Schemat niżej ilustruje sposób wiązania się polipeptydu na nośniku z immobilizo-- wanym jonem metalu:
R
NH
(
C=0
II
O
o=c
NH
NT A
Rys. 2. Zasada chromatografii IMAĆ - wiązanie się polipeptydu na nośniku z immobilizowanym jonem niklu (II)
Wymienione ligandy tworzą trój - lub czterokleszczowe chelaty z jonami niklu lub kobaltu, zatem możliwe jest utworzenie trzech (IDA) lub dwu (NTA) wiązań koordynacyjnych z białkiem - to determinuje siłę wiązania białko-metal, a tym samym -stężenie imidazolu konieczne do elucji tego białka. Ponieważ imidazol w wysokich stężeniach może niekorzystnie oddziaływać na białko, projektuje się inne ligandy ( pięcio-- kleszczowe) silniej wiążące metal, a słabiej białko.
Cel ćwiczenia :
Poznanie techniki chromatografii IMAĆ w zastosowaniu do oczyszczania rekombinowanego 6xHis-GFP i porównanie rozdziałów na IDA (Ni2^) Sepharose oraz Talon (Co2+)
Spektrofotometr UV/VIS Kolektor frakcji (opcja)
Spektrofluorymetr (opcja)
Kolumny chromatograficzne 1,5 x 10 cm (np. Econo column, Sigma lub Kontes)
Pipety automatyczne, zmienno pojemnościowe
A) