Kolokwium nr II pomoc biochemia

Flipazy pomagają w uzyskaniu asymetrii błony komórkowej.

Blokery kanału wapniowego: werapamil, diltiazem, nifedypina
Blokery transportu aktywnego: dinitrofluorobenzen – NH2; N-etylomaleimid (NEM) – SH.

Kanał potasowy jest selektywny dzięki rozmiarom jonu K (może on oddziaływać z pierścieniem tlenowym) oraz wymaganą mniejszą energią dehydratacji).

Kanał sodowy – oparty na zamknięciu o COO-; wąski, dlatego selektywny; u szczura – 4 podjednostki po 6 helis transbłonowych tworzących kanał

Kanał kationowy niespecyficzny – oparty na występowaniu aa niepolarnych tworzących pierścień (0,65 nm)
Fosforylacja pompy Na/K –potrzebne Na, Mg;

Hamowanie pompy Na/K – strofantyna G, digitoksygenina.

Hamowanie histaminy (która jest aktywatorem pompy H/K) – cymetydyna odwracalnie, omeprazol – nieodwracalnie.

Transport glukozy czy aa – symport z Na, poniekąd aktywny; 4 rodzaje przenośników aa (kwaśne, zasadowe, Pro/Gly, obojętne); 1 jon Na-1 cz. Glc/aa.

Pompa ATPaza-Ca2+ - 10 transbłonowych fragmentów, Asparaginylowa reszta ulega fosforylacji w siateczce; w błonie – kalmodulina, która wiąże się z nadmiarowym Ca, zwiększa Km przenośnika i usuwa Ca. 2 jony Ca – 1 ATP zużyte

Wymiennik Na/Ca – 3 jony Na do; 1 jon Ca – wychodzi, dużo szybszy.

GLUT: 1 – erytrocyty, 2- wątroba, nerka; 3 – neurony, 4 – mięśnie, tk. tłuszczowa (INSULINA) 5 – jelita, miocyty

W antyporcie Cl-/HCO3 by powstał CO2 potrzebny jest H z Hb. (CO2 + H2O-> HCO3 + H)

Pinocytoza – klatryna opłaszcza dołki

Kaweole – wpuklenia błony; kaweolina bierze udział w tworzeniu ich z raft, które biorą udział w przekazywaniu sygnałów

AcCoA, szczawiooctan, NAD/H nie przenika przez wew. błonę mitochondrialną. Przenośniki w błonie działają kosztem energii z gradientu elektrochemicznego.

Translokaza ATP/ADP – utrata jednego ujemnego ładunku, strata gradientu między przestrzenią m-błonową a matrix; antyport!

Jonofory – walinomycyna, gramicydyna

Cykl gamma-glutamylowy: y-glutamylotranspeptydaza tworzy dipeptyd z aa (oprócz Pro) i glutationu; ten traci powinowactwo więc y-glutamylocyklotransferaza go rozkłada do aa i 5-oksoproliny; pozostały Cys-Gly też ulega hydrolizie, zużywane 3 ATP do odnowienia glutationu.

Ac-CoA transportowane są z użyciem karnityny (w przestrzeni m-błonowej jest acylotransferaza karnitynowa I, w matrix – II;) Ac-karnityna przenika do matrix; karnityna – do przestrzeni.

Mostek glicerolofosforanowy – głównie mózg, tk. tłuszczowa, wątroba; dwa enzymy dehydrogenazy glicerolo-3-fosforanowej (cytozolowy i mitochondrialny; z fosfodihydroksyacetonu i NADH+ powstaje glicerolo-3-fosforan, który potem oddaje wodory na FAD (ominięcie kompleksu I utleniania bo FADH2, mniej powstałego ATP).

Mostek jabłczanowo-asparaginowy:

szczawiooctan + NADH-dehydrogenaza jabłczanowa C->jabłczan

jabłczan (w mt)-dehydrogenaza jabłczanowa M-> szczawiooctan + NADH

szczawiooctan + Glu –aminotransferaza asparaginowa M->a-ketoglutaran + Asp
Asp + a-ketoglutaran –aminotransferaza asparaginowa C-> szczawiooctan + Glu

NADH dostarcza 2,5 ATP na parę wodoru (!)

