KOMISJA LOCHYŃSKI, KOMOROWSKI, OŻYHAR

1. Co to są enzymy

2. Jak wyznaczyć doświadczalnie stężenie kwasu (miareczkowanie)

3. Czym sie różnią procariota od eucariota i jak te roznice wplywaja na ekspresje genow u procariota.

4. Dr Lochyński - właściwości związków aromatycznych, ich główny przedstawiciel (benzen), jak się go otrzymuje w przemyśle - pytanie poniekąd z pracy.

5. Prof Komorowski - jak odróżnię tiantren od antracenu. Chodziło o H1 NMR i miałem rozrysować wszystkie piki jakie będą w widmie - pytanie z pracy

6. Prof Ożyhar - struktura białek

7. Lochynski - pytal mnie z pracy, ale zadal ogolne i przyjazne pytania, ktore byly prosto z pracy, a nie tylko kolo niej krazace. mowilam troche w tym o biokatalizie i enzymach i tym zainspirowal sie Komorowski

8. Komorowski - pytal o biokatalize, katalize, katalizatory i jak wplywaja na stala szybkosci reakcji i energie aktywacji

9. Ozyhar - tez sie inspirowal troche moja praca, bo pisalam tez o inzynierii genetycznej, ale pytanie zadal proste, czyli co musi miec wektor

10. dr Lochynski - wiazanie w tluszczach, jak przebiega reakcja hydrolizy tluszczy rzez lipazy,

11. prof Koorowski - jak zalezy stala dysocjacji od emperatury, jak wplywa temperatura na przebieg reakcji,

12. prof Ozyhar - wplyw pH na szybkosc reakcji, jakie aminowkasy maja na o wlyw.

13. Komorowski: co to jest ph i ph-metr (opisac, napisac schemat ogniwa)
    Ożyhar: elektroforeza

14. Komor: fluorescencja i warunek fluorescencji, (miało być niby z pracy ale totalnie nie o tym pisałam )

15. Ożi: receptory (+7TM i konkretny przykład 7TM)

16. Lochyń: wszystko o cukrach (podział, reakcje, konformacje, chiralność i zasada oznaczania konformacji)

17. Lochyński (jako że pisała pani pracę o hydrolazach). Co to jest hydroliza, napisać reakcję hydrolizy KCN i NH4Cl, jaki będzie odczyn roztworów tych soli i czy wszystkie sole ulegają hydrolizie (nie sole mocnych zasad z mocnymi kwasami nie)

18. Komorowski (pisałą pani o unieruchamianiu enzymów na zasadzie adsorpcji). Na czym polega adsorpcja, izoterma adsorpcji

19. Ożyhar (tematem mojej pracy była immobilizacjia enzymów) W jakim celu immobilizuje się enzymy

20. Lochu: dlaczego woda jest słabym rozpuszczalnikiem organicznym; alkohole, diole, glicerol + samochody, spirytus rektyfikowany

21. Oż: max. absorpcji dla białek, dzięki którym resztom aminokwasowym możemy badać, do jakiej grupy należą

KOMISJA DOBRYSZYCKI, BRYJAK, LATAJKA

1. prof Dobryszycki, - budowa funkcja błon komórkowych

2. dr Bryjak - rodzaje rodziału substancji i siła napędowa

3. dr Latajka - jak zbadać strukturę peptydu

4. dr Latajka - reakcje charakterystyczne alkoholi

5. prof Dobryszycki - proces fotosyntezy (jakie fazy, co powstaje, rubisco)

6. dr Bryjak - gdzie szukać mikroorganizmow, ktore moga przeprowadzic reakcje w 60C jak sie nazywaja mikroorganizmy odporne na podwyzszona temperature, jak w sposob inny niz naturalny zwiekszyc zakres temp. organizmow (tu chodzilo o inzynierie genetyczna)

7. dr Latajka - struktura II-rzędowa białek, oddziaływania w białkach

8. prof Dobryszycki - regulacja metabolizmu (opisać różne mechanizmy)

9. dr Bryjak - kinetyka Michaelisa-Menten plus zadanie na myślenie co się stanie z wykresem jak dasz więcej substratu, co gdy mniej i inne pierdoły.

