wykłady z genetyki i parazytologii 2007-2008 część 3 - genet, farmacja, parazytologia


GENETYKA

- termin wprowadzony przez Batesona w 1906 r.

Mendel :

- jednostki dziedziczności, zawiązki cech - „merkmallen”

- prawo czystości gamet:

Pojęcia `gen'. `genotyp', `fenotyp' zaproponował Johansen

Gen - podstawowa jednostka dziedziczenia zajmująca w chromosomie określone miejsce, czyli locus, jest określonym segmentem DNA, który koduje odpowiednią sekwencję aminokwasów polipeptydu

- pierwszy raz zaproponował taką nazwę Johannes (1909 r.)

Genotyp - zespół cech danego osobnika, całość informacji genetycznej organizmu

Przenoszenie informacji genetycznej:

DNA -(transkrypcja) RNA -(translacja) białko

Kod genetyczny:

Fenotyp - zespół cech zewnętrznych powstałych na skutek ekspansji genotypu oraz działania środowiska, całość cech fizycznych organizmu

Cytogenetyka - dział genetyki zajmujący się:

- chromosomami

- determinacją płci

- relacjami płci - stosunek liczbowy/procentowy płci męskiej i żeńskiej w czasie rozwoju człowieka

- chromosomopatiami = chorobami chromos. spowodowanymi aberracjami chromosomowymi:

1. chromosomopatie autosomalne = Chromosomopatie autosomów:

- trisomie - np. zespół Downa

2. chromosomopatie płci = Chromosomopatie heterochromosomów:

- monosomie - np. zespół Turnera

- polisomie - np. zespół Klinefertera

Chromosomy:

- odkryte w 1875 r. przez Edwarda Strasburgera

- nazwę `chromosomy' wprowadził Waldayer w 1888 roku - chroma = barwa, soma = ciało

- wielkość chromosomów nie jest związana z ich liczbą

- definicje:

  1. kontener z pulą informacji genetycznej (magazynuje informację genetyczną) służącym do przemieszczania tej informacji w czasie mitozy i mejozy

  2. chromosom jest jednostką segregacji grup sprzężonych genów, które przemieszczają się razem

  3. chromosom to struktura sprzężona, złożona z sekwencji nukleotydowych, spełniająca tę samą funkcją mimo różnic strukturalnych u eukariontów i prokariontów - przenoszenie informacji genetycznej z komórki na komórkę, z pokolenia na pokolenie, kontrolująca funkcję i rozwój komórki

Rodzaje chromatyny:

  1. heterochromatyna - rodzaj chromatyny silnie barwiącej się barwnikami zasadowymi, silnie skondensowana - to chromatyna nieaktywna, niefunkcjonalna

  • euchromatyna - słabo się barwi, jest rozluźniona:

  • - procaryota - genofor (DNA) - zastępuje właściwy chromosom (nie jest to jednak struktura zaliczająca się do definicji pojęcia chromosomu)

    - eucaryota - chromosomy (DNA, białka histonowe)

    Rozmiary chromosomów:

    - wielkość nie jest związana z ich liczbą komórce ani ze stopniem rozwoju organizmu,

    - im organizm na większym stopniu rozwoju tym więcej materiału genetycznego

    - u człowieka są małe chromosomy, u cebuli długie, krótkie u roślin z rodziny kapustowatych

    Chromosomy olbrzymie - politeniczne:

    - taenia (łac.) - wstążka - powstają w wyniku wielokrotnej endomitotycznej replikacji chromosomów bez mitoz, składają się z wielkiej liczby ułożonych równolegle chromosomów o bardzo słabej spiralizacji,

    1. chromosomy ślimakowe - w jądrach nie dzielących się komórek gruczołów ślinowych larw Dwuskrzydłych

    2. chromosomy szczoteczkowe - w oocytach kręgowców

    3. chromosomy tojadu - Aconitum - trujące

    Przewężenia chromosomów:

    - chromatyna słabo się barwi

    - rozróżniamy rodzaje chromosomów ze względu na położenie centromeru


    - ramiona chromosomów: p (ramię krótkie), q(ramię długie) xp , xq

    - region (kompleks): centromer (DNA) - kinetochor (białko)

    - kinetochor - odpowiada za połączenie mikrotubul wrzeciona podziałowego do chromosomu i za właściwy ruch w trakcie podziałów komórki,

    - Rodzaje kinetochorów:

    a) zlokalizowany = chromosom monocentryczny - to najczęstszy rodzaj kinetochorów

    b) niezlokalizowany (= dyfuzyjny = rozproszony) - w chromosomach holokinetycznych - brak przewężenia pierwotnego - mikrotubule przyczepiają się w wielu miejscach

    - występuje w chromosomach akrocentrycznych z satelitą = trabantem (to oddzielony przez przewężenie wtórne koniec chromosomu)

    - chromosomy z przewężeniem wtórnym nazywamy chromosomami jąderkotwórczymi - w telofazie w przewężeniu wtórnym powstają jąderka, przewężenie wtórne zawiera RNA (materiał tworzący jąderko), jest widoczne jako przewężenie, ponieważ RNA barwi się inaczej niż DNA budujące cały chromosom

    Liczba chromosomów:

    - jest charakterystyczna dla gatunku, ale może być taka sama u różnych gatunków:

    - liczba haploidalna - n (w gametach) - u glonów, mszaków, grzybów z chromosomów rozwijają się samodzielne organizmy - organizmy haploidalne

    - liczba diploidalna - 2n (w komórkach somatycznych)

    - liczba chromosomów z przewężeniem wtórnym jest stała dla danego genomu i odpowiada liczbie jąderek w interfazie, o ile nie nastąpiła fuzja jąderek, np.:


    Człowiek 2n=46

    Pszenica 2n=46

    Cebula 2n=16

    Czosnek 2n=16


    Drosophila melanogaster 2n=8


    n = x n = x = 23

    2n = 2x 2n = 2x = 46

    Podstawowa liczba chromosomów to x, ale nie zawsze n = x !

    n = 2x => 2n = 4x (tetraploidalny)

    - na każdą cechę przypadają 2 geny

    Tetraploid 2n = 4x !

    Aberracje liczbowe chromosomów :

      1. Aneuploidia - aberracje kilku chromosomów (2-4)

      2. Poliploidia - zmiana całego garnituru chromosomowego

    Jak powstaje triploid:

    1. 2n + n - komórka jajowa zawiera 2n chromosomów, a plemnik n lub odwrotnie

    2. Dispermia - kiedy komórka jajowa jest zapłodniona dwoma plemnikami

    3. Endomitoza - podziały chromosomów bez podziałów komórki

    Ad.2 - Poliploidia:

    kolchicyna - alkaloid (Colchicum autumnale - zimowit jesienny)

    oryzalina - herbicyd - środek chwastobójczy

    Poliploidalność u człowieka:

    Kariotyp - zespół chromosomów charakterystyczny dla komórek somatycznych danego osobnika

    - kariotyp ≠ genotyp !!!

    - K(kobieta): 46, XX

    - M(mężczyzna): 46,XY

    - część komórek ma zestaw prawidłowy, a część nie

    Kariogram = ideogram - zestaw sfotografowanych lub narysowanych chromosomów jednej komórki opracowany wg zasad ustalonych na konferencji w Paryżu 1971 roku

    Konferencja Denver (1960 r.):

    - zasady ustalono podziału:

    - A-G (grupy) - wielkość i położenie centromerów

    - 1-22 - pary chromosomów

    - chromosom X - grupa C, para 6

    - chromosom Y - grupa G

    Determinacja płci:

    - haploidalna - diploidalna (odrębne) - np. pszczoły: n - męskie (w wyniku partenogenezy), 2n - żeńskie (z jaj zapłodnionych)

