Biochemia ogólna i żywności W-1 30.09.2011
Prowadząca: dr Urszula Jankiewicz. (urszula_jankiewicz@sggw.pl)
TEMAT: AMINOKWASY, PEPTYDY, BIAŁKA
Biochemia – nauka o środowisku chemicznym oraz o przemianie materii i energii w organizmach żywych.
Metabolizm
Katabolizm (utleniacz lub utlenianie cząsteczek)
Anabolizm (synteza cząsteczek)
Termodynamika – bada zmiany energetyczne w reakcjach chemicznych (pozwala określić czy dana reakcja może zachodzić w sposób swobodny)
Energia swobodna – różnica potencjałów chemicznych między substratami a produktami reakcji.
Potencjał chemiczny - całkowita energia zawarta w wiązaniach chemicznych związku chemicznego
ΔG – zmiana energii swobodnej wyznacza kierunek przebiegu reakcji – określa spontaniczność reakcji.
G = H − TS
ΔH – zmiana entalpii
ΔS – zmiana entropii
T – temperatura bezwzględna
W reakcjach chemicznych ΔH=ΔE
ΔE – zmiana energii wewnętrznej
Jeżeli ΔG ma znak ujemny to reakcja zachodzi samorzutnie z utratą energii swobodnej tzn. jest egzoergiczna.
Jeżeli wartość ΔG jest duża to reakcja zachodzi do końca i jest praktycznie nieodwracalna.
Jeżeli ΔG ma wartość dodatnią to reakcja zachodzi tylko wówczas, gdy energia swobodna może być pobrana z zewnątrz. Wtedy reakcja jest endoergiczna.
Jeżeli wartość ΔG jest duża to układ jest stabilny i charakteryzuje się brakiem lub minimalną skłonnością do reagowania.
Jeżeli ΔG jest = 0, to układ jest w stanie równowagi i nie zachodzi żadna reakcja.
Sprzężenie energii w komórce
b)
substrat
ATP
-ΔG +ΔG
ADP
produkt substrat
Reakcja egzotermiczna b) reakcja endotermiczna
- z wydzieleniem energii z pobraniem energii
Wykorzystanie energii. Procesy endoergiczne
syntezy
1
2 skurcz mięśni
3
Reakcje pobudzenie nerwowe
egzoergiczne 4
transport aktywny
Przekazanie energii endoergicznym procesom biologicznym.
Budowa ATP, ADP, AMP
Związki maja typową budowę nukleotydową * ryboza – zasada azotowa(adenina) – połączenie adeniny z cukrem (adenozyna).
Występuje makroenergiczne wiązanie fosfodiestrowe.
Poszczególne jony różnią się ilością reszt kwasu fosforowego.
ATP to związek makroergiczny. Przy rozkładzie hydrolitycznym wiązania wydzielają duże ilości energii > 25KJ/mol
Grupy związków makroergicznych:
O wiązaniach bezwodnikowych fosforanowo-fosforanowych (np. ATP)
O wiązaniach bezwodnikowych karboksylowo-fosforanowych
Guanidyno-fosforanowych
Trio estrowych
AD. C).
Fosfokreatyna (w tkance mięśniowej kręgowców)
Fosfoarginina (w tkance mięśniowej bezkręgowców)
AD. B)
Fosfoenylopirogronian
Funkcje aminokwasów.
Składnik budulcowy peptydów i białek. (peptydy < 100 aminokwasów; nie tworzą struktur przestrzennych. Białka > 100 aminokwasów; tworzą struktury przestrzenne)
Biorą udział w biosyntezie puryn, pirmidyn, porfiryn, mocznika
Przenoszą impulsy w układzie nerwowym,
Wzór ogólny:
Izomery optyczne aminokwasów L i D
Stan jonizacji aminokwasu w zależności od pH
Punkt izoelektryczny – jest to taka wartość pH, przy której wypadkowy ładunek danego aminokwasu jest równy 0.
Podział aminokwasów:
Białkowe :egzogenne ; endogenne (mogą być syntetyzowane w organizmie)
Niebiałkowe.
Ornityna cytrulina β-alanina
Kwas 4-amino-masłowy
Aminokwasy:
-niepolarne
-polarne
a) kawasowe
b) obojętne
c) zasadowe
Niepolarne:
(Gly) – glicyna
(Ala) – alanina
(Val) – valina
(Leu) – leucyna
(Met) – metionina
(Phe) – fenyloalanina
(Try) – tryptofan
(Pro) – prolina
Polarne: Obojętne: Serotonina Treonina Tyrozyna Cysteina Asparagina Glutamina |
Kwaśne: Kwas asparaginowy Kwas glutaminowy |
Zasadowe: Arginina Lizyna Histydyna |
---|
Aminokwasy egzogenne:
Phe, Ile, Leu, Lys, Met, Thr, Trp, Val, Arg, His.
Aminokwasy endogenne:
Ala – powstaje z pirogronianu – produkt glikolizy
Asp – powstaje ze szczawiooctanu – składnik cyklu Krebsa
Asn – z kwasu asparginowego
Cys – z aminokwasów metioniny lub seryny
Gly – z choliny lub aminokwasów alaniny lub seryny
Glu – powstaje z α-ketoglutanianu – składnik cyklu Krebsa
Gln – z kwasu glutaminowego
Pro – z kwasy glutaminowego
Ser – z 3-fosfoglicerynianu – składnik glikolizy
Tyr – z aminokwasu egzogennego – fenyloalaniny.
Wiązania peptydowe.
Tworzy się między C grupy karboksylowej aminokwasu a N grupy aminowej aminokwasu. Wiązanie jest sztywne.
Peptydy:
Oligopeptydy (2-10 aminokwasów)
Polipeptydy (11-100 aminokwasów)
Białka (>100 reszt aminokwasów)
Funkcje naturalnych peptydów:
Hormony, trucizny, substancje sygnałowe i regulatorowe.
O ważnej funkcji biologicznej:
Enkefaliny – pentapeptydy występujące w mózgu o silnym działaniu przeciwbólowym.
Endorfiny – występują w przysadce mózgowej (α, β – endorfiny)
Peptydy toksyczne:
Fallotoksyna – pobudza czynność skurczową macicy w czasie porodu
Wazopresyna
Insulina – obniża poziom glukozy, jej niedobór powoduje wzrost poziomu glukozy we krwi.
Glukagon – działa przeciwstawnie. Szybki wzrost glukozy we krwi i zmniejsza poziom glikogenu w wątrobie.
Glutation :
- aktywator lub inhibitor niektórych enzymów
- koenzym
- przeciwutleniacz
- czynnik usuwający szkodliwe nadtlenki
- reduktor w reakcjach redox.
Wzór przedstawiający formę zredukowaną glutationu.