10. dr Latajka - rodzaje spektroskopii/spektrometrii, gdzie wykorzystuje się te metody jeśli chodzi o oczyszczanie ścieków/biodegradację (to z pracy inż. mi dał)

11. prof Dobryszycki - oczyszczanie białek, jak można wyodrębnić białko z jakiegoś preparatu, np.: mięśnia

12. dr Bryjak - reaktor airlift (jak się później dowiedziałem, to inna nazwa "barbotażowy"), gdzie się go wykorzystuje, jak działa, czy można go użyć do oczyszczania ścieków .... bleeee

13. dr Latajka - badanie struktury białka w roztworze

14. prof. Dobryszycki - opisac struktury 1,2,3,4 rzedowe i sposob badania kazdej z nich

15. dr Bryjak - etapy izolacji zadanego bialka

16. Dr Latajka - P31-NMR

17. Dr Bryjak - Wzrost mikroorganizmow.

18. prof. Dobrosz - metale w reakcjach enzymatycznych

19. dr Latajka- spektrofotometria ( podstawowe pojęcia)

20. dr Bryjak- przemysłowe zastosowania enzymów

21. prof Dobryszycki- miareczkowanie aminokwasów ( w pracy było ogólnie o miareczkowaniu, a kazał narysować dowolny aminokwas i powiedzieć co się stanie jeśli pKa aminokwasu jest równe pH)

22. dr Latajka- wiązania cząsteczkowe i oddziaływania miedzycząsteczkowe

23. dr Bryjak- rodzaje fermentatorów

24. prof Dobryszycki- hamowanie enzymów

25. dr Latajka - okreslanie struktury czasteczki w roztworze, zastosowania NMR-u, sekwencjonowanie białek

26. prof Dobryszycki - na czym polega projektowanie leków, działanie lekow, jakie cechy leku powinno sie zbadac podczas projektowania, regula ADME (to niby z projektu)

27. dr Bryjak - filtracja, rodzaje filtracji, cos z produkcja serow wyskoczyla, ale w koncu sama sobie na to odpowiedziała

28. dr Latajka- struktury białka+ jak oznaczyc strukturę

29. dr Bryjak- Oczyszczanie białka

30. prof Dobryszycki- Receptory 7TM

31. dr Latajka- oznaczanie atomów P w związkach (z pracy)

32. dr Bryjak-zastosowanie lipaz w przemyśle+środowisko ich działania

33. prof Dobryszycki-aktywność enzymatyczna

34. dr Latajka - wiazanie wodorowe

35. prof Dobryszycki - widmo absorpcyjne

36. dr Bryjak - zastosowania enzymow w przemysle i chodzilo jej, zeby omowic konkretne procesy

37. dr Latajka - przesunięcie chemiczne grupy karboksylowej (w ppm)

38. prof Dobryszycki - regulacja metabolizmu

39. dr Bryjak - wrzucamy związek,którego nazwy nawet nie pamiętam do fermentatora i co się stanie (jakie produkty wtórne itp.)

40. Bryjak: przemysłowe zastosowanie enzymów

41. Dobryszycki: regulacja metabolizmu.

42. Latajka: jakie protony oprócz atomu wodoru i atomu węgla można zbadac za pomocą NMR.

43. Bryjak: przemysłowe wykorzystanie enzymów,

44. Dobryszycki: glikoliza, cykl Krebsa, lancuch oddechowy( nawiazanie do pracy),

45. Latajka: jak zidentyfikowac grupy funkcyjne w związku

46. bryjak - odkryl pan szczep produkujacy bialko o zastosowaniu farmakologicznym. prosze opracowac przemyslową metodę otrzymaywania tego bialka,

47. latajka: to bialko zawiera pentapeptyd jako centrum katalityczne. prosze zaproponowac metody badan wiazan i odzialywan w nim

48. dobry: skoro juz o bialkach, to prosze opisac metody badawcze na poszczegolnym strukturach bialka

49. Bryjak: Dlaczego enzymy używane w przemyśle tracą stabilność i jak można je ulepszyć?

50. Latajka :struktury polipeptydów

51. Dobry : PCR

52. Bryjak: krzywa wzrostu mikroorganizmow, co sie dzieje w kazdej fazie, wzory, rysunki.

53. Latajka: Jak wiezmiejsz jakas czasteczke, i zdeprotonujesz, nastepnie zmienisz pH ...bleble nie wiedzialam o co chodzi.... to jakiej spektoskopii użyjesz?

