1.WIĄZANIE JONÓW CYNKU I KOBALTU PRZEZ KWASY ORGANICZNE I KULTURĘ ASPERGILLUS NIGER : jony metali ciężkich , które zanieczyszczają glebę , Aspergillus Niger( dla człowieka TRUJĄCY ) jest grzybem który potrafi tworzyć 3 kwasy organiczne : cytrynowy , szczawiowy i glukonowy , te natomiast potrafią wiązać właśnie jony tych mtetali - z artykułu jednak wyszło że nie wszystkie , najlepiej kwas cytrynowy , potem szczawiowy i glukonowy , PO CO TO WSZYSTKO ? mamy perpektywy , i obraz tego jak mikriobiologia może uleczyć naszą Ziemię , tutaj np. chodzi właśnie o glebę , o swego rodzaju " lekarstwo " na jej zanieczyszczenia .

2.PROTISTY JAKO BIOINDYKATORY albo 7 POWODÓW DLA KTÓRYCH PROTISTY MOGĄ BYĆ BIOINDYKATORAMI. Ogólnie protisty są wrażliwe na niektóre czynniki (siarka, zmiana klimatu, azot, metale ciężkie - mają mały zakres tolerancji). W artykule wymieniono 7 plusów, dla których protisty są dobrymi bioindykatorami, m.in.: są kosmopolityczne (są wszędzie), jest ich dużo nawet w małej próbce,s szybko reagują na zmiany. Dzięki nim można oceniać: czystość wody, stan raf koralowych, ocene zasolenia, eutrofizacji wód czy zmian antropogenicznych. Organizmy jakie wymieniono w artykule: okrzemki, otwornice, orzęski, ameby skorupkowe.
7 powodów dlaczego Protisty mogą być bioindykatorami : 1. wrażliwe na zmiany środowiskowe 2. pozycja troficzna 3. zasięg występowania 4. małe rozmiary, duża ilośc 5. czas reakcji na zmiany środowiskowe 6. łatwośc analizowania 7. tworzenie skamieniałości

3.INTERAKCJE W GLEBIE MIĘDZY PROTISTA, NEMATODA A BAKTERIAMI: Te trzy grupy silnie oddziałują na siebie w glebie. Są tak samo ważne dla ekosystemów lądowych jak organizmy nadziemne. Nematofda inaczej wpływają na bakterie niż Protista z tego względu, że Nematoda są bardziej mobilne, są wielokomórkowe. Protozoa mogą pobierać bakterie z wolnej zawiesiny lub bakterie związane z powierzchnią (a takie są w glebie); mogą przechwytywć, filtrować, odżywiać się przy pomocy dyfuzji. Nematoda są zasadniczo filtratorami, chwytają bakterie przez pompę ssącą umięśnionego gardła. Obecność Protozoa wzmacnia mineralizację azotu - pozytywne dla roślin. Jednym słowem te trzy grupy na siebie wzajemnie wpływają i tworzą "równowagę" w glebie

4.ŚLUZOWCE (Eumycetozoans):
-należą do Amebozoa
-dzielimy je na trzy grypy: protostelids, dictyostelids i myxogastrids.
Protostelids- niewiele o nich wiadomo (to była główna myśl akapitu o nich Emotikon tongue ), poza tym potwierdzono, że ich obecność w glebie zmniejsza częstość występowania chorób wywoływanych przez grzyby w pszenicy
Dictyostelids- ROZMNAŻANIE BEZPŁCIOWE: formują owocnik pod wpływem czynników chemotaktycznych (których obecność warunkowana jest zagęszczeniem populacji) i rozmnażają się tylko komórki ‘na szczycie’, pozostałe budujące trzon wykazują zachowania altruistyczne (bo wysychają po uformowaniu tego owocnika). ROZMNAŻANIE PŁCIOWE- makrocysta (czyli zygota po połączeniu dwóch komórek różnego typu), przyciąga i zjada haploidalne komórki, które otacza płaszczem, żeby ‘nie uciekły’
Myxogastrids- tworzą plazmodia, czyli największe znane komórki (ameby po fuzji zaczynają zwielokrotniać swój rozmiar równocześnie zwiększając liczbę diploidalnych jąder-czyli jakby mitoza, tylko bez podziału na odrębne komórki). W niekorzystnych warunkach plazmodium tworzy sklerotium, które jest twarde i odporne, a potem może z powrotem stać się plazmodium. Istnieje też w cyklu życiowym pojedyncza komórka z wicią lub bez wici (może się przekształcać między tymi formami)

