Analiza DNA i RNA
Ocena ilościowa
Pomiar absorbancji przy długości fali 260nm i 320nm
Stężenia oblicza się według następujących wzorów:
Dwuniciowy DNA: C (μg/ml) = (A260-A320) x 50 x rozcieńczenie
Jednoniciowy DNA: C (μg/ml) = (A260-A320) x 33 x rozcieńczenie
RNA: C (μg/ml) = (A260-A320) x 40 x rozcieńczenie
Elektroforeza w żelu agarozowym razem z wzorcem stężeń DNA/RNA
stężenie żelu: 0,8%
0,5 μg/μl bromku etydyny
czas: 2h
napięcie: 70V
oglądanie preparatu po rozdziale w świetle o długości fali 312nm (aby nie zniszczyć materiału)
Ocena jakościowa
Pomiar absorbancji przy długościach fali 260nm, 280nm i 320nm
Stosunek A(260-320)/A(280-320) świadczy o zanieczyszczeniu preparatu kwasów nukleinowych białkami:
1,8 - 2,0 - preparat jest wystarczająco oczyszczony
1,5 - preparat zawiera 50% białka
Elektroforeza w żelu agarozowym
DNA
stężenie żelu: 0,8%
0,5 μg/μl bromku etydyny
czas: 2h
napięcie: 70V
oglądanie preparatu po rozdziale w świetle o długości fali 312nm (aby nie zniszczyć materiału)
zwarty prążek bez widocznych smug świadczy o dobrej jakości preparatu (wysokocząsteczkowy, niezdegradowany)
RNA
stężenie żelu: 1,0-1,5%
czas: 2h
napięcie: 70V
wynik rozdziału:
dwie dobrze widoczne frakcje 18S i 28S rRNA
frakcja mRNA widoczna w postaci smugi
czoło - tRNA oraz niskocząsteczkowe RNA
Oligonukleotydy
żel poliakrylamidowy (10%)
HPLC