54. Dobry: porównać mioglobine z hemoglobiną. Podobieństwa i róznice. Budowa , funkcja. Wykres wysycenia tlenem hemoglobiny i mioglobiny, dehydrogenaza mleczanowa.

55. Bryjak: wymienila takie enzymy jak: lipazy, proteazy, amylazy, oksydoreduktazy, mialam podac po przykladzie przynajmniej jednego enzymu z tych grup wykorzystywanychy na skale przemyslowa,

56. Latajka: po syntezie jakiegos produktu jak mozna udownodnic ze sie go otrzymalo,

57. Dobry: jak doswiadczalnie okreslic charakter inhibicji.

KOMISJA KAFARSKI, SOKALSKI, PĘCZYŃSKA - CZOCH

1. penicylina, dzialanie i mechanizm antybiotyków beta laktamowych (ogolnie zabila mnie peczyńska tymi antybiotykami, pytała bardzo szczegółowo...)

2. tłuszcze, co gdzie jak po co

3. prawo hessa

4. peczyńska- ekstremofile... no ok powiedziałam wszystko... to się mnie zaczęła pytać o proszki do prania...

5. sokalski-prawo Hessa i II zasada termodynamiki bardzo szczegółowo wymagał, a ja tak bardzo jak chciał nie umiałam...i zaczęłam się plątać i denerwować

6. kafarski- GMO (wszystko co mówiłam, nie było tym o co mu chodziło.

7. peczyńska: produkcja sera białego (!!!???)

8. sokalski-I zasada termodynamiki - też szczegółowo pytane

9. kafarski: struktura rezonansowa wiązania peptydowego.

10. Czoch: Jakie grupy organizmów można zaliczyć do świata mikroorganizmów i czym się między sobą różnią w budowie komórki

11. Sokalski: II zasada termodynamiki

12. Kafarski: hormony peptydowe (to niby z pracą)

13. czoch: kwasy nukleoinowe <haha!>

14. sokalki: pierwsza zasada dynamiki

15. kafar: czym sie różni skrobia od celulozy?

16. u peczyńskiej- antybiotyki, na jakie typy organizmów działają- np czym się różnią antybiotyki bakteriobójcze od grzybobójczych, o tych grzybobójczych jakoś nie zabłysnęłam, wiec byłam pytana z bakteriobójczych- typy, przykładowe nazwy, mechanizm działania beta laktamowych i polipeptydowych (o tych akurat miałam coś tam w pracy)

17. sokalski- tu mnie zabił:P wzór, struktura przestrzenna i hybrydyzacja atomów węgla w kwasie salicylowym-> w tym miejscu zrobiłam minę masakryczną i się koleś od razu zreflektował mówiąc - "no chyba za trudne faktycznie- w takim razie kwas octowy" więc musiałam wszystkie powyższe dla octowego ogarnąć

18. kafarski- starał sie z pracy, ale mało spodziewane- aminokwasy białkowe, niebiałkowe, czym się różnią, potranslacyjne modyfikacje

19. Co to jest ekosystem, co się dzieje gdy jego równowaga zostaje zaburzona, podac przykład.

20. Jak powiązać stałą szybkości reakcji z temperasturą, wykres zmian energi reakcji podczas jej przebiegu.

21. Co to jest i jakie zjawisko wykorzystuje NMR.

22. Peczyńska: jakie są najważniejsze procesy biochemiczne w procesie produkcji białego sera (ogólnie pytała z czego się składa mleko i dlaczego gęstnieje i jak się bakterie nazywają po PL i po łacinie)

23. Sokalski: Prawo Kirchoffa, albo I zasada termodynamiki (wybrałam to 2) - pytał o wzór na pracę, co jeśli proces jest adiabatyczny i izochoryczny

24. Kafarski: Proszę narysować wiązanie peptydowe i napisać co jest w nim takiego szczególnego (chodziło mu o to że jest płaskie i dlaczego takie jest...), narysować strukturę rezonansową tego wiązania i powiedzieć jakiej hybrydyzacji jest węgiel i azot i rozrysować tą hybrydyzację, ale nie chodziło mu o rysowanie orbitali

25. peczynska: klasy enzymów, jakie reakcje katalizują, które są najważniejsze z biotechnologicznego punktu widzenia, dlaczego? czy hydrolazy są enzymami egzacelularnymi, i co to dla nich oznacza.

