WODA, GLEBA I POWIETRZE JAKO ŚRODOWISKO BYTOWANIA DROBNOUSTROJÓW
Gleba
Gleba jest dobrym siedliskiem dla rozwoju drobnoustrojów.
Bakterie żyją tu na granicy dwóch faz: powierzchni cząstek stałych i koloidów.
Na glebę jako środowisko bytowania drobnoustrojów składa się:
-część stała-stanowi 50% gleby, wyróżniamy: koloidy mineralne (tu przyklejają się drobnoustroje) i koloidy organiczne ( związki humusowe)
-powietrze glebowe-35%, wypełnia wolne przestrzenie między stałymi elementami gleby, zawiera NH3, CO2, N2, O2 mało CH4, H2S
-roztwór glebowy-15% to woda występująca w tym środowisku wraz z substancjami mineralnymi i organicznymi, stanowi źródło substancji odżywczych dla drobnoustrojów.
Od czego zależy skład mikroflory gleby?
-ilości składników odżywczych
-pH( odczyn gleby- gleba gliniasta, zawiera mniej bakterii niż piaszczysta)
-dostępność tlenu
-wilgotność ( zbyt mało wody hamuje rozwój drobnoustrojów; zbyt dużo utrudnia jej przewietrzenia i prowadzi do stworzenia warunków beztlenowych).
Ilość drobnoustrojów w glebie waha się od kilku milionów do kilku miliardów drobnoustrojów Ig gleby.
Najwięcej mikroorganizmów jest w glebach żyznych, w warstwie gleby uprawnej, w ryzosferze i próchnicy. Na Saharze także występują drobnoustroje- ich liczba to kilka tysięcy komórek na 1g.
Rolą mikroorganizmów glebowych jest rozkład martwej materii organicznej do produktów łatwo przyswajalnych przez rośliny.
Pełnią rolę substancji chemicznych będących zanieczyszczeniami środowiska, a przez co biorą udział w obiegu pierwiastków w przyrodzie.
Typy bakterii glebowych (wg Winogradskiego)
*Autochtoniczne- naturalna mikroflora gleby, są to Gram-ujemne, nieprzetrwalnikujące pałeczki, wykorzystujące wiele różnych związków jako źródło węgla i energii, stanowią 50-80% ogólnej ilości mikroflory.
Przykłady:
-rodzaje Artherobacter, Corynebacterium, Mycobacterium, Peutomonas, Bacillus
*część promieniowców, grzybów
*bakterie autotroficzne
*bakterie śluzowe
*bakterie azotowe: Nitrobacter, Nitrosomas
*Zymogenne- bakterie rozwijające się okresowo w glebie po wprowadzeniu substancji odżywczych (np.;resztek roślinnych) rozwój uzależniony jest od dopływu świeżej materii organicznej.
Przykłady:
-Pseudomonas, nieprztrwalnikujące laseczki tlenowe i beztlenowe
*Allochtoniczne- bakterie wprowadzone do gleby żyznych środowisk np.; wraz z odchodami zwierząt
Przykłady:
-E. coli, Enterococcus taecalis
Woda
*stanowi najistotniejsze pod względem objętościowym środowisko życia drobnoustrojów
Środowisko wody możemy podzielić na:
-wody podziemne
-wody powierzchniowe
-wody gruntowe
Czynniki determinujące rozwój mikroorganizmów wodnych:
-biotyczne, fizyczne, chemiczne
-zawartość pokarmu ( w wodach czystych zawartość pokarmu jest mała, co sprzyja bakteriom oligotroficznym, wykorzystującym śladowe ilości pokarmu)
-zawartość rozpuszczonych gazów- głownie ilość tlenu
-temperatura- większość wód, są to wody zimne, które sprzyjają rozwojowi bakterii psychrofilnych i mezofilnych
-dostęp światła
-ruchy wody
Mikroorganizmy wodne
-osiadłe- tworzą biofiltr na martwych powierzchniach w zbiorniku wodnym np.; Pseudomonas, corylobacter, Neuskia, Flavobacterium, alcatinges lub tzw. zespół poroślowy - wzrost w postaci błonki na wodnych roślinach i martwych cząstkach materii- Leptohirir, sphoarothilus natas.
-wolnopływające- bierne unoszą się w toni wodnej lub mają zdolności aktywnego przemieszczania się za pomocą rzęsek tworzą baktrioplqnkton.