FADH2 dostarcza 1,5 ATP na parę wodoru

Oksydazy przenoszą atomy wodoru na tlen, powstaje H2O2 (rzadziej H2O), często zawierają metal; np. oksydaza L-aminokwasowa (oksydacyjna deaminacja aa; FMN); ksantynowa (utlenianie zasad purynowych; FAD), oksydaza cytochromowa (cyt a3; dwie cząsteczki hemu z Fe i dwa Cu).

Peroksydazy zawierają luźno związany protohem i rozkładają H2O2 kosztem utlenienia glutationu, hydrochinonów czy askorbinianu., np. glutationowa (Se!). Reduktaza glutationowa zużywa NADPH.

Katalazy zawierają 4 grupy hemowe, neutralizują H2O2 bez niczego.

Oksygenazy wbudowują bezpośrednio tlen; monoksygenazy wbudowują tylko jeden, a drugi trafia do cz.wody (NADPH, tetrahydrofolian), np. cytochrom b5 (chroni erytrocyty, w mikrosomach wątrobowych), P450. Dioksegynazy - dwa; np. homogentyzynowa, L-tryptofanowa.

Dehydrogenazy używają NAD (enzymy cyklu Krebsa, glikoliza, łańcuch oddechowy) lub NADP (synteza kw. tłuszczowych, steroidów). Niektóre korzystają z flawin jak dehydrogenaza NADH, bursztynianowa, acylo-CoA. Cytochromy za wyjątkiem oksydazy cytochromowej to też dehydrogenazy.

Dysmutaza ponadtlenkowa: dwa rodniki ponadtlenkowe + 2 H+ -> H2O2 + O2

Rodniki ponadtlenkowe powstają w reakcji z oksydazą NADPH (przekazanie po jednym elektronie na O2).

Mieloperoksydaza – z H2O2 i halogenków powstają kwasy halogenowe I (np. HClO)

Reakcja Fentona: Fe2+ + H2O2 -> Fe3+ + OH* + OH-

Reakcja Habera-Weissa: O2-* + H2O2 -> O2 + OH* + OH-

Ubihydrochinion i FMNH2 potrafią gubić elektrony w łańcuchu oddechowym, tworząc anionorodniki ponadtlenkowe.

Z wit E powstaje pośrednik chinonowy (pierwszy pierścień aromatyczny ulega przekształceniu do chinonu, drugi – otwarciu). Ta przekazuje swój wolny rodnik na witaminę C, która przekształca się w dehydroaskorbinian.

Inne substancje chroniące przed wolnymi rodnikami: karoteny, melaniny, kwas moczowy, kreatynina, flawonoidy, ceruloplazmina.

Centra żelazowo-siarkowe mogą czasowo wiązać elektrony, gdyż zelazo niehemowe występuje tam na +3 utlenienia i redukuje się przy wiązaniu do +2 stanowiąc jednoelektronowe pomosty (z flawoprotein na CoQ i z CoQ na cyt c1).

Fenobarbital indukuje syntezę cyt P-450.

P-450 – synteza hormonów steroidowych, hydroksylacja aminopiryny, morfiny, aniliny, hydroksylacja pochodnych wit. D, utlenianie kwasów tłuszczowych, węglowodorów aromatycznych, pestycydów itp.

Mikrosomy zawierają: monooksygenazy (hydroksylazy Phe, Trp, dla leków), dioksygenazy (wymienione).

Reduktaza NADPH-cytochrom P450 dostarcza 2H+ i 2e-:

NADPH+ + FAD -> FADH2 + NADP
FADH2 + 2 Fe2S23+ -> FAD + 2 Fe2S22+ + 2 e-

Następnie do cyt P450 dołącza się lek, przyłącza się jeden elektron (redukcja Fe), tlen, kolejny elektron (powstaje anionorodnik ponadtlenkowy) i w końcu 2 wodory – dochodzi o ponownego utlenienia cyt P450, powstania A-OH (leku) i wody.

Enzymy mitochondrialne: zew – syntetaza acylo-CoA, acylotransferaza fosfoglicerolowa; m-błonowa: kinaza adenylanowa, kreatynowa; wew – kardiolipina, enzymy łańcucha odd, przenośniki błonowe.

Różnica NAD/NADH i O2/2H2O wynosi 1,1V.