5. Interakcje między ludzkimi monocytami i Cryptococcus neoformans i porównanie ich z interakcjami w mysich makrofagach. Podobieństwo tych interakcji.: Wewnątrzkomórkowa replikacja. ) Uwolnienie polisacharydów z C. neoformans. Zainfekowanie zdrowych komórek,„Wyrzucenie” C. neoformans przez HPBMs – rola chorobotwórcza. Zmiana rozkładu cyklu komórkowego monocytów po Fc- i zwiazków pośredniczących w fagocytozie ↑ komórek w fazie S.! W pierwotnych monocytach ludzkich 88% w fazie G1. Ok. 20% mniej w fazie G1 , pierwotnie spadek 10%. Ludzkie monocyty mogą zachowywać się jak „koń trojańskii dostarczać C. neoformans do centralnego układu nerwowego jak to ma miejsce w przypadku HIV. Makrofagi szczórów niezezwalajace C.neoformans na replikacje jak to ma miejsce w mysich i ludzkich komórkach ukazuje mocnijsze mechanizmy przeciwgrzybicze, które hamują wzrost grzybów. Ciągłość w obserwowanych zjawiskach interakcji w komórkach naczelnych i mysich podkreśla znaczenie badania patogennej strategii C. neoformans pod kątem układu odpornościowego

6.Pseudomonas i wtórne metabolity.

Bakterie wytwarzają wtórne metabolity żeby ochronić się przed pasozytami, w przypadku oseudomonas bada się czy można wykorzystać wtórne metabolty zamiast iinsektycydow. Wtórne metabolity to związki organiczne które nie są potrzebne do rozwoju bezpośrednio. Metabolityboseudomonas mają ujemny wpływ na bakterii i pierwitniaki w glebie, ale efekt tennmija po 14 dniach. Ogólnie największy wpływ mają na wzrost i różnorodność pierwotniakow.

7. Grzyby "zmelanizowane" - posiadające w komórkach melaninę.
Tematem artykułu były badania wykonywane na tych grzybach, które miały potwierdzić hipotezę, że „melanina posiada funkcje analogiczne do innych pigmentów wykorzystywanych do pozyskiwania energii, takich jak np. chlorofil”.
Grzyby te występują w dość specyficznych miejscach, są to:
-Środowiska o wysokim poziomie promieniowania
-Stacje kosmiczne
-Góry Antarktyczne
-Baseny z wodą chłodzące reaktory
Wpływ jaki promieniowanie jonizujące wywiera na grzyby "zmelanizowane":
-Zwiększona działalność metaboliczna w komórkach
-Szybszy wzrost komórek
-Większa ilość suchej biomasy
-Zwiększony wzrost w ograniczonych warunkach odżywczych
Melanina ma również właściwości radioprotekcyjne - chroni grzyby przed nadmiernym promieniowaniem jonizującym.

8. " Rośliny selekcjonuja mikroby" Ryzosfera roślin wpływa na otaczającą glebę i jej mikroflorę. Wydzieliny korzeniowe mają wyraźnie selektywny i promujacy wpływ na rodzaj mikroorganizmów. Tylko niewielki podzbiór całej różnorodności mikroorganizmów glebowych w końcu kolonizujące korzenie.

9. "Grzyby w podłożach mineralnych". Wiele rodzajów grzybów odgrywa znaczącą rolę w procesach biogeochemicznych w przyrodzie np. poprzez współpracę z mikroorganizmami glebowymi.. Stanowią ważny składnik mikroflory - grzyby "zamieszkujące" skały - zarówno na powierzchniach jak i we wnętrzu- tu wapienie, krzemiany, piaskowce, granity, marmury, wapienie , dolomity. Skały to jedno z najkorzystniejszych siedlisk dla życia drobnoustrojów - grzyby uczestniczą w procesie ich wietrzenia poprzez diagenezę mineralną, wiążą jony metali, utlenianie metali - Mn i Fe - tworząc tzw" pustynny lakier" - tu Lichenotelia sp. i uczestniczą w tworzeniu się w skałach obszarów mikrobiogennych.

10. "ameby domkowe (testacea) w ryzosferze rododendronów" cały artykuł był o tym że są w tej ryzosferze zarówno w naturalnych rododendronach w Hiszpanii jak i inwazyjnych w Wielkiej Brytanii. Mogą być przydatne do oceny stanu gleby jak i prawdopodobnie tworzą symbioze z rododendronami poprzez grzyby mikoryzowe

11. "Mikrobiologia jaskiń" "Grzyby stanowią istotny element ekosystemu obiektów podziemnych, pełniąc w nich rolę m.in. destruentów oraz pasożytów. Występują przede wszystkim na materii organicznej takiej jak np. odchody zwierząt czy też ich martwe ciała. Niska temperatura oraz niewielka dostępność składników odżywczych powoduje, że środowisko obiektów podziemnych nie sprzyja rozwojowi w nich grzybów. Jednakże grzyby mogą w nich przetrwać. Najczęściej w podziemiach grzyby występują w postaci zarodników, które dostają się do wnętrza z prądami powietrza, wodą oraz są roznoszone przez zwierzęta zamieszkujące jaskinie (nietoperze, stawonogi) oraz ludzi odwiedzających je. Stanowią one m.in. pokarm dla bezkręgowców i stają się bardzo istotnym elementem ekologii jaskiń i innych obiektów podziemnych. Najczęściej występującymi grzybami w jaskiniach są grzyby z rodzajów: Aspergillus, Penicillium, Mucor, Fusarium, Trichoderma oraz Cladosporium."

12. "grzyby i fagocyty" fagocytoza jest to pierwsza droga ochrony organizmu przed patogennymi grzybami. Rozpoznawanie grzybow przez makrofagi zachodzi poprzez receptory, rozpoznające znaczniki molekularne zawarte na powierzchni patogenu. po rozpoznaniu następuje klasyczna fagocytoza. Mechanizmem wspomagającym fagocytozę, gdy ukryte są znaczniki to np. opsonizacja, czyli opłaszczenjie patogena przez MBL.

13. Rola mikroorganizmów w procesie wietrzenia minerałów: Mikroorganizmy wykorzystują minerały jako źródło trudno dostępnych pierwiastków jak żelazo, siarka, fosfor. Tworzą na powierzchni skały biofilm czyli cienką warstewkę komórek i produkują np kwasy które rozkładają minerały. pożniej z tego roztworu w szczelince między mikroorganizmem a skałą wyłapują potrzebne jony. Oprócz tego zachodzi zjawisko biomineralizacji czyli właśnie tworzenia skał na nowo przez mikroorganizmy.

14. grzybowe alergeny: Ekspozycja na spory grzybów ma duży wpływ na zdrowie dzieci, szczególnie zimą. Astma, atopia i oddechowe objawy chorobowe są w znacznym związku z wystawieniem na wiele rodzajów grzybów. Przeciętna koncentracja spor grzybów nie ma wielkiego związku ze stanem zdrowia. Największej wagi nie ma ogólna ilość obecnych spor grzybów w otoczeniu, a szczególne ich rodzaje, które wpływają na pogorszenie zdrowia. Badanie koncentracji specyficznych, określonych rodzajów grzybów przewiduje lepiej stan zdrowia.
• Obecność Penicillium – zwiększone ryzyko astmy,
• Obecność Aspergillus – ryzyko atopii,
• Trzy najpowszechniejsze kolonie – Cladosporium, Penicillium i drożdże

15. Różnorodność i funkcje wybranych pigmentów bakteryjnych
Funkcje pigmentów:
-> są to czynniki wirulencji przez zwiększanie ilości reaktywych form tlenu (zielono niebieska piocyjanina Pseudomonas aureginosa) oraz przez ochronę przed RFT ( zlocista stafyloksantyna - Staphylococcus aureus, porfiryna - Porphyromonas gingivalis, grenadyna, wiolaceina, melaniny)
-> fotosynteza: bakteriochlorofile a b d , chlorofil a b c d e g , karotenoidy, fikobiliny, ksantofile. struktury: chromatofory, tylakoidy, chlorosomy
-> ochrona przed szkodliwym działaniem czynników środowiska: melaniny -> UV, u Vibrio cholerea ochrona przed stresem osmotycznym też , karotenoidy
-> pozyskiwanie żelaza- siderofory, np. piwowerdyna, melaniny, piomelanina związana z reduktazą żelazową, piocyjanina
-> Ochrona przed antybiotykami
-> Medycyna - prodigiozyna - działanie cytotoksyczna kom. kilku linii tkankowych, inhibitor cyklu komórkowego, degeneruje DNA, indukuje apopotozę, aktywnośc immunosupresyjna wobec limf T bokuje rozwój odrzutru przeszczepów, nowotworów. WIOLACEINA - działanie antynowotworow +działanie antybiotyczne na Leichmania amazoniensis, PIOCYJANINA - działanie antybiotyczne na bakt tlenowe gram + , ASTAKSANTYNA - barwnik żywności, składnik leków, aktynowść przeciwutniejaąca -> konserwant