METODY OTRZYMYWANIA I
OCZYSZCZANIA PREPARATOW
WIRUSOWYCH
Dr n. wet Łukasz Adaszek
Wydź. Med. Wet. Lublin
Klinika Chorób Zakaźnych
By otrzymać preparat wirusologiczny,
pobrany materiał musi zostać
poddany całemu szeregowi zabiegów
mających na celu:
• usunięcie bakterii i grzybów
• ich enzymów i toksyn
• innych substancji inhibitujących
(egzonukleazy)
• Oczyszczanie i zagęszczanie prepartów
wirusowych nie jest najczęściej
procesem jednoetapowym.
• Bardzo trudno jest także otrzymać
zupełnie czysty preparat.
• Za kryterium czystości uznaje się
jednolity wygląd preparatu w
mikroskopie elektronowym lub brak
możliwości usunięcia zanieczyszczeń
bez zmniejszenia właściwości
zakaźnych oczyszczonych wirionów
Pierwszym etapem prowadzącym do
otrzymania czystego preparatu
wirusowego jest jałowe pobranie
materiału, a następnie poddanie go
działaniu:
• antybiotyków
• substancji bakteriostatycznych
• lub mechaniczne oczyszczanie( filtry,
wirowanie itp.)
• Dalsze postępowanie uzależnione
jest w jakim kierunku mają zmierzać
badania. Obecnie firmy obsługujące
laboratoria biologii molekularnej
oferują zestawy zawierające
odpowiednie enzymy i bufory tzw.
„kity” służące do izolacji wirusa z
odpowiedniego materiału, niekiedy
bardzo zanieczyszczonego
• Należy jednak zaznaczyć, że czystość
preparatu wirusowego w głównej mierze
zależy od staranności i precyzji osoby
wykonującej badanie.
• Jeżeli punktem wyjścia do otrzymania
preparatu wirusologicznego ma być
zakażona hodowla komórek należy
odpowiednio przygotować zarówno
materiał którym będziemy zakażać jak i
linie komórkowe.
Hodowle komórkowe
• Prowadzenie hodowli komórek wymaga
odpowiedniej metodyki jak i sprzętu.
• Przechowywanie: ciekły azot.
• Rozmrażanie jak i późniejsze pasaże -
warunki jałowe (pod specjalnymi komorami).
• Środowiskiem wzrostu komórek są specjalne
płyny np. EMEM zawierające antybiotyki oraz
surowicę.
• Hodowlę prowadzi się w specjalnie do tego
celu przeznaczonych dołkach lub butelkach
w temp. 37*C w środowisku 5% CO2.
Hodowle komórkowe
• Jeżeli jest ona przeprowadzona
prawidłowo i nie doszło do zakażenia
komórek innymi drobnoustrojami,
komórki formują tzw. confluent.
•Pokrycie 80% powierzchni dna butelki
przez komórki jest najbardziej
odpowiednim do zakażenia takiej hodowli,
a następnie obserwacji zmian jakie w niej
wywołuje obecność wirusa (wakuolizacja,
rozpad jąder komórkowych, całkowita
destrukcja komórek).
• Zakażenie należy wykonać także w
warunkach jałowych używając
jednorazowego sprzętu. Otrzymany
w ten sposób preparat obserwuje się
przez kolejne dni w celu wykazania
efektu cytopatycznego. Jego
nasilenie jak i czas w którym
występuje po zakażeniu zależy od
miana użytego do zakażenia wirusa.
Preparaty odciskowe
• Umożliwiają one bezpośrednie
wykrycie wirusa oraz wskazanie na
niego jako przyczynę schorzenia.
• Można je pobierać przyżyciowo jak np.
u człowieka w przypadku wścieklizny z
rogówki oka, komórek mieszków
włosowych, skóry podbródka lub
karku, lub pośmiertnie u zwierząt w
przypadku wścieklizny z mózgu.
Preparaty odciskowe
• Ciałka wtrętowe jak i elementy wirusa uwidaczniają
się w preparatach odciskowych w następstwie
barwienia lub reakcji antygenów wirusowych z
przeciwciałami fluoryzującymi.
• W przypadku nosówki psów preparaty odciskowe
pobieramy ze spojówki, lusterka nosa lub błony
śluzowej pochwy bądź napletka. Następnie są one
suszone po czym inkubowane w acetonie, którego
zadaniem jest oczyszczenie jak i odtłuszczenie
preparatu.
• W przypadku nosówki elementy wirusa obecnego w
preparatach odciskowych uwidaczniają się w
mikroskopie immunofluoroscencyjnym pod
powiększeniem 40x.
Preparaty odciskowe
• szkiełko pokrywamy koniugatem CDV,
który przyłączy się do wirusa
uwidaczniając jego elementy w obrazie
mikroskopowym.
• Kolejne płukania szkiełka w roztworach
PBS mają zadanie usunąć ewentualne
zanieczyszczenia oraz zapewnić
odpowiednie środowisko reakcji.
