1
1) Sygnały rozpoczynające i kończące sygnał:
a) za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka α polimerazy RNA
b) typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAAT
c) promotory genów szoku cieplnego róŜnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów
rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA
d) sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami
UUU
e) heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy (...) niektórych
genów E.coli
f) u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji
określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki
2) o splicingu tzn. co się stanie jak przesuniemy miejsce rozałęziające o 9 reszt w stronę 5`.
3) Było pytanie o tRNA, bardzo podobne do tego na liście
a) zawiera antykodon
b) zawiera kodo
c) aktywacja aminokwasu zachodzi poprzez przyłączenie do tRNA aminokwasu/
d) czy na końcu 3` jest sekwencja ACC
e) czy przy tworzeniu aminoacylo-tRNA, powstaje produkt pośredni aminoacylo-AMP
4) Był opisany eksperyment, w którym do operonu tryptofanowego wsadzono sekwencję regulatorową
operonu lac, która była wraŜliwa na IPTG (tzn. związanie IPTG powodowało blokadę transkrypcji), a operator
tryptofanowy nie wiązał tryptofanu, czyli nie był wraŜliwy na stęŜenie Trp. Kiedy zachodziła synteza enzymów
rozkładających trp. Więc tylko wtedy kiedy nie było IPTG, bo ten operon jest wraŜliwy tylko na stęŜenie IPTG.
5) Pytanie o czynniki regulacji transkrypcji u Eukariota, na pewno było o tym czy muszą wnikać do komórki i jadra TAK
6) Operon tryptofanowy, czy występuje odcinek liderowy, w obrębie którego jest atenuator, czyli miejsce
kontrolowanej transkrybcji, co jeśli jest duŜo trp, a co jeśli jest go mało,
Odcinek liderowy z atenuatorem
Duzo trp -> zahamowana polimera
7) Które z poniŜszych dotyczących operonu tryptofanowego sa poprawne?
a) transkrypt operonu tryptofanowego koduje 5 enzymow przekształcających choryzmian w tryptofan
b) transkrypcja operonu trp jest regulowana miedzy innymi przez atenuator odcinka literowego
c) tryptofan pelni role korepresora, gdyz moŜe bezpośrednio wiązać się z represorem
d) liderowy mRNA koduje krotki „peptyd testowy”
e) w przypadku niedoboru trp polimeraza zaczyna syntezować mRNA poniżej miejsca transkrypcji
f) w przypadku mutacji w obrębie sekwencji Sine-Dolgarno…
8) tóre z poniŜszych dotyczących sygnałów rozpoczynających i kończących transkrypcje sa poprawne?
a) za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka α polimerazy RNA
b) Typowe promotory E.coi zawiera w obrebie -10 tzw.kasete tata o sekwencji zgodnej TATAA
c) promotory genow szoku cieplnego roznia się w sposób zasadniczy od typowych promotorow
rozpoznawanych przez innewarianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA
d) sygnalem terminacji transkrypcji jest czesc RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami
UUU
e) heksametryczne bialko rho jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy
……….niektorych genow E.coli
f) u E.coli wyspecjalizowane sygnaly terminacji transkrypcji zwane atenuatorami …..okreslonych genow do
potrzeb pokarmowych komorki
9) Które na temat aminoacylo-tRNA są poprawne?
a) wiazanie estrowe w aminoacylotRNA tworzone jest miedzy grupa karboksylowa aminokwasu a gr
fosforanowa tRNA
b) dla kaŜdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego
c) rodzaj aminokwasu przylaczanego do tRNA zalezy od rodzaju syntetazy……….. jest substratem
d) niektóre syntetay aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA
e) wszystkie syntetazy aminoacylotRNA rozpoznaja właściwy tRNa rozpoznając
f) aminokwas polaczony z tRNA odgrywa istotna role w rozpoznaniu
2
10) które dotyczące roli bialek ochronnych są poprawne?
a) wiąŜą się z rosnącymi łańcuchami polipeptydowymi
b) umoŜliwiają na zwykłe niedozwolone interakcje pomiedzy cząsteczkami
c) są powolnie działającymi ATPazami
d) przykładem jest grupa bialek szoku termicznego
e) kompleks ADP-chaoperon ma duŜe powinowactwo do bialek
f) Ŝadne z powyŜszych
11) Przykładami przedtranslacyjnej kontroli ekspresji genów u Eukaryota są:
a) alternatywny splicing pre-mRNA dzięki któremu powstają róŜne cząsteczki transkryptu
b) rozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych
c) glikozylacja i fosforylacja polipeptydów, aby mogły się stać funkcjonalnymi białkami
d) selektywna degradacja cząsteczek mRNA
e) regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację
f) selektywne skladanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych na ….
12) tóre dotyczące transkrypcji genow u E.coli sa prawdziwe??
a) produktem moŜe być policistronowy mRNA
b) faza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy
c) polimeraza RNA wykazuje aktywność egzonukleazowa, która umozliwia jej korekcję błędów
d) rRNA(tzw.odwrotny RNA, ) jest syntetyzowany w kierunku odwrotnym do typowego 5’---3’ stąd jego
nazwa
e) Pre-mRNA podlega procesowi składania(slipingu) jeszcze zanim zajdzie translacja
f) ekspresja genow jest kontrolowana głównie na poziomie transkrypcji
13) Kierowanie bialek:
a) wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie sa odcinane po przejsciu przez blone
b) czasteczki rozpoznające SRP to bialka składające się z 7 lancuchow polipeptydowych
c) uwolnienie SRP z rybosomy powoduje zakończenie elongacji
d) SRP zapobiega przed elongacja i faldowaniem
e) Rozfaldowanie lancuchow polipeptydowych – optymalna substancja do transportu
14) Translacja mRNA u Procariota:
a) 1 kodon AUG od konca 5’ transkryptu hydrolizującego ATP
b) równanie reakcji:
c) czasteczka elongacyjna Ts wiaze GTP,podlega hydrolizacji EF-Ts do GDP
d) czasteczka elongacyjna Tu oddzialuje ze wszystkimi czasteczkami aminiacetylo-tRNA oprocz fMet-RNAf
e) peptydylo-tRNA moŜe zajmowac miejsce P lub A zalezne od tego, w którym cyklu komorkowym się
znajduje
f) fMet-tRNA zajmuje miejsce P(jako jedyne)
15) . Dany jest cDNA i trinukleotyd ATg kodujący ‘start’
AgCCACATAgCgA
TCggTgTATCgCT
Która nic jest matrycowa, a która kodujaca ?
Która tworzy przejsciowa hybryde RNA-DNA ?
Jaka sekwencje na powstający transkrypt ?
16) Podjednostka δ
Zdolność inercji transkrypcji w miejscach paromotorowych:
Znajduje się w polimerazie do promotorowych rejonow RNA:
Oddysocjowuje od enzymu:
Ulatwia terminacja:
17) Ogony poliA
Dolaczone przy udziale ligaz:
Kodowane fragmenty polideoksyadenylanu:
Dodawane przez polimerze poliA:
Zuzywane ATP:
3
18) Bialka rybosomowe
Powstaja w wyniku translacji rRNA:
rRNA katalityczna i strukturalna funkcja
19) Czy cDNA powstaje w odwrotnej transkryptazie mRNA?
20) Rho
Aktywowane przez jednoniciowe RNA
Rozpoznaje sekwencje w matrycy DNA :
Czy dziala helikaza DNA-RNA:
Posiada niekodujace sekwencje:
21) Miejsca promotorowe E.coli
a) mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji
b) dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje
c) okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA
d) maja identyczne i określone sekwencje
e) sa aktywne kiedy G lub C sa zamienione w ich -10 rejon w czasie mutacji (mutacja powoduje utrate aktywności)
f) te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo
wydajne
22) Bombel transkrypcyjny
a) czesc polimeryzacje enzymu
b) podjednostka σ (utrata tej podjednostki, bo wtedy rdzen silniej się wiaze do matrycy DNA)
c) w przybliŜeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej
d) w przybliŜeniu 12 nukleozydow konce 5 lini wydłuŜającej się RNA
e) w przybliŜeniu 12 bp helisy DNA-RNA
23) Miejsce wazne w splicingu spliceosomu
Gr 2OH atakuje:
Gr adenylo-2OH atakuje:
E1 tworzy lasso:
3OH E1 atakujeE2:
5OH E1 atakuje E2:
24) Nukleosomy (eukariota)
a) Element wchodzący w sklad chromosomow
b) upakowane DNA
c) DNA jest otoczony przez histony
d) rdzen 140 pz
e) rdzen ma 4 rodzaje histonow
f) nulkeosomy scisle upakowane
25) splicing Tethahy..
a) potrzebny kofaktor GTP, GDP
b) kofaktor atakuje miejsce 5i traci PPi z konca 5
c) kieszen (zawiera czasteczki prekursorowego RNA)
d) nie potzrba ATP
e) kofaktor atakuje miejsce 3
26) Bialko C operonu ara
a) wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu struktury
b) wiaze araO2 aktywuje geny struktury
c) w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI
d) powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI
e) wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy
27) Bakteriofag λ
a) syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych
4
b) ssDNA = recA oddzialywuje z nim takŜe represor λ
c) zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA
d) gdy nic nie atakuje zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor który ulega autoregulacji
e)profag (DNA) jest takŜe lizogenicznej gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ
f) cro wiaze się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1)
g) bialko cro związany z or1 to hamuje synteze represora
28) Odcinek liderowy mRNA
a) w obrebie genu trpD
b) transkrypcja operonu trp kontrolowana atenuatorem
c) krotki transkrypt liderowy konczy sekwencja poliU
d) reszty trp obecne obok siebie
e) niedobor trp bo brak tryptofanylo-tRNA rybosom zatrzymuje na kodujących trp
f) rybosom zatrzymuje tak ze transkrypcja ponizej atenuatora
g) koduje krotki peptyd testowy z 2 resztami trp
29) Translacja mRNA u eukariota
a) formylometionylo-tRNA rozpoczyna lancuch
b) kodon AUG wybierany przez parowanie rejonu mRNA
c) mala podjednostka powyŜej miejsca transkrypcji
d) konczy czynnik uwalniający (u prok one hydrolizuje GTP)
e) biora udzial bialka wiąŜące z 5mRNA i inne czynniki inicjujące
f) moŜe być regulowane przez kinazy białkowe
30 kontrola ekspresji genow
a) alternatywny splicing
b) sekwencje doprowadzające mRNA
c) rozluźnienie struktur upakowanych
d) regulacja tworzy kompleks inicjujacy transkrypcje
31) Represor λ
- wiaze jako monomer
- ma miejsce wiazanie ara
- wiaze specyficznie do sekwencji DNA rozpoznawanych przez bialko cro
- rozne powinowactwo do miejsc OR
- rozne powinowactwo przez bialko lex A (nie bo rex A