Biofizyka molekularna 3

background image

Biofizyka

molekularna

III

Spektrometria
MS, CD i
fluorymetria

background image

Techniki spektrometryczne w
badaniach biologicznych

Analityka biochemiczna ilościowa –
(spektrometria UV/Vis,
spektrofluorymetria)

Identyfikacja biomolekuł i ustalanie ich
struktury – CD, NMR, MS, rzadziej
spektrofluorymetria

Analizy in vivo – fluorymetria, EPR,
rzadziej UV/Vis

background image

Spektrometria masowa (MS)

Identyfikacja masy molekularnej

substancji niskocząsteczkowych

oraz mniejszych biopolimerów

Proteomika, a zwłaszcza

identyfikacja sekwencji białek

Glikomika – identyfikacja składu

oligocukrów

Analiza kwasów tłuszczowych –

zastosowanie w taksonomii bakterii

background image

Spektrometr masowy

background image

Techniki
jonizacji

Jonizacja
elektronami

(Electron
Ionisation - EI
) -
jonizacja przy
pomocy wiązki
elektronów w
próżni

Elektrorozpylanie

(Electrospray, ESI), rozpylanie
cieczy zawierającej badaną
substancję z igły, do której
przyłożono wysokie napięcie
(zwykle 1 – 5 kV) pod
ciśnieniem atmosferycznym.
Metoda łagodna, nie
powoduje fragmentacji
badanych cząsteczek. Typowa
do stosowania z
biopolimerami.

background image

Desorpcja laserowa z udziałem matrycy (Matrix

Assisted Laser Desorption Ionisation - MALDI) - w której
stosuje się jonizację laserową, ale z tak dobraną energią
wiązki, aby nie doprowadzać do fragmentacji cząsteczek
(łagodna metoda jonizacji), lecz tylko do ich "wybijania" ze
specjalnie przygotowanej matrycy.. Typowa do stosowania z
biopolimerami.

background image

Techniki analizy jonów – MALDI-
TOF

Analizator czasu przelotu (Time Of Flight TOF) - jony
wprowadzane do analizatora są przyspieszane przy pomocy
impulsu elektrycznego. Na końcu analizatora znajduje się detektor
jonów (powielacz elektronowy lub fotopowielacz) połączony z
urządzeniem rejestrującym czas od impulsu przyspieszającego do
momentu uderzenia określonego jonu w detektor. Ze wzrostem
masy cząsteczkowej jonów, wydłuża się ich czas przelotu.

background image

Pułapka jonowa

Pomiaru masy dokonuje się przez uwięzienie
w pułapce jonów o szerokim zakresie m/z i
wyrzucanie z pułapki kolejnych grup jonów o
określonym m/z.

background image

GC-MS

Chromatograf gazowy z detektorem MS – analiza
szerokiego zakresu związków chemicznych, w
biologii zwłaszcza kwasów tłuszczowych i
oligosacharydów

background image

LC-MS

Chromatograf cieczowy HPLC z detektorem MS
– analiza białek i (rzadziej) kwasów
nukleinowych oraz dużych polisacharydów

background image

Widmo MS

- białka
natywnego

- białka
trawioneg
o proteazą

background image

MS w
proteomice

background image

Spektrometria CD
- dichroizmu kołowego

Technika analizy strukturalnej
białek i kwasów nukleinowych

Wykorzystuje zjawisko
zróżnicowanego oddziaływania
spolaryzowanego kołowo
promieniowania
elektromagnetycznego z
molekułami chiralnymi

background image

background image

Widma
CD
DNA

background image

„Idealne” widma CD różnych
struktur drugorzędowych w
białkach

background image

Fluorymetria

Zjawisko

Wpływ częstotliwości wzbudzenia
na intensywność emisji

background image

Budowa fluorymetru
stosowanego w pomiarach
biologicznych

background image

Budowa
spektrofluorymetru

background image

Związki fluoryzujace

background image

Zastosowania fluorymetrii

Oznaczanie:

DNA i RNA

białek,

ilości bakterii,

przebiegu reakcji enzymatycznych,

zjawisk komórkowych (np. apoptozy),

przebiegu ekspresji genów (GFP)

etc.

Znakowanie:

przeciwciał

DNA

struktur komórkowych,

komórek,

etc.

background image

Dziękuję za uwagę.

Proszę o pytania.


Document Outline


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Metody Biofizyki Molekularnej Krystalografia białek
Biofizyka molekularna 1
Biofizyka molekularna 4
Biofizyka molekularna 2
Zagadnienia na egzamin z Biofizyki Molekularnej i Medycznej
biofiza cw 31
BIOFIZYKA
Biofizyka 4
Biochemia z biofizyką Seminarium 2
w4 orbitale molekularne hybrydyzacja
Biofizyka 3 0809
biofizyka wyklad 09
Biofizyka komórki II Propagacja impulsu
Biologia molekularna
W03b Komórkowe i molekularne podłoże zapaleń
biofizyka wyklad 04

więcej podobnych podstron