26. kafarski: rodzaje transportu w inżynierii chemicznej

27. sokalski: oddziaływania międzycząsteczkowe, narysować wodorowe, jaka jest hybrydyzacja cz. wody, potem opisać wszystkie hybrydyzacje i powiedzieć jaki jest kąt w cz. Wody

28. polisacharydy szczegółowo pod względem chemicznym i biologicznym
    i enzymy proteolityczne

29. od sokalskiego butadien i hybrydyzacja

30. Peczyńska-Czoch: zaczęła od tego, żeby opisać na czym polega hydroliza białek (to opisałam jaka klasa enzymów to robi i co rozcina) to potem pytała mnie o trawienie białek w przewodzie pokarmowym, generalnie to bardzo nakierowywała o co jej chodzi

31. Sokalski: jak eksperymentalnie wyznaczyc ciepło reakcji? Tu coś powiedziałam o ćwiczeniu z bombą na laborkach z fizycznej. Podać wzór powiązujący energie wewnętrzną z entalpią i napisać równanie spalania naftalenu (podał mi wzór) i generalnie bardzo krótko mnie pytał

32. Kafarski: mega proste pytanie mi zadała. Opisać struktury I, II, III i IV-rzędowe białek i jakimi metodami wyznacza sie strukturę białek (chodziło o NMR i krystalografię rentgenowską

33. Prof. Sokalski: Omówić regułę przekory na podstawie reakcji spalania tlenku węgla. Izobara van't Hoffa.

34. Prof. Peczyńska-Czoch: Krzywa wzrostu mikroorganizmów. Narysować. Opisać. Jak się ją sporządza? Po co się ją wykreśla? Dlaczego mikroorganizmy umierają?

35. Prof. Kafarski: Narysować płciowy hormon sterydowy. Narysowałam estradiol i dostałam pytanie, czym różni się od testosteronu. Ale te pytania były powiązane z pracą, bo pisałam o plastyczności receptorów jądrowych

36. Prof. Peczyńska- Czoch: rozmawiałam z nią na temat mutacji, co to takiego, na czym polega, czym jest powodowane i jak sie objawia

37. Prof. Sokalski: prawo Kirchoffa:D

38. Prof. Kafarski: odnośnie związku który pojawił się w mojej pracy będącego na bazie porfiryny, którą z resztą kazał mi narysować;> pytał też o terapie fotodynamiczą (którą też mam w pracy) i coś o tlen w powietrzu

39. Kafarski: biotechnologia czerwona, zielona i biała => czym się zajmuje czerwona

40. Peczyńska: synteza sterowana - co to i jak zmusić organizm, żeby skorzystał z tego co mu daliśmy

41. Sokalski: prawo Nernsta (z potencjałami), hybrydyzacja aldehydu octowego: narysować cząsteczkę (zaznaczyć które atomy przed, a które za płaszczyznę kartki), powiedzieć jakie są gdzie kąty i czy/gdzie jest swoboda rotacji

42. Peczynska-Czoch: co sie dzieje z ropa naftowa gdy jest wyciek na oceanie( nie zwiazane z praca,ale nie bylo zle):)

43. Sokalski: prawo nernsta i wszystko co zwiazane z pHmetrem

44. Kafarski: chiralnosc na przykladach( zwiazek z praca)

45. kafar -jak sie bada strukture czasteczki

46. czoch- polisacharydy, gdzie? jakie? z czego zbudowane,

47. sokalski - wzor aldehydu mrówkowego hybrydyzacja i rozrysowac katy

48. kafar: przeplywy w inz chemicznej

49. peczynska -- wszystko o hydrolazach bialek, tluszczy i cukrow

50. sokalski – kirchoff

51. Peczyńska - czy możliwe jest i jak tak to jak miałoby wyglądać otrzymanie alkoholu etylowego z celulozy, dokładnie po kolei opisać łącznie z enzymami i mikrootganizmami

