Lizosomy
Występują tylko w komórkach zwierzęcych, mają błonę pojedynczą
Wewnątrz tych organelli środowisko jest lekko kwaśne dzięki działaniu pompy białkowej,
Wewnątrz lizosomów znajdują się hydrolazy kwaśne – enzymy czynne podczas degeneracji makrocząsteczek, w tym wchłoniętych w drodze endocytozy

Peroksysomy
Te organelle maja pojedynczą błonę
Zawierają enzymy czynne podczas rozkładu aminokwasów, kwasów tłuszczowych, czego produktem ubocznym jest nadtlenek wodoru. Ten toksyczny związek szybko jest rozkładany przez enzym katalazę, również obecną w peroksysomach.

Cytozol
Część cytoplazmy która nie wchodzi w obrąb jakichkolwiek organelli i stanowi główne miejsce metabolizmu komórki
Zawiera znaczną liczbę różnych enzymów i innych białek
Nie jest komedogennym płynem, ale przebiega przez niego cytoszkielet – sieć włókienek rozpięta wewnątrz komórki, umożliwiająca utrzymanie jej kształtów
Włókna cytoszkieletu obejmują mikrofibrylle, filamenty pośrednie i mikrofilamenty
W cytozolu wielu komórek występują tzw. ciałka – ziarnistości materiału nie otoczonego błoną np. ziarna glikogenu w komórkach wątroby