Mikroorganizmy allochtoniczne środowiska wodnego
-przedostaja się do wody z powietrza, gleby oraz ze ściekami
-wody zanieczyszczone ściekami mogą stanowić źródło epidemi np.;Vibro chleare, Salmonella- dur brzuszny, Shigella- czerwonka, wirus WZW, pierwotniaki, jaja pasożytów, zarodniki grzybów.
Kontrola stanu mikrobiologicznego wód polega na:
-zbadaniu obecności w wodzie bakterii stale bytujących w przewodzie pokarmowym człowieka, zwierząt, bakterii z grupy coli, citrobcter freundii, enterobacter aerogenius), paciorkowców kałowych ( enterococcus), laseczek beztlenowych ( clostridium)
Wykrycie tych bakterii świadczy o feralnym zanieczyszczeniu
Kontrola taka nie obejmuje izolacji z wody drobnoustrojów chorobotwórczych, ponieważ liczba tych bakterii szybko spada, a okres wylęgania choroby jest długi.
Powietrze
-jest środowiskiem wtórnym dla drobnoustrojów
-rozprzestrzenianie drobnoustrojów odbywa się dzięki prądom wraz z przemieszczaniem cząstek kurzu , bowiem drobnoustroje przyczepiają się do pływów obecnych w powietrzu.
-w formie aerozolu biologicznego- wydalamy z otwartych jam ciała człowieka
Czynniki warunkujące liczbę drobnoustrojów w powietrzu
-warunki środowiska
-wysokość- im wyżej tym mniej drobnoustrojów
-pora roku( zimą mniej niż latem)
-strefa klimatyczna ( w tropikalnej najwięcej, w arktycznym mniej)
-rodzaj atmosfery ( w miastach więcej niż na wsiach, polach, lasach)
-opady -usuwają mechaniczne pyły
Najwięcej drobnoustrojów jest w warstwie powietrza bezpośrednio stykającej się z gleba
W powietrzu jest stały dostęp światła i drobnoustroje Bronia się przed fotouczuleniem - wytwarzają barwniki- żółte, czerwone ( z grupy karetonoidów)
Drobnoustroje bytujące w powietrzu
-bakterie z rodzaju : Micrococcus, Scarcina, Bacillus, Achromobacter
-drożdze: Torulopsis, Rhontorula
-grzyby: nitkowate Penicillum, Aspergillus, bacillus, achromobacter
Analiza mikrobiologiczna powietrza
- określa stopień zakażenia danej objętości powietrza 1m3, 10l
Metody analizy mikrobiologicznej powietrza
1.Sedymentacja kocha ( płytkowa)
Otwarte płytki z podłożem odżywczym wystawiamy w kilku miejscach pomieszczenia na określony czas. Drobnoustroje wraz z kurzem opadają na podłoże (PIN-89, 2-04008/08)
2. Puszki
Odmierzoną ilość powietrza wtłacza się do naczynia zawierającego określona objętość jałowej wody lub soli fizjologicznej. Drobnoustroje zostają uwiezione w płynie, który bada się metoda płytkową. Znając ilość wtłoczonego powietrza, ilość płynu obliczamy liczbę drobnoustrojów w 1 ml powietrza
3. uderzeniowa
Aparat przepuszczający odmienna ilość powietrza kieruje się na płytki z podłożem odżywczym.
RÓWNOWAGA BIOLOGICZNA W GLEBIE. OBIEG AZOTU.
Równowaga biologiczna w glebie.
Jest to stan, w którym skład ilościowy i jakościowy drobnoustrojów w glebie utrzymywany jest na pewnym poziomie, wahającym się w określonych granicach dla danego rodzaju gleby.
Co wpływa na równowagę biologiczna w glebie:
-aktywność metaboliczna drobnoustrojów
-zabiegi agrotechniczne tj. orka
-zabiegi agrotechniczne, np.; nawożenie, opryskiwanie
Zaburzenie równowagi biologicznej może być okresowe lub trwałe- zależy od rodzaju czynnika i jego nasilenia w czasie.
W laboratorium zjawiska zaburzenia równowagi można przedstawić na glebowych płytkach agaryzowanych.