52. Sokalski - wiązanie wodorowe, 2 zdania i nie wiedzialam co wiecej, to zadal mi jeszcze pytanie, narysować kwas benzoesowy i powiedzieć gdzie co sp2, sp3 itd

53. Kafarski - nawiązał coś do mojej pracy gdzie pisalam o adsorpcji, ale miałam to przenieść na gazy w czymś tam... nie skumałam w ogóle o so mu chodzilo i była wielka ściema

54. Peczyńska: witaminy; co to jest? po co jest? skutki braku; przykładowe choroby tym spowodowane; dlaczego psom nie dostarcza się witaminy C.

55. Sokalski: reguła przekory; izobara van't Hoffa; otrzymywanie amoniaku.

56. Kafarski: antysensowne oligonukleotydy; mówił, że to takie poza zakres programu studiów, ale w jakimś tam stopniu miało to nawiązywać do pracy.

57. Peczyńska: glikogen - po co i gdzie, regulacja

58. Sokalski: wzór acetonu, hybrydyzacja

59. Kafarski: wzór cysteiny i jej formy w pH 1 i 12, forma jonu obojnaczego

60. przemiany anaboliczne i kataboliczne z przykładami,

61. powiązanie szybkości reakcji z temp., energia aktywacji- wzór i wykres, równanie Arrheniusa,

62. pytanie odnośnie reakcji transestryfikacji, produkcja biodiesela, gdzie się wykorzystuje glicerol

KOMISJA ŻYMAŃCZYK – DUDA, ANDRUNIÓW, OLEKSYSZYN

1. Duda pytała jak wyznaczyć optymalne pH dla mikroorganizmów, jaki jest podział tych mikroorganizmów za względu właśnie na ich optymalne pH i podać przykłady.

2. Andruniów, połowy nie pamiętam, bo nie wiedziałam o czym do mnie mówi, ale chciał wzór na iloczyn rozpuszczalności, jak to się ma do aktywności, wykresy fazowe dla ciała stałego i cieczy i izobarę van't Hoffa, prawo graniczne Debye'a-Hückla

3. Olek pytał szczegółowo o fosforylację oksydacyjną, co, po co, do czego, gdzie zachodzi, ogólnie wszystko i jeszcze o aminotransferazy, co to jest, jak działają i podać przykład reakcji, i wszystko o wysalaniu.

4. u mnie Duda pytala o to jak zbadac czystosc wody i jakie bakterie do tego wykorzystujemy (E.coli i Shigella). Powiedzialam o mianie coli i indexie coli i o to chodzilo.

5. Andruniow pytal o to jaka jest zaleznosc miedzy sila SEM a powinowactwem. Nie mam pojęcia, potem cos o wzorze Nernsta.

6. Olek zapytal o proteazy, mechanizmy. Jakiego mechanizmu uzywa karboksypeptydaza A

7. Duda: ja miałam pytania z pracy o klasyfikacje drozdzy i procesy prowadzone przez drozdże.

8. Oleksyszyn: szczegółowo o glikolizę, ale nie wszystkie reakcje szlaku, tylko gdzie zachodzi, zysk E, po co zachodzi, w jakich warunkach, co się dzieje, jak nie ma Glukozy

9. Andruniów: ogólnie pytała o produkcje entropii i entropie transportu, ale nie chciał regułki tylko postacvi rozniczkowe, potem pytał o 2 zasadę termodynamiki, ale tez nie regułkę i ustne wyjasnienie, tylko równania i nie w postaci gotowej tylko różniczkowej. Potem spytał, czy W i Q sa funkcjami stanu, i czy zawsze nie są funkcjami stanu, a jak nie są to kiedy, w jakich sytuacjach.