    Rodzaje płci człowieka:

    Rodzaj

    Kobieta

    Mężczyzna

    Genetyczna

    ------

    SDR (odcinek chromosomu Y)

    Chromosomowa

    X

    Y

    Chromatynowa

    chromatyna płciowa, ciałko Barra, pałeczka dobosza

    ------

    Gonadalna

    jajniki

    jądra

    Hormonalna

    estrogeny

    androgeny

    Fenotypowa(somatyczna)

    Noworodek - córka

    Noworodek - syn

    Metrykalna

    Imię żeńskie

    Imię męskie

    Psychiczna = psychoseksualna

    Model zachowania kobiety

    Model zachowania mężczyzny

    Płeć chromosomowa (XY):

    - u roślin nasiennych - rzadko - są rozdzielnopłciowe - np. szczaw, bniec biały

  • uwolniony ze zniszczonych krwinek hem przekształca się w bilirubinę

  • uwolniony CO2 łączy się z hemoglobiną w innych erytrocytach i obniża ich zdolność transportową

  • obrzęk płodu w 18-19 tygodniu ciąży

  • skutkiem choroby hemolitycznej jest przewlekła niedokrwistość

  • może dojść do obumarcia płodu

  • po urodzeniu objawy konfliktu są mocniejsze

  • część bilirubiny jest odprowadzana do organizmu matki

  • Wykrywanie:

        1. identyfikacja krwinek płodu z krwi matki

        2. badanie krwi płodu

        3. określenie genotypu

        4. odczyn antyhemoglobinowy Coombsa

    Leczenie:

    - pierwotnie stosowano przedwczesny poród (ze względu na wzrastającą przepuszczalność łożyska)

    - perinatologia:

    a) transfuzja fetoskopowa

    b) transfuzja dootrzewnowa

    c) transfuzja wewnątrzotrzewnowa

    - transfuzja krwi u noworodków

    - plazmoforeza

    - immunoforeza - osocze dawców immunizowanych dla uzyskania większego miana krwinek

    Profilaktyka:

    - zapobieganie immunizacji kobiet

    - osłabienie odpowiedzi immunologicznej - leki immunosupresyjne

    - podawanie surowicy anty-D zaraz po urodzeniu dziecka

    Albinizm (=bielactwo) uogólniony tyrozynoujemny:

    - cecha monogenowe recesywna

    - defekt przemiany tyrozyny, brak enzymu - tyrozynazy - przemieniającego tyrozynę

    - zahamowanie syntezy melaniny w melanocytach (brak w skórze, włosach, tęczówce):

    * melanosomy - pęcherzyki gromadzące melaninę

    - u różnych raz są różne ilości melanosomów oraz melaniny:

    * u rasy nigroidalnej brak enzymów rozkładających tyrozynę

    0x08 graphic

    Fenotyp:

    - skóra różowa

    - włosy bezbarwne

    - tęczówki różowe lub niebieskie

    - zmniejszenie ostrości wzroku

    Mukowiscydoza = zwłóknienie, zwyrodnienie torbielowate trzustki = Cystic Fibrosis = CF

    - najczęstsza choroba autosomalne rasy kaukaskiej

    - częstość 1/2 000 - 1/3 000, w Polsce 1/2 300, Azjaci 1/90 000, Murzyni 1/17 000

    - gen CFTR - 25 tys. nukleotydów, gen znajduje się w chromosomie 7q 23,2

    * gen również koduje białko o nazwie CFTR lub białko kanału chlorkowego(reguluje procesy wydzielania wewnętrznego

    - jest więcej jak 500 mutacji tego genu:

    * mutacja najczęstsza - trójnukleotydowa delecja

    * brak kodonu CTT brak w białku CFTR w pozycji 508 aminokwasu fenyloalaniny

    * ta jedna delecja powoduje silne zaburzenia w regulacji procesów wydzielniczych organizmu (zaburzenia w transporcie jonów chlorkowych przez błony)

