■;f -
Ćwiczenie 1
Izolacja DNA z materiału roślinnego
- zamrożony lub świeży materiał roślinny rozetrzeć na proszek w moździerzu przy użyciu ciekłego azotu (rozbicie struktur komórkowych, uwolnienie DNA);
- do wychłodzonej probówki typu Eppendorf o pojemności 1,5 ml przenieść ok 100 mg roztartą tkanki;
- dodać natychmiast 700 pl bufoni ekstrakcyjnego D (denaturacja białek tworzących kompleksy z DNA);
- zawartość probówki bardzo dokładnie wymieszać (vortex);
- dodać 600 ul mieszaniny chloroform:alkohol izoamylowy (24:1) (oddzielenie DNA od innych struktur komórkowych i chlorofili);
- zawartość probówki bardzo dokładnie wymieszać ok 5 min
- otrzymaną emulsję wirować 10 min 14 000 rpm;
- odebrać górną wodną fazę (ok 500 pl) do nowych probówek;
- dodać 500 ul schłodzonego (-20stC) izopropanolu (wytrącenie DNA);
- całość delikatnie wymieszać aż do pojawienia się strątu;
- wirować 10 min. 14 OOOrpm;
- po wirowaniu nadsącz usunąć;
- dodać 800 ul 80% etanolu, opłukać probówki wewnątrz obracając je w palcach;
- wirować 5 min. 14 000 rpm;
- nadsącz (alkohol) usunąć;
- otrzymany osad wysuszyć w próżni;
- rozpuścić w 100 pl jałowej wody MiHiQ.
- zmierzyć stężenie preparatu.
Przygotowanie elektroforezy dla wyizolowanych preparatów DNA Przygotować mieszaninę (w najmniejszej probówce o objętości 200 pl):
-8plH20
- 2 pl izolat DNA
- 1 pl barwnik ładujący
11 ul (vortex, wirowanie), nakładać na żel
Elektroforezę prowadzić na 1 % żelu agarozowym przy natężeniu ok. 5 V/cm przez 1 h.