Kolo 1

1) Wzorami strukturalnymi: dwupeptyd zbudowany z fenyloalaniny i aminokwasu, który w łańcuchu bocznym zawiera siarkę.
2) Napisz schemat reakcji syntetyzowanej przez polimerazę delta.
3) Wykres 1/V od 1/S dla enzymu o kooperacji=80 i stałej Hilla=1
4) Scemat reakcji przeprowadzanej przez kinazę kreatynową.
5) Podać wzór strukturalny nukleozydu wchodzącego w skład nukleotydu występującego na końcu 3' dojrzałego mRNA.
6) Napisać wzorami strukturalnymi reakcję katalizowaną przez enzym II klasy.
7) Narysować wykres [s] od t dla reakcji zerowego rzędu katalizowanej przez enzym allosteryczny bez i w obecności aktywatora.
8) Narysować wykres wysycenia tlenem od pO2 dla HbA i HbF + podać wartości P50 dla obu.
9) Narysować wzór dipeptydu zbudowanego z cysteiny i proliny.
10) Napisać reakcję katalizowaną przez enzym klasy 6, którego aktywność regulowana jest przez depolimeryzację/polimeryzację.
11) Wykres V od T dla enzymu typu K bez i z aktywatorem + napisać przykład takiego enzymu i aktywatora dla niego.
12) Schemat naprawy DNA w którym wystepuje uracyl (model "krótkiej łatki") + nazwy wszystkich enzymów biorących udział.
13) Wzór strukturalny dipeptydu zbudowanego z tryptofanu i dowolnego aminokwasu zawierającego w łańcuchu bocznym grupę -OH.
14) Słownie reakcję katalizowaną przez enzym klasy II z glukozą jako substratem.
15) Wykres V od S dla enzymu allosterycznego typu V z i bez efektora dodatniego. Podać przykład takiego enzymu i efektora.
16) Schemat powstawania Apo48 i Apo100 ( redagowanie

Cukry

1) Reakcja katalizowana przez fosfofruktokinazę 1 (strukturalnie).
2) Reakcja tworzenia 6-fosfoglukozaminy z 6-fosfofruktozy (słownie).
3) Rozkład glikogenu na glukozę.
4) Ile mikromoli związków wysokoenergetycznych potrzeba na zamianę 45 mg mleczanu na glukozę?
5) Napisać wzorami strukturalnymi reakcję zachodzącą pod wpływem działania glukagonu, katalizowaną przez fosfofruktokinazę 2 / fruktozo-2,6-bisfosfatazę.
6) Narysować wykres przestawiający zależność v reakcji katalizowanej przez karboksylazę pirogronianową od stężenia pirogronianu bez i w obecności acetylo-CoA.
7) Przedstawić na schemacie wpływ fruktozo-1-fosforanu i fruktozo-6-fosforanu na aktywność glukokinazy.
8) Narysować, używając nazw lub symboli związków (bez wzorów i nazw enzymów) schemat powstawania laktozy w gruczołach mlecznych (z glukozą jako substratem wyjściowym).
9) Reakcja powstawania 6-fosfoglukozaminy.
10) Równanie reakcji, w wyniku której powstaje laktoza.
11) Wykres zależności stężenia glukozy od czasu po posiłku.
12) Schemat glukoneogenezy z mleczanem jako substratem wyjściowym.
13) Ostatnia reakcja przemiany glukozy we fruktozę (strukturalnie, z uwzględnieniem enzymu i koenzymów).
14) Reakcja katalizowana przez fosfofruktokinazę 2/fruktozo-2,6-bisfosfatazę w kardiomiocycie po zadziałaniu adrenaliny.
15 Wykres stężenia glukozy od czasu, który upłynął od jej podania.
16) Schemat przemiany alaniny w glukozę + zaznaczyć te enzymy, ktore nie są wspólne dla glukoneogenezy i glikolizy.
17) Strukturalnie zapisać reakcję z katalizowaną przez aminotransferazę fosfoheksozową.
18) Wykres absorpcji glukozy ze światła jelita do enterocytu w nieobecności i w obecności florydzyny.
19) Schemat przemiany 1 cząsteczki fruktozy w 2 cząsteczki aldehydu 3-fosfoglicerolowego (słownie z podaniem enzymów).

