamidu)
–
powiększenie aparatu Golgiego (pod wpływem hormonów – np. noradrenalina)
GERL (Golgi Endoplasmatic reticulolizosom complex)
–
Novikoff wysunął hipotezę, że jest to sąsiadujący z aparatem Golgiego fragment SER uczestniczący w
produkcji lizosomów
–
stanowi gładkościenną cysternę zlokalizowaną po stronie wewnętrznej aparatu Golgiego i przedłuża się
w system kanałów o szczególnym poligonalnym układzie
–
kryterium odróżniającym aparat Golgiego od GERL ma być reakcja na fosfatazy kwaśne przy \braku
reakcji na ATP-azę
–
ostatnio uważa się, że GERL może stanowić zmodyfikowaną cysternę aparatu Golgiego
Mitochondrium.
–
odkrył je Kolliker ok. 1888 w mięśniach skrzydeł owadów
–
opisane po raz pierwszy przez Fleminga w 1890, nazwano je dopiero w 1897 roku
–
mają zdolność do samopowielania
–
ilość ich jest zmienna i zależy od rodzaju komórek i ich stanu czynnościowego
–
kuliste lub podłużne (średnica 0,2 μm, długość 2-6 μm)
–
rozmieszczenie są w całej cytoplazmie lub zgrupowane w strefach zwiększonej czynności komórki
–
otoczone dwiema błonami lipoproteinowymi – zwykle o grubości 6-7nm, błona wewnętrzna 5-6 nm
–
uwypuklenia
–
wnętrze komórki wypełnia bezpostaciowa macierz (matrix)
–
pomiędzy błonami (matrix) znajduje się przestrzeń będąca siedliskiem białek i enzymów
–
w macierzy znajdują się wolne rybosomy i niewiele mitochondrialnego DNA oraz elektrono-gęste
ziarna tzw. ciałka mitochondrialne, w których gromadzą się różne jony
–
nieznaczna ilość DNA i 0,5 % RNA
–
zawiera pełen zestaw enzymów do przenoszenia uwolnionej energii z substratów na
wysokoenergetyczne związku fosforowe (ATP)
–
przeważają enzymy łańcucha oddechowego
–
oddychanie czyli transport elektronów odbywa się w błonie wewnętrznej
–
na błonie wewnętrznej są koliste cząsteczki oksydazy,które stanowią miejsce fosforylacji oksydacyjnej
–
błona wewnętrzna ulega charakterystycznym sfałdowaniom wytwarzając grzebienie
–
liczba grzebieni nie jest stała i może się zwiększać w przypadkach zwiększonej aktywności komórki
–
grzebienie:
–
blaszkowate
–
tubularne (rurkowate) – charakterystyczne głównie dla pierwotniaków, a u kręgowców
występują np. w komórkach nadnerczy czy w komórkach śródmiąższowych jądra
Błona wewnętrzna jest przepuszczalna dla kationów dwuwartościowych np. wapnia, który kumuluje się w
macierzy, a nie dla jonów jednowartościowych.
Znaczniki enzymatyczne.
–
znaczniki enzymatyczny błony zewnętrznej - monoamino oksydaza
–
znaczniki enzymatyczny błony wewnętrznej - dehydrogeneza kwasu bursztynowego
4
W macierzy występują elektronowo - gęste ziarna o średnicy ok 50 nm zwane ciałkami mitochondrialnymi, a w
nich nagromadzają się rożne jony, głównie dwudodatnie, przede wszystkim Ca
2+
.
Skład chemiczny.
–
60-70% to białka wśród nich białka strukturalne
–
część z nich tworzy kurczliwy kompleks aktynomiozynowy odpowiadający za ruch i kurczliwość
mitochondriów
–
45% to białka rozpuszczalne w wodzie tworzące tzw. łańcuch oddechowy
–
25-30 % lipidów, przy czym 90% frakcji lipidowej to fosfolipidy
–
występuje charakterystyczny dala mitochondrium lipid – kardiolipina (więcej w wewnętrznej błonie)
–
w błonie wewnętrznej występuje mniejsza zawartość inozytolu i cholesterolu niż w błonie zewnętrznej
(6-krotnie)
Mitochondrialny DNA (mtDNA).
–
pojedyncze mitochondrium zawiera najczęściej jedną cząsteczkę DNA
–
cząsteczka ta jest zlokalizowana w macierzy
–
cząsteczka ta ma łączność z błoną wewnętrzną
–
dwuniciowa
–
kolista
–
niezwiązana z histonami
–
może występować w kilku morfologicznych postaciach (kolistych i liniowych), które charakteryzuje
się stałymi sedymentacjami: 39S, 27S, 24S
–
mtDNA ma większą zawartość guaniny i cytozyny
–
w porównaniu z DNA jądrowym ma większą gęstość względną i bardzo szybki czas denaturacji
cieplnej
–
w mitochondriach stwierdzono obecność polimeraz DNA i RNA zależnych od DNA
–
transkrypcja mtDNA odbywa się równocześnie na dwóch niciach
–
stanowi własny system informacji genetycznej
–
umożliwia on samoodtwarzanie się mitochondrium
–
może on podlegać mutacjom, które mogą być przekazywana potomnym mitochondriom drogą
dziedziczenia cytoplazmatycznego (dziedziczone jest po matce)
–
mutacje mitochondrialnego DNA mogą wywoływać istotne zmiany w budowie białek błony jądrowej i
lizosomów
–
znacznej część mitochondrialnych białek enzymatycznych kodowana jest przez jądrowe DNA np.
wszystkie enzymy hydrofilowe występujące w macierzy mitochondrialnej.
Procesy mitochondrialnego matriks.
–
dekarboksylacja kwasu pirogronowego
–
cykl Krebsa
–
utlenianie kwasów tłuszczowych
–
cykl mocznikowy
Korelacja pomiędzy obrazem morfologicznym a stanem czynnościowym.
–
stan ortodoksyjny czyli wysokoenergetyczny – (komórka w stanie spoczynku):
–
duże nagromadzenie TAP
–
niewielka liczba grzebieni
–
nieznaczne wysycenie elektronowe macierzy
–
stan niskoenergetyczny (komórka prowadząca intensywne procesy metaboliczne):
–
maleje koncentracja ATP
–
zwiększa się ADP w mitochondrium
–
kondensacyjna forma mitochondriów (silnie wysycona macierz i duża ilość grzebieni
mitochondrialnych)
Mitochondria w komórkach o dużej aktywności metabolicznej.
–
komórki kory nadnerczy
–
komórki kanalików nerkowych
5
–
pobudzone limfocyty
–
hepatocyty
–
komórki mięśniowe
Schorzenia wywołane przez defekty w mitochondrialnym DNA – choroby powstające tą droga to między
innymi:
–
dziedziczna wzrokowa neuropatia
–
Zespół Kearnsa-Sayre'a (KSS)
–
padaczka mioklonalna
–
encefalopatia mitochondrialna z kwasicą mleczanową
–
mutacje mtDNA (towarzyszą cukrzycy oraz chorobom neurodegeneracyjnymi)
6