    - do krzyżówki:


    * mm - chory

    * MM - zdrowy

    * Mm - nosiciel


    Fenotyp:

    - jest zmienny, w różnych chorych jest różny

    - wielonarządowa manifestacja choroby:

    * zasadniczo dotyczy układu oddechowego i pokarmowego

    * nadmierne wydzielanie śluzu, zwłaszcza w płucach

    - duża śmiertelność - średnia wieku to około 30 lat

    - występuje również niewydolność trzustki

    - w ślinie i pocie wzrasta stężenie jonów chlorkowych

    - heterozygoty Mn mają zwiększoną odporność na zakażenia bakteryjne dróg oddechowych i jelit

    Wykrywanie:

    - ocena zmian płucnych

    - testy trzustki

    - poziom jonów Cl- w ślinie, ogólne badanie Na+

    - badanie DNA w płynach prenatalnych,

    - prowadzi się badania przesiewowe noworodków

    - do tej pory jedynie 1 opisany nowy przypadek mutacji

    Leczenie:

          1. objawowe:

    - leczenie dietą wysokokaloryczną

    - stosuje się enzymatyczne preparaty trzustkowe

    - antybiotykoterapia

    - przeszczepy płuc, płucoserca

    - inhalacja płuc, odsysanie śluzu

          1. przyczynowe:

    - „poprawianie genu” - genowa terapia somatyczna - wprowadza się `dziki', nie zmutowany gen

    - transfekcja - podawanie genu do komórek nabłonka oddechowego

    - retro lub adeno wirusy mogą być stosowanie w leczeniu

    Fenyloketonuria

    - blok metaboliczny:

    0x08 graphic

    - zdiagnozowana - 1934 r. Fölling

    - genotypy:


    * FF - zdrowy

    * ff - chory

    * Ff - nosiciel


    - lokus 12q 24

    - częstość to 1/2 000 - 1/20 000 żywych urodzeń

    - u chorych:

    0x08 graphic

    Fenotyp:

    - objawy ujawniają się dopiero około 3 miesiąca życia

    - obniżone IQ, jasne włosy, jasna skóra

    - wymioty, napięcie mięśniowe

    Wykrywanie:

    - test moczu - oliwkowe zabarwienie moczu

    - test Guthriego - zastosowanie Bacillus subtillis żywiących się fenyloalaniną

    - DNA - badania prenatalne

    Leczenie:

    - dietetyczne - bez fenyloalaninowa dieta (bez mleka):

    * jeśli stosuje się dietę odpowiednio wcześnie, to można nawet wyleczyć

    - fenokopia

    Galaktozemia

    0x08 graphic
    - zaburzenia w przemianie galaktozy:

    - lokus 9p

    - występowanie 1/12 000 - 1/30 000 żywych urodzeń

    - nietolerancja laktozy i mleka krowiego

    Wykrywanie:

    - oznaczanie aktywności urydynotransferazy

    Leczenie:

    - dietetyczne

    - plejotropia

    Niedokrwistość sierpowatokrwinkowa =

    = hemoglobinopatia S

    - występowanie 1/250 urodzeń, Afryka - murzyni

    - hemoglobina A (normalnie we krwi) = hem + globina A(2α, 2β) - pozycja 6 w łańcuchu β - kwas glutaminowy

    - hemoglobina S = hem + globina S (2α, 2β) - zmieniony - pozycja 6 w łańcuchu β-waliny

    Genotyp

    Fenotyp

    HbS / HbS

    - niedokrwistość sierpowatokrwinkowa - 50% krwinek sierpowatych

    - zamiast hemoglobiny A jest hemoglobina S - erytrocyty uszkodzone (zawierają stronty, łatwo hemolizują, zmienny ładunek elektryczny)

    HbA / HbS

    - zdrowa osoba

    - krwinek sierpowatych 1%

    - posiada obie hemoglobiny (A i S)