• Po wysuszeniu preparat oglądamy pod
mikroskopem.
• Badania wirusologiczne wymagają
odpowiednio czystych i
zagęszczonych zawiesin wirusa.
Materiałem wyjściowym są zazwyczaj
zakażone komórki lub płyny, lub
narządy wewnętrzne.
• Pierwszym etapem jest uwolnienie
wirusa z zakażonych komórek.
Dokonać tego można metodami:
• mechanicznymi (rozcieranie, użycie
homogenizatorów)
• poprzez zamrażanie
• poprzez trawienie enzymatyczne
W dalszych etapach oczyszczanie
preparatów wirusowych dokonuje się
poprzez:
• Wytrącanie
• wirowanie bądź ultrawirowanie
• metodami adsorbcyjnymi
• metodami chromatograficznymi
WYTRĄCANIE
• Najczęściej do tego celu stosuje się
etanol, a także siarczan amonu,
sodu, glikol, aceton itp. Można
stosować wytracanie izoelektryczne,
przy zastosowaniu takiego ph przy
którym wirus traci ładunek
elektryczny. Następnie wytrącone
wiriony odwirowuje się i poddaje
dalszym etapom oczyszczania
WIROWANIE
• Pozwala ono oddzielić wiriony od innych tkanek.
Wirowanie różnicowe polega na stosowaniu
naprzemiennie wysokich i niskich obrotów. Efektem
takiego wirowania jest usuniecie początkowo
cząstek o większym ciężarze od cząstek wirusa, a
następnie samych wirionów.
• Dokładniejszą metodą oczyszczania preparatów
jest wirowanie w strefowym gradiencie stężeń lub
w równoważnym gradiencie stężeń. W pierwszej
metodzie zawiesinę wirusa umieszczamy na
powierzchni r-tw. sacharozy lub glicerolu o liniowym
gradiencie gęstości, wirujemy 2h przy 70-170 x g.
Wiriony w postaci opalizującej warstwy umieszczają
się na poziomie gradientu równemu ich gęstości.
WIROWANIE
• Wirowanie w równoważnym
gradiencie stężeń polega na
wprowadzaniu zawiesiny do r-tw.
chlorku cezu, siarczanu rubidu,
bromku potasu 6-9M. W czasie
wirowania wiriony przemieszczają się
do punktu, w którym ich gęstość jest
równa gęstości roztworu. Frakcję tą
pobiera się nakłucie probówki.
METODY ADSORPCYJNE
• Polegają na wiązani wirusów przez krwinki czerwone
(Ortomyxoviridae), adsorbanty chemiczne(kaolin,
NaOH, fosforan glinu), a także surowice
odpornościowe. Adsorbcja wirusa do krwinek
zachodzi w temp. 4*C. Stosuje się krwinki kurze lub
ludzkie grupy 0. Elucja wirusa z krwinek zachodzi w
temp. 37*C, i przy zastosowaniu niskoobrotowego
wirowania oddziela się krwinki od wirionów.
Oddzielenie wirusa od adsorbenta chemicznego
dokonuje się przez zmianę ph roztworu lub siły
jonowej. Przeciwciała z kolei oddziela się od
wirionów przez zmianę warunków
fizykochemicznych lub trawienie enzymatyczne
przeciwciał.
METODY
CHROMATOGRAFICZNE
• Chromatografia kolumnowa polega na
wiązaniu się wirusa np. z
dietyloaminoetylocelulozą (DEAE) lub
fosfocelulozą. Następnie wirus wymywany
jest przez zmianę ph lub siły jonowej eluentu.
Wyróżnia się także chromatografię
powinowactwa , w której stosuje się reagujące
swoiście i odwracalnie z cząstkami wirusa
ligandy, oraz chromatografie żelową gdzie
oczyszczanie polega zasadzie różnic w
gęstości molekularnej (sito molekularne)
TECHNIKI
ELEKTROFORETYCZNE
• Elektroforeza jest technika rozdziału
w żelu substancji posiadających
różny ładunek elektryczny.
Najczęściej jako żelu używa się 1%
agarozy.
FILTRACJA I ULTRAFILTRACJA
• Filtracja polega na przepuszczaniu zawiesiny wirusa
przez różnego rodzaju filtry o różnej wielkości porów,
które zatrzymują większe cząstki od wirusa. Filtry
wykonane są z azbestu, porcelany nitrocelulozy itp.
• Ultrafiltracja wykorzystuje membrany
nitrocelulozowe o określonej wielkości porów co
pozwala na przepuszczenie cząstek o określonej
wielkości. Dzięki tej metodzie znamy średnicę, a
czasami i masę cząsteczkową wirionów.
• Także dializa jest metodą oczyszczania zawiesin
wirusowych. Zanieczyszczenia dyfundują tu przez
błonę dializacyjną do środowiska w kierunku ich
mniejszego stężenia.