anhydraza węglanowa 7 izoform u człowieka w ertytrocytach a w II katatlizuja dehydratacje HCO3- do co2 aby ten wydalić

Podstawowe procesy fizyczne jak dyfuzja i transfer protonów ograniczają szybkość hydratacji i dlatego enzymy te dysponują specjalnymi mechanizmami dla osiągnięcia takiej szybkości

związanie h2o z centrum tworzonym przez zn2+ zmniejsza się pka wody do 7.0 tym sposobem powstają jodny kydroksylowe (nukleofile) które atakują co2

mechanizm jan zn ułatwia uwolnienie się protonu z H2o co prowadzi do powstania oh- co2 wiąże się CO2 z centrum aktywnym enzymu i jest ustawiany tak żeby doszło do reakcji z oh-

oh- atakuje co2 przekształcając go w hco3

hco3 uwalnia się i następna h2o może się wizać z centrum aktywnym

wahadło protonowe

his 64 usówa proton z h2o związanej z zn2 powstaje oh- i uprotonowana his

bufor uswa protnon z his regenerując form bez protonu

kataliza nukleofilowa (lepiej mechanizm nukleofilowy katalizy)

w hatalizie nuklefilowej tworzy się wiązanie kowalencyjne między nukleofiem ezymu i grupą na cząsteczce substratu w stanie przejściowym reakcji

właśnie tworzenie kawalencyjnego wiązanie jest czynnikeim który najbardziej zwiększa reaktywność stanu przejściowego substratu w stosunku do stanu podstawowego

nukleofilowe

OH

SH

COO-

NH2

histydyny

kataliza elektrofilowa

kowalencyjnej trzowy się pośrednik między kationowmy elektrofilem enzymu i bogatuą w elektroony cześcia cząsteczki substratu

łąńcuchy boczne aa nie są dorymi …

np. tworzenie zasady schiffa (iminy) w wyniku nukeofiloego ataku aminy na grupę karbonylową

Uprotonowany azot możę teraz działać jako silna grupa ściągająca elektrony w celu stabilizacji ładunku ujemnego na jednym w węgli α

ketokwas - aminokwas bez grupy aminowej

dehydrogenaz glutaminowa z 2okoso grularanu i jonu … tworzy glutaminian

amino trensferaz asparaginowa

kinazy monofosforanów nukleozydów

enz te katalizują przeniesienie końcowej grupy fosforanowej z trójfosforaniu nukleozydu na grupę fosforanową nukleozydów

proces musi tak przebiegać żeby fisforany nie został przenisiony na czasrtczkę wody; atp został by wtedy zhydrolizowany

enzymy są nieaktywne gdy brak mg2+ i mn2+

Mg i mn tworzy kombpleks z substratem

całe atp w komórkach zwiazane z megnezem

zazwyczaj dwa atomy tlenu i czetry czateczki wody są związane w ten sposób z mg2+ jon mangezu stanowi dodatkowy punkt odziaływania między atp-mg

wiazanie atp indukuje zmiany konformacyjne

normalnie ma lid domain (domena pokrywka)

pętla p po związniu atp zamyka się ciągnąc domenę pokrywy

pentla p odziaływuje z grupą fosforanową atp

wiązanie woddorowe łączą atp

działanie kinazy adenylowej jest kalsycznym przykładem indukowanego dopasowania

to jest kataliza przez przybliżenie. centrum aktywne powstaje pdzieki …

białka z domeną pętli p to sprężyny motory i zegary

domenty p są zdolne do zmian konformacyjnych w wyniku wiązania y hydrolizy trifosforanu nukleozydu

podjednostaka β syntazy atp

nie zawsze można używać równań M-M do analizy inhibicji odwracalnej

można gdy:

inhibitory wiążą się i uwalniają szybko w poówniau z liczbą obrotów enzymów

steż wolnego inh jest równe stężeniu inhibitora kóry nie został zwiazany z enzymem

typ zależność prędkość ustalania równowagi między E I Oraz EI

kalsyczne I>>E szybkie

ciasno wiązane I~= E szybkie

powoli wiązane I>>E powolne

powoli ciasno wiązane I~= E powolne

jeśli nie zastosuje się wysokich stęzeń substratu to można wyciągać mylące wnioski i zgnorować zjawisko inhibicji casnego wiązania

podwojenei odwrotności wykres w przypadku inhib ciasneo wiązanych wydaje się podobny do wykresu klasycznej inhibijic nie kompetycyjnej niezależnie od prawdziwego sposobu działania tych inhb

w początkowym czasie niezahamownym jeszcze enzymu prezentuje quasi-liniowy przebiega reakcji by w miarę upływu czasu zmeniać go liniowośc o innym charaktereze

z powodu powolnego wiązanai przywe powstawania produktórwu początkowo są nisko nahcylone by pośniej osiągnać szybkość stanu ustalonego

aktywność enzy regulują

inhibitory i aktywatory

oddziaływnnie allosteryczne

wiązanie białek stymulująchy i hamujących

odwracalne modyfikacjie konwelencyjne (np. fosforylacje

aktywność proteolityczna

allosteryczne

enzym kontrolowany stezeniem substratu - nie wystarcza do regulacji przemian metabolicznych

heksokinaza (glikoliza) jest hamowana przez glukozo 6 fosforan

inhibicja zwrotna kontrola alosteryczna

hamowanie zykle na poziomie pierszej reakcji szklaku

reakcje hamowane inhibitorem powoli wiązanym

W początkowym czasie niezahamowany jeszcze enzym prezentuje quasi-liniowy przebiega reakcji by w miarę upływu czasu zmienić go w liniowość o innym charakterze

Z powodu powolnego wiązania krzywe powstawania produktu początkowo są nisko nachylone by później osiągnąć szybkość stanu ustalonego

---