8. Które z podanych zdań są prawdziwe:
A) Jodooctan hamuje reakcję dehydrogenazy 3-fosfogliceroaldehydu
B) Fluorki hamują fosfofruktokinazę
C) Cytrynian przyspiesza reakcję katalizowaną przez kinazę pirogronianową
D) stężenie 1 mM ATP spowalnia glikolizę

Kolo 3 tluszcze

1) Zapisać wzorami strukturalnymi reakcję katalizowaną przez 7alfa hydroksylazę cholesterolu.
2) Reakcja pozyskiwania glicerolo-3-fosforanu w adipocycie (dehydrogenaza fosfodihydroksyacetonu).
3) Schemat transportu długołańcuchowych kwasów tłuszczowych z enterocytów do adipocytów.
4) Schemat transportu palmitynianu do wnętrza mitochondrium.
5) Zapisać wzorami strukturalnymi reakcję katalizowaną przez ATP-liazę cytrynianową.
6) Zapisać, używając nazw lub symboli biochemicznych, reakcję katalizowaną przez lipazę wątrobową.
7) Przedstawić na wykresie zmiany stężenia fosfatydylocholiny i sfingomieliny w 20-40 tygodniu ciąży.
8) Narysować schemat przemian HDL.
9) Narysuj wzorami strukturalnymi reakcję ze szlaku syntezy cholesterolu i izoprenoidów, katalizowaną przez enzym, którego aktywność jest regulowana przez fosforylację i defosforylację.
10) Napisac, używając nazw lub symboli biochemicznych, reakcję syntezy estru cholesterolu, w ktorej nie bierze udziału fosfolipid.
11) Narysuj wykres stężenia TAG po posiłku.
12) Schemat udziału cytrynianu w przejściu z mitochondrium do cytozolu reszt dwuwęglowych potrzebnych do syntezy cholesterolu.
13) Strukturalnie reakcję z udziałem cholesterolu, katalizowaną przez enzym I klasy, regulowany przez polimeryzację i depolimeryzację.
14) Zapisać, używając nazw lub symboli biochemicznych, reakcję katalizowaną przez LCAT.
15) Schemat dostarczania trójwęglowych reszt do syntezy kwasów tłuszczowych (czyli transportu pirogronianu przez błony mitochondrialne, kończąc na malonylo-CoA) z zaznaczeniem poszczególnych enzymów i kompartmentów.
16) Zapisać wzorami strukturalnymi reakcję esterazy cholesterolowej.
17) Dwie reakcje syntezy prostaglandyny PGH2 z kwasu arachidonowego (zapisać nazwy aktywnosci enzymatycznych).
18) Schemat homeostazy cholesterolowej przez receptory jadrowe?

Azoty

Dzisiejsze pytania

Intermediat łączący cykl Krebsa z Cyklem Mocznikowym:
Fumaran

Ilość ATP, która powstaje po utlenieniu NADH+H w mitochondrium potraktowanym DNP:
0 ATP

Substrat wykorzystywany przez mózg do syntezy Dopaminy:
Fenyloalanina?

Enzymy błony wewnętrznej mitochondrium:
Dehydrogenaza B-hydroksymaślanowa
Dehydrogenaza NADH
Dehydrogenaza bursztynianowa

Substraty wysokoenergetyczne:
PEP
ATP
w giełdzie ktoś jeszcze wskazał jako odpowiedź acetylo-CoA ale jak dla mnie to wątpliwe i nie zaznaczyłem tego na kole

Pytanie wielokrotnego wyboru o wskazanie odpowiedzi gdzie są same aminokwasy egzogenne

Pytanie wielokrotnego wyboru o wskazanie aminokwasów zarówno gluko- jak i ketogennych

Pytanie wielokrotnego wyboru o enzymy zawierające hem

Pytania otwarte:
Dowolna reakcja anaplerotyczna wzorami
Symbolam reakcję COMT ( o-metylo transferaza katecholowa), substratem adrenalina
Schemat reakcji syntazy tymidylanowej , uwzględniający przemiany pochodnych kwasu foliowego
Schemat reakcji glutaminianu w wątrobie (narysowałem ten schemat z strefami w wątrobie ale nie jestem pewien czy to o to Aleksandrowi chodziło)

otwarte:
1.Strukturalnie reakcje syntezy S-adenozylometioniny.podac nazwe enzymu i ewentualne kofaktory.
2.Nazwami lub symbolami chemicznymi reakcje hamowana przez metotrexat
3.Wykres szybkosci reakcji katalizowanej przez dehydrogenaze izocytrynianowa od stezenia izocytrynianu przy duzym stezeniu AMP
4.Schemat wykorzystania cyklu nukleotydow purynowych w miesniach szkieletowych(podac enzymy i kofaktory)

Zamkniete m.in.:
-z czego budowany jest pierscien puryn
-ile ATP wytwarza sie ze spalenia 2 czesteczek beta-hydroksymaslanu
-enzymy cyklu mocznikowego wystepujace w cytosolu

Ile H+ potrzeba do powstania 1 ATP
-Czym jest spowodowana fenyloketonuria
-Główny przenośnik wodorów z cytosolu do mitochondrium
-Jaka reakcja nie jest charakterystyczna dla detoksykacji (chodzilo o dekarboksylację)
-Co powoduje reakcję redukcji żelazicyjanku do żelazocyjanku potasu
-Kinaza kreatynowa-gdzie działa, jak działa

Metabolizmwtorek g. 15.00
1. strukturalnie bezpośrednia reakcja syntezy noradrenaliny. podaj nazwę enzymu, zaznacz ewentualne kofaktory.
2. symbolami reakcja oksydacyjnej deaminacji glutaminianu w wątrobie. podaj nazwę enzymu, zaznacz ewentualne kofaktory.
3. napisz schematycznie reakcje cyklu mocznikowego zachodzące w mitochondrium. uwzględnij wpływ argininy.
4. narysuj schemat transportu elektronów z bursztynianu na żelazicyjanek

środa, g. 15:00

1. Reakcja karboksykinazy fosfoenolopirogronianowej wzorami strukturalnymi.
2. Reakcja biosyntezy tlenku azotu - koenzymy i wszystkie grupy prostetyczne co do jednej.
3. Wykres aktywności jakiegoś enzymu w obecności i nieobecności... Nie pamiętam jaki to był enzym
{edit DonW} Ale ja wiem, dzięki Przemowi
Chodziło o dehydrogenazę izocytrynianową, zapewne w obecności NADH/ATP (inhibitory) lub ADP (aktywator).
4. Schemat katabolizmu AMP i GMP symbolami lub nazwami wszystkich metabolitów + enzymy (potrzebne były po dwa warianty do każdego - przez IMP i przez adenozynę lub guanozynę)

1. Wzór estradiolu (tylko była podana jego bardziej skomplikowana nazwa: 1,3 costam
   )
   2. Reakcja hydroksycholekalcyferolu w nerce z PTH
   3. Schemat jak glukagon działa na fosfofruktokinazę 2
   4. Rytm dobowy HMGCoA
   
   TEST(był głupi)
   -Ile ATP powstaje z przemiany etanolu do AcCoA
   -Ile mikromoli wapnia jest w 4 ml krwi
   -Skutki długiego nadużywania alkoholu
   -funkcje kalcytoniny
   -hormony działające przez kinazę tyrozynową
   -skąd pochodzi alanina (w sensie-substrat glukoneogenezy)
   -z jakich substratów energetycznych korzysta serce

Otwarte:
1) wzorami strukturalnymi reakcja 1alfa - hydroksylazy z kalcydiolem jako substratem
2) symbolami/nazwami reakcja indukowana przez NO
3) schemat wpływu Fe na syntezę hemu
4) schemat działania ACTH na syntezę pregnenolonu

W teście m.in.:
- co takiego niesamowitego powstaje w czasie glikolizy w erytrocytach (2,3-bisfosfoglicerynian)
- enzymy indukowane przez insulinę i glukagon
- które procesy stymulowane są przez witaminę D3 (do wyboru wchłanianie w jelitach i resorbcja w nerach Ca2+ i fosforanów)
- które enzymy są regulowane przez fosforylację
- przykłady stymulacji naprzód

Sroda godz 15 Otwarte 1) struk testosteron 2) reakcje, katalizowana przez enzym, ktorego aktywnosci jest hamowana przez bialko Gi 3)reakcje, katalizowana przez enzym, ktory prowadzi do wzostu aktywnosci AKT, ktorego produktem jest jeden z II przekaznikow. Nie wiem jak to brzmialo dokladnie, ale chodzilo o reakcje PIP2 w PIP3 a enzym to: kinaza fosfatydyloinozytolu 3.(PI3k) 4) Schemat ukazujący role glukagonu na syntezę mrna dla enzymy PEPCK *w 2 i 3 trzeba bylo podac pelne nazwy subst, prod, enzymu. Pytania otwarte jak widzicie nie zalatwe chyba. A test wg mnie byl jeszcze gorszy. Dotyczyl naprawde calej regulacji praktycznie. Zero pytań o alkohol, zero albo pojedyncze o wapn, PTH, kalcytonine. W wielokrontego przewazala chyba regulacja lipidow i sterydy. Testy dotyczyly m.in takich zagadniej 1) rola wielonienasyconych kwasów tluszczowych na metabolizm 2) enzymy aktywne w watrobie w postaci defosfo.(wymienione po jednym z prawie kazdego procesu tzn od glikolizy po cholesterol) 3) jak dziala ACTH (wymienione enzymy albo II przekazniki) 4) rola LH 5) receptory dzialajace przez wiazanie RXR 6) receptor insuliny - (jak to kinaza, jak dziala) 7) dzialanie adrenaliny w mięsniach 8) w stanie dlugotrwalego glodu zachodza ( pytanie podobne do tego co bylo z gieldach z magla, ale inne odpowiedzi) 9) Co robi kina fosfatydyloinozytolu 3 ( to pytania bylo odpowiedzia na jedno z pytań otwartych 10)Rola SREBP1 ( chodzilo dokladnie o SREBP1, bo byly tez wymienione fukncje SREBP2) 11) Wzrost enzymow lipogennych ( albo lipolitycznych) powoduja ( tu wymienione hormony w tym GH i Tarczycy 12) Ktore reakcje glikolizy sa kontrolowane allosterycznie ( wymienie w m.in takie formie: Fruk-1p -->Fruk 1,6P, Gluk6p--> Fruk6P itp 13)Co jest glownym regulatorem syntezy mineralokortykoidów. 14)Co aktywuje aldosteron? (angiotensyna II, LH, FSH itp)

Pewnie i tak kazdemu juz to wisi ale zeby nie bylo, tyle co pamietam:
1.Strukturalnie progesteron
2.Schemat wplywu insuliny na hamowanie lipolizy
3.Reakcja katalizowana przez enzym blonowy, ktory jest pobudzany przez bialko G jakies (nie Gs)- kurde nie moge sobie przypomniec

4.Reakcja syntezy kortyzolu, katalizowana przez enzym hydroksylaze. Podaj dokladny enzym i jesli sa, koenzymy.

Otwarte pytania:
-Odnioslam wrazenie ze caly czas pytania krecily sie wokolo kinaz bialkowych-(A,B,C) rodzajow,na co dzialaja i co je pobudza- jaki hormon lub inne enzymy,
-jakie enzymy sa aktywne fosfo i defosfo.,
-tez bylo pytanie jakie jest stezenie Ca2+ w 8ml osocza krwi- przegieli!
,
-jakie enzymy szlaku fosfopentozowego sa pobudzane/hamowane przez glukagon-> F-1,6-P2, kinaza pirogronianowa, karboksylaza pirogron., G-6-P, glukokinaza...
-no ogolnie to taka zabawa jak hormony wplywaja na cos przez zwiekszanie/zmniejszanie aktywnosci enzymow-kinaz, fosforylaz, cAMP, cGMP...itp

---