10. Duda - pytanie odnośnie najgorszych etapów w produkcji wina bezalkoholowego (to jest związane z tematem

11. Olek - pytałam mnie o to co to jest elektroforeza, bardziej dokładnie - na czym polega, w czym jest przeprowadzana, jakie odczynniki są używane (bardziej z praktycznej strony)

12. jeśli chodzi o Andruniowa to pytał mnie o Adsorpcje - co to jest, czym się różni fizyczna od chemicznej, jakie są izotermy i najlepiej to je wypisać

13. Dr Oleksyszyn: Opisz katalityczne właściwości enzymów.

14. Dr Andruniów: Reguła faz Gibsa, opisanie, liczenie składników niezależnych.

15. Dr Żymańczyk-Duda: Metody immobilizacji biokatalizatorów.

16. Andruniów: czym jest powinowactwo chemiczne? o czym mówi? jaki ma związek ze stałą równowagi? równanie do tego ze stężeniami i z aktywnościami reagentów.

17. Oleksyszyn: struktury białkowe. Jak sprawdzić masę białka i nie naruszyć jego struktury IV rzedowej (chodzilo o wirowanie w gradiencie gestosci). Przyklady białek o znanej str.IV.

18. Duda: podział mikroorganizmow ze wzgledu na T. Przyklady. Jak sprawdzic optimum T dla danego szczepu. --> laboratorium z mikrobiologii sie ukłonilo

19. krolestwa organizmow zywych poronwac prokarioty i eukarioty
20. jak zmierzyc mase czasteczkowa bialek
21. jak wyznaczyc rzad reakcji
22. andruniów: o prawie Hessa, Kirchoffa, napisać równania je opisujące, gadka o entalpii, np. jaka jest entalpia spalania wody
23. olek: opisać szlaki przekazywania sygnałów na jakiej zasadzie to działa,
24. duda: o selekcji bakterii lipolitycznych i ich identyfikacji

INFO OD PROWADZĄCYCH PRZED EGZAMINEM (ODPOWIEDŹ NA PYTANIE Z CZEGO PAN/PANI PROF. MOŻE ZAPYTAC BIEDNEGO STUDENTA?)

DOBRYSZYCKI:

1. Kinetyka enzymatyczna - rodzaje inhibicji; wykresy; substrat, enzym, inhibitor

2. Krzywa Michaelisa-Menten - glowne zalozenia

3. Rozdzial przekazywanie sygnalow - raczej caly rozdzial powtorzyc...

4. Co do szlakow np. glikoliza to ogolne wiadomosci (co to jest, jakie zachodza reakcje, jaki zysk, jakie substraty, glowne produkty itd.) - nie trzeba wkowac na pamiec calosci szlaku!?

5. Powiedzial zeby sobie przypomniec tytuly rozdzialow i podrozdzialow - czyli nie czytac za duzo...

6. Poleca powtorzyc takie rzeczy, ktore nasuwaja sie patrzac na tytul projektu, bo wiekszosc pytan pada w oparciu o tytul pracy...

7. PYTANIE RATUNKOWE - wzor aminokwasu (w roznym pH)

LATAJKA:

1. Pytania 'chemiczne', o spektroskopii itp.

2. Jak dziala spektrofotometr.

3. NMR, masówka, podczerwień

4. proste rzeczy z chemii organicznej

OLEKSYSZYN:

1. co to jest pH,

2. tez mówił o reakcjach enzymatycznych,

3. proste przeliczanie stężeń

4. on kocha glukoze, glikolize itp więc pewnie o to tez moze zapytać

OŻYHAR:

1. podstawowe rzeczy o białkach, kwasach nukleinowych, biologii molekularnej.

2. czemu mierzymy stężenie białka przy 280nm,

3. podstawowe rzeczy jakie musi mieć wektor itp.

ANDRUNIÓW:

1. zerowa, 1, 2 i 3 zasada termodynamiki,

2. co to jest rząd reakcji,

3. liczba stopni swobody (jak wyznaczyć),

4. równanie stanu gazu doskonałego,

5. sztywne kule i van der Waals

6. o ciśnieniu osmotycznym

7. zależności między funkacjami termodynamicznymi,

8. co to jest równawaga termodynamiczna