Część bursztynylo~S-CoA staje się substratem w syntezie barwników porfirynowych bądź uczestniczy w przemianie ciał ketonowych

Dehydrogenaza pirogronianowa to kompleks 3 enzymów:

  1. Dekarboksylaza pirogronianowa

  2. Transacetylaza dihydrolipoilowa

  3. Dehydrogenaza dihydrolipoilowa

Kompleks I

• Oksydoreduktaza NADH-Q( dehydrogenaza NADH)

• Duży enzym 900kDa, zawiera przynajmniej 46 łańcuchów polipeptydowych

• Reakcja ta przebiega dwuetapowo:

1. Związanie NADH I przeniesienie jego 2 el. o wysokim potencjale na grupę prostetyczną kompleksu FMN, który

przechodzi w formę zredukowaną FMNH2

2. Elektrony FMNH2 są następnie przekazane na szereg centrów żelazowo- siarkowych. Jony żelaza tych

centrów przechodzą na zmianę od Fe2+ do Fe3+ i odwrotnie

● Przejście 2 elektronów z NADH do koenzymu Q za pośrednictwem oksydoreduktazy

NADH-Q powoduje wypompowanie 4 jonów wodoru z matrix mitochondrialnej

● Koenzym Q pobierając 2 protony z matrix , ulega redukcji do QH2, a ten opuszcza matrix i

wędruje do wnętrza błony.

● Może na dojść do przedwczesnego przecieku elektronów na tlen, co prowadzi do

powstania szkodliwych nadtlenków.

Kompleks III

●Dwa elektrony odebrane od QH2 (w miejscu jego wiązania Qo) są

kolejno przenoszone na dwie cząsteczki cytochromu c, przenośnika

ulokowanego w fałdach przestrzeni międzybłonowej. Równocześnie

protony zostają wypompowane z matrix.

●Mechanizm ten znany jest jako cykl Q- następuje w nim przekazanie

elektronów z nośnika dwuelektronowego na nośnik jednoelektronowy

I pompowanie protonów.

●W jednym cyklu Q 2 cząsteczki QH2 są utelnione do 2 cząsteczek Q, a

następnie 1 cząsteczka Q ulega redukcji do QH2

● Uszkodzenia funkcji kompleksu III (np. przez aktynomycynę) mogą

również prowadzić do powstawania szkodliwych nadltenków.

Inhibitory łańcucha oddechowego

●rotenon, amytal, amobarbital - hamują transport w kompleksie 1 uniemożliwiając wykorzystanie

NADH+H+ jako substratu

●karboksyna – uniemożliwia wykorzystanie FADH2 z dehydrogenazy bursztynianowej

● antymycyna A – hamuje przepływ w oksydazie cytochromowej

●cyjanek i azydek – reagują z formą żelazową hemu a3

●tlenek węgla – reaguje z formą żelazawą hemu a3

●oligomycyna – hamuje przejście protonów przez syntazę ATP do matrix mitochondrialnej

Rozprzęganie fosforylacji oksydacyjnej może być zjawiskiem biologicznie korzystnym. Służy jako

źródło ciepła do utrzymania stałej temperatury u zwierząt hibernujących, u ssaków

przystosowanych do niskich temperatur. Tkanka tłuszczowa brunatna jest bogata w mitchondria z

termogeninami – białkami rozprzęgającymi.


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
NOWOTWORY CZ. III, IV rok Lekarski CM UMK, Patomorfologia, patomorfologia, ćwiczenia, semestr zimowy
Kolokwium nr 1, Dietetyka CM UMK, Biochemia
NOWOTWORY CZ. I, IV rok Lekarski CM UMK, Patomorfologia, patomorfologia, ćwiczenia, semestr zimowy,
Kolokwium II rok 2010-2011, Stomatologia, II rok, biochemia, giełdy
kolokwium II wersja A, biochemia koła
poprawa kolokwium IV, STOMATOLOGIA, II ROK, Biochemia, zbiorcze
K2 Tematyka kolokwium nr 2, WEiTI - Makro, SEMESTR III, ELCS, Kolokwium II
Kol1 zebrane pytania, Biotechnologia, II rok, Biochemia, Kolokwia
NOWOTWORY CZ. I (2), IV rok Lekarski CM UMK, Patomorfologia, patomorfologia, ćwiczenia, semestr zimo
wykład 3(dopełniacz i krzepnięcie), Lekarski II rok ŚUM, II ROK, Biochemia z elementami chemii, kolo
Materiały do kolokwium nr 1, ściąga na glebe - FRAKCJE v 2.1, II
Kolokwium - część II - Biochemia, BIOCHEMIA
II-ZSH-Teoria - poprawa1, astronawigacja, astro, Przykładowe kolokwia z astronawigacji, Kolokwium nr

więcej podobnych podstron