    - występuje wrażliwość na obniżanie ciśnienia tlenu

    HbA / HbA

    - zdrowa osoba

    - posiada hemoglobinę A

    - kodominacja - wytwarzanie hemoglobiny HbA = HbS, podobnie było z grupami krwi A i B, układ…

    Objawy (fenotyp):

    - bóle głowy, żółtaczka

    - niewydolność nerek, owrzodzenie goleni

    - powiększenie wątroby i nerek

    - zagrożeniem jest:

    *duży wysiłek fizyczny

    * znaczna wysokość

    * wysiłek, podróż samolotu

    Wykrywanie:

    - badanie krwinek (inkubacja w 37*C:

    * 0,5-1 godzina - HbS / HbS

    * 4-6 godzin - HbA / HbS

    - elektroforeza - badanie krwinek za pomocą prądu

    - diagnostyka molekularna - badanie płynu owodniowego - bada się DNA za pomocą restryktaz, które dzielą DNA na fragmenty

    Uprzywilejowanie heterozygot:

    - preferowane na terenach malarycznych

    - zarodziec malarii nie może się prawidłowo rozwijać

    - 10% Murzynów HbA / HbS

    Inne hemoglobinopatie - talasemia

    - występowanie - rejon morza Śródziemnego:

    - talasemia α - niedostateczna synteza łańcucha α

    - talasemia β - niedostateczna synteza łańcucha β

    Fenotyp:

    - erytrocyty tarczowate

    - niedokrwistość, powiększenie śledziony

    Cechy sprzężone z płcią:

    - to cechy zależne od genów znajdujących się w chromosomach płciowych:

    * hemizygotyczność - pojedynczo allele w genotypie diploidalnych

    * hemizygota - osobnik hemizygotyczny (hemi-połowa)

    - są to cechy zależne od genów autosomalnych, ale możliwość ich rozwoju zależy od płci

    Hemofilia = krwawiączka = choroba królewska

    - genetyczny defekt układu krzepnięcia - skaza krwotoczna

    - hemofilia A - brak czynnika VIII (globulina antyhemolityczna = globulina przeciwkrwawiączkowa)

    * synteza w wątrobie

    - w Polsce około 1/12 000 urodzeń

    - królowa Wiktoria była nosicielką i jej córki także

    - hemofilia A - lokus genu 10p 28, gen strukturalny, ……………….

    - hemofilia B - lokus 10q 27.1-27.2 , w Polsce 1/30 000 urodzeń, brak czynnika X

    - w lokusie hemofilii A jest też umiejscowiona ślepota na barwy

    - hemofilia możliwa jest również u zwierząt

    Objawy:

    - objawy hemofilii ujawniają się w 1-2 roku życia

    - ogólnonarządowe, pourazowe krwawienia

    - krwawienie z błon śluzowych

    Genotyp

    Fenotyp

    homozygoty

    XH XH

    Kobieta zdrowa

    XH Y

    Mężczyzna zdrowy

    Xh Xh

    Kobieta chora

    Xh Y

    Mężczyzna chory

    XH Xh

    Kobieta zdrowa, ale nosicielka,

    obniżona zawartość czynnika VII

    Częstość występowania homozygot:

    Xh Xh = 1/10 000 x 1/10 000 = 1/100 000 000

    Hipoteza Lyon a hemofilia:

    - jeden chromosom jest aktywny, drugi nieaktywny

    Xmat Xpat

    1)

    XH Xh act

    50%

    Kobieta zdrowa

    XH act Xh

    50%

    czynnik VIII +

    2)

    XH act Xh

    100%

    czynnik VIII +

    Wszystkie……………………………….(?)

    Aktywny chromosom z allelem zmutowanym

    3)

    XH Xh act

    100%

    czynnik VIII -

    (brak czynnika)

    Jawna heterozygota - hemofilia

    Wykrywanie:

    - diagnostyka DNA

    Leczenie:

        1. objawowe:

    - leczenie substytucyjne - podajemy czynnik VII dożylnie, podawanie okresowe

    - czynniki VIII jako produkt inżynierii genetycznej

        1. przyczynowa:

    - terapia genowa (gen typu dzikiego - transfekcja do szpiku)

    Daltonizm

    - ślepota na barwy

    - według Younga-Hernholza - widzenie 3 barw - 3 fotoreceptory

    - achromatyzm - całkowita ślepota na barwy, wada autosomalna recesywna

    - monochromatyzm -

    - dichromatyzm - daltonizm - widzenie dwóch barw:

    a) tritanopia - niewidzenie barwy niebieskiej, dziedziczenie autosomalne monogenowe

    b) protanopia - niewidzenie czerwnieni

    c) deuteranopia - niewidzenie zieleni

    - malie - niedowidzenie barw:

    - tritanomalia

    - protanomalia

    - deuteranomalia

    - wykrywanie daltonizmu za pomocą metody pigmentowej

    P: Xd Y x XD XD Xh Y IA IB (hemofilik) x XH XH I0 I0 (zdrowa)

    F1: XD Xd , XD Y XH Xh IA I0, XH Xh IB I0, XH Y IA I0, XH Y IB I0

    Dystrofia mięśniowa postępująca typu Duchenne'a

    - najcięższa i najczęstsza odmiana dystrofii

    - częstość - 1/3 000 chłopców

    - gen DMD - jeśli jest niezmutowany to koduje białko zwane dystrofiną

    - Allel typu zmutowanego (delecja) Xdst

    - Allel typu dzikiego XDst

    - genotyp z dystrofią: Xdst Xdst , Xdst Y

    - wzrost poziomu enzymów: kinazy kreatynowej i dehydrogenazy mleczanowej

    Objawy:

    - ujawnia się w 2-3, a nawet 5-6 roku życia

    - osobie trudno wstać z siadu

    - dziwny, kaczkowaty chód

    - charakterystyczny rozrost łydek (tkanka łączna a nie mięśniowa!)

    - dawniej śmierć około 10 roku życia, obecnie najczęściej około 20, a czasem 30 roku życia

    - śmierć z powodu niewydolności oddechowej oraz niewydolności krążenia

    Wykrywanie:

    - badania DNA:

    a) prenatalne

    b) postnatalne

    - elektromiogram

    Leczenie:

    - podaje się steroidy anabolizujące, kwas glutaminowy

    Głuchota - cecha sprzężona z płcią !

    Dominujące choroby sprzężone z płcią:

    - istnieją cechy sprzężone z chromosomem Y, ale są one niezwykle rzadkie

    - niektóre cechy mylnie są przypisywane do chromosomu Y

    Krzywica odporna na witaminę D = hipofosatemia

    - wydzielana duża ilość fosforanów z moczem

    Objawy:

    - takie jak w zwykłej krzywicy, ale nie leczy się jej witaminą D, bo jest odporność

    Istniał spór między zwolennikami Galtona i Mendla

    Genetyka mendlowska Mendelizm

    - dziedziczenie jakościowe

    - krzyżówki mendlowskie

    - prawa Mendla

    - sukcesy:

    1. czyste linie grochu

    2. analiza matematyczna wyników badań

    Genetyka Galtona dziedziczenie ilościowe

    - lekarz, twórca eugeniki, ojciec daktyloskopii

    - zajmował się cechami t.j wzrost, inteligencja, uzdolnienia, linie papilarne

    Fischer:

    - kuzyn Darwina, matematyk, eugenik

    - zajmował się dziedziczeniem poligonowym, genetyka populacji

    - „inbreeding” - chów wsobny

    Dziedziczenie ilościowe spowodowane współdziałaniem dużej liczby genów

    Współdziałanie w dziedziczeniu - rodzaje:

      1. - w parze alleli - kodominacja

      2. Genów niesprzężonych:

        1. współdziałanie 2 genów: