Koenzymy – niebiałkowe składniki białek (np. enzymów) niezbędne dla ich aktywności, rodzaj kofaktorów. W przeciwieństwie do grup prostetycznych, są nietrwale (niekowalencyjnie), luźno związane z białkami. Białko bez swojego koenzymu to apobiałko (apoproteina, apoenzym), natomiast wraz z nią holobiałko (holoproteina).Biorą udział w reakcjach przez oddawanie lub przyłączanie reagentów (atomów, grup atomów czy elektronów).Koenzymy mogą mieć charakter zarówno organiczny (np. nukleotydy i ich pochodne) lub nieorganiczny (np. jony metali).Wiele organicznych koenzymów to witaminy lub ich pochodne, dlatego właśnie te związki są niezbędne dla funkcjonowania organizmu.
Wpływ PH – Najodpowiedniejsze stężenie jonów wodorowych, tzn. takie, przy
którym szybkość działania enzymu jest największa, nazywamy optimum pH. Dla większości
enzymów znajduje się ono w zakresie 5–7. Wpływ pH na aktywność danego enzymu zależy
od wartości stałej dysocjacji:
a) grup jonizujących w centrum aktywnym enzymu uczestniczących w wiązaniu
substratu,
b) grup funkcyjnych w cząsteczce substratu, którymi wiąże się on z enzymem,
c) grup funkcyjnych w cząsteczce enzymu, od których zależy kataliza,
d) innych grup w cząsteczce enzymu, których stan zjonizowania moŜe warunkować
jego katalitycznie aktywną konformację.
Wpływ Temperatury – w miarę wzrostu temperatury reakcja enzymatyczna, podobnie jak kaŜda reakcja chemiczna, początkowo ulega przyspieszeniu w związku z dostarczaniem energii cieplnej do układu. PodwyŜszenie temperatury przyspiesza szybkość reakcji zgodnie z regułą van't Hoffa, która głosi, Ŝe podwyŜszenie temperatury o 10°C powoduje około dwukrotny wzrost szybkości reakcji enzymatycznych. W określonej temperaturze zostaje osiągnięte optimum działania enzymu, a przy dalszym jej wzroście następuje gwałtowny spadek szybkości reakcji, co jest związane z denaturacją cieplną białka enzymu.
Wpływ aktywatorów i inhibitorów
Większość enzymów wymaga do uzyskania pełnej aktywności różnych czynników chemicznych przyspieszających, a nawet umożliwiających ich działanie. Czynniki te nazywamy aktywatorami. Działanie aktywatorów polega na ułatwieniu powstawania układu enzym – substrat. Aktywatorami enzymów mogą być jony metali lub aniony współdziałające z białkiem enzymu, związki regulujące potencjał redox środowiska, od których zależy budowa centrów aktywnych, bądź też związków odszczepiających pewne grupy chemiczne, blokujące centra aktywne enzymu, np. a-amylaza wymaga jonów Cl-, natomiast oksydaza polifenolowa jest aktywowana przez Cu2+, liczne peptydazy przez jony Mn2+, Co2+, Zn2+. Czynniki hamujące działanie enzymów noszą nazwę inhibitorów. Mechanizm działania inhibitorów jest różny, najczęściej polega na łączeniu się ich z centrum aktywnym enzymu lub z koenzymem czy grupą prostetyczną powodując ich unieczynnienie.
Inhibicja enzymu nieodwracalna – trwałe związanie inhibitora z resztami aminokwasów w miejscu aktywnym, co na stałe inaktywuje enzym.
Inhibicja enzymu odwracalna, hamowanie aktywności enzymu, które polega na współzawodnictwie inhibitora strukturalnie podobnego do substratu z cząsteczkami substratu o wiązanie się z miejscem aktywnym enzymu (inhibicja kompetycyjna np kwas malonowy, ktory hamuje aktywność dehydrogenazy bursztynianowej (oksydoreduktaza występująca w cykl Krebsa) albo na wiązaniu się inhibitora niekompetycyjnego z miejscami innymi niż miejsce aktywne, co zmniejsza szybkość katalityczną enzymu przez zmianę konformacyjną jego cząsteczki (inhibicja niekompetycyjna, allosteryczna np. kwas acetylosalicylowy (aspiryna). Kwas acetylosalicylowy hamuje niekompetycyjnie dehydrogenazę 2-oksoglutaranową (kompleks enzymatyczny działający w cyklu Krebsa),).
Podział Enzymów:
•Oksydoreduktazy - przeprowadzają reakcje typu redox (utleniania – redukcjii) przenoszczenie elektornów np. Oksydazy, hydroperoksydazy, peroksydazy, katalazy, oksygenazy, hydroksylazy, dehydrogenazy (np. dehydrogenaza alkoholowa – enzym z grupy oksydoreduktaz przyspieszający przekształcanie się aldehydu octowego w etanol lub odwrotnie.)
•transferazy
- przenoszą grupy funkcyjne z jednej cząsteczki na inną (np.
tiolowej (-SH), aminowej (-NH2),
metylowej (-CH3)
czy fosforanowej (-OPO3H2))
lub atomu z jednej cząsteczki (donora) na drugą (akceptora). Należą
do nich np: metylotransferazy,
fosfotransferazy, glukotransferazy, acylotransferazy,
aminotransferazy, kinazy
(katalizują reakcję przeniesienia grupy fosforanowej ze związku
wysokoenergetycznego (np. ATP) na właściwą cząsteczkę docelową.)
•hydrolazy
- biorą udział w reakcjach rozpadu z udziałem wody, hydroliza np,
proteazy
–
rozcinające białka,
nukleazy - rozcinające kwasy nukleinowe
(np. rybonukleazy, DNAzy), glikozylazy - rozcinające
węglowodany, amylaza, amyloglukozydaza, inwertazy
- rozcinające wiązanie β-glikozydowe sacharozy, fosfatazy -
katalizujące defosforylację estrów fosforanowych, np nukleotydów,
lipazy - rozcinające tłuszcze
•liazy - udział w reakcjach rozpadu bez udziału wody np liazy wiązań C-C (karboksylazy, np. dekarboksylaza pirogronianowa), liazy wiązań C-O (np. hydrataza fumaranowa, dehydrataza węglanowa), syntetazy liazy wiązań C-N (np. histydaza).
•izomerazy
- udział w reakcjach przegrupowania wewnątrzcząsteczkowego np
epimerazy,
zmieniające położenie podstawników przy asymetrycznym atomie
węgla; substratami epimeraz mogą być węglowodany i ich pochodne;
przykład: 3-epimeraza rybulozofosforanowa katalizuje reakcję:
D-rybulozo-5-fosforan = D-ksylulozo-5-fosforan;
oksydazy
wewnątrzcząsteczkowe, przenoszące atomy wodoru na tlen;
substratami mogą być aldozy i ketozy; przykład: izomeraza
rybozofosforanowa katalizuje reakcję: D-rybozo-5-fosforan =
D-rybulozo-5-fosforan;
transferazy
wewnątrzcząsteczkowe (mutazy), zmieniające położenie reszty
fosforylowej; przykład: fosfomutaza fosfoglicerynianowa katalizuje
reakcję: 2-fosfo-D-glicerynian = 3-fosfo-D-glicerynian;
izomerazy
trans – cis, zmieniające położenie podstawników. , racemazy
•ligazy - udział w reakcjach syntezy (Syntetazy (sprzężone z hydrolizą ATP) i Karboksylazy) np Ligazy DNA uczestniczą w łączeniu nici kwasu dezoksyrybonukleinowego, karboksylaza pirogronianowa katalizuje przyłączenie dwutlenku węgla do pirogronianu – tworzenie szczawiooctanu.