Płytka kontrolna 10g gleby
Płytka z sacharozą 10g gleby + 0,5 g sacharozy
Płytka z peptonem 10 g gleby + 0,5 g peptonu
Płytka z NPK 10g gleby + 1ml NPK ( 1% NH4No3, 1% KH2PO4)
Płytka z sacharozą i NPK 10 g gleby + 0,5g sacharozy + 1ml NPK
Obieg azotu
*Azot jest jednym z najważniejszych pierwiastków w przyrodzie
*Jest głównym składnikiem powietrza
* Głównym produktem w obiegu azotu jest amoniak- jest to produkt końcowy w degradacji białek i aminokwasów.
Obieg azotu
NO2- i NO3-
Nitryfikacja Denitryfikacja
NH+4 N2
Wiązanie azotu atmosferycznego
Drobnoustroje mogą wykorzystywać różne formy azotu:
1.Cząsteczkowy ( znajdujący się w atmosferze)
2.Mineralny (jony NH+4, NO-3, NO-2, sole amonowe są łatwiej przyswajalne)
3.Organiczny (występujący w prostych i złożonych związkach organicznych)
Udział bakterii w krążeniu azotu:
*Denitryfikacja-oddychanie azotanowe- desymilacyjna redukcja azotanów.
Proces, w którym azot związany zostaje przekształcony w formę cząsteczkową. Jest to redukcja azotanów do azotynów, wolnego azotu i NO2, NO, N2O.
NO-3 NO-2 NON2ON2
1 2 3 4
Enzymy katalizujące proces:
-1 etap dysymilacyjna reduktaza azotanowa
-2 etap reduktaza azotynowa
-3 etap reduktaza tlenku azotu
-4 etap reduktaza podtlenku azotu
Przykłady bakterii denitryfikujących:
Pseudomonas denitryficans, Paracoccus denitryficans, Bacillus licheniformis, Pseudomonas aeruginosa
*Amonifikacja azotanów
Bakterie beztlenowe przeprowadzają proces redukcji azotanu do azotynu, ale nie jest on redukowany do wolnego azotu i uwalniany do atmosfery, lecz ulega dalszej redukcji do amoniaku. NO-3Nh+4
*Mineralizacja- Amonifikacja białek
Białka i aminokwasy są rozkładane przez drobnoustroje z wydzieleniem amoniaku. Proces ten sprowadzany w pożywce dla amonifikatorów, w której znajdują się aminokwasy jako źródło węgla i energii.
*Nitryfikacja
Proces utleniania amoniaku do azotynów i azotanów przy udziale bakterii nitryfikacyjnych.
NH3Nh4OH[NOH]NO-2NO-3
Enzym 1- monooksygenaza amonowa
Przykłady bakterii nitryfikacyjnych:
Nitrosomonas europea, Nitrobacter winogradskyi, a także rodzaj Nitrococcus i Nitrosolobus, Nitrosospira, Nitrosovibrio.
Wiązanie azotu ( atmosferycznego) cząsteczkowego
Biologiczne wiązanie azotu polega na redukcji wolnego azotu do amoniaku z udziałem enzymu nitrogenezy, która składa się z nitrogenezy i reduktazy nitrogenazowej.
*drobnoustroje są jedynymi organizmami, które są w stanie wiązać azot atmosferyczny
*przeprowadzają one proces wiązania N2 do związków organicznych
*wydajność tego procesu waha się od 100/300kg N/rok/ha- dla bakterii symbiotycznych, wolnożyjące 1-3 kg
Symbiotyczne wiązania azotu
-za proces ten odpowiedzialne są drobnoustroje z rodzaju Rhizobium, Bradyrizobium
-są gram ujemne pałeczki- ściśle tlenowce
-mają one zdolność tworzenia brodawek korzeniowych u roślin motylkowych
Etapy tworzenia brodawki korzeniowej
Wiązanie azotu przez bakterie wolnożyjące
*należą do nich bakterie wodne i glebowe, m.i. grupy purpurowych bakterii siarkowych i bezsiarkowych i sinic, np.: Xantobacter, Alcaligens i inne.
*większość bakterii tlenowych proces wiązania azotu przeprowadza w warunkach zmniejszonego dostępu tlenu
*wyjątek stanowi grupa Azobacter, np.; Achroococcum, która w pełnie przystosowała się do obecności tlenu.
*sinice ( znanych jest 40 gat.) pełnią dużą rolę w procesie wiązania azotu atmosferycznego, szczególnie na polach ryżowych 30-50 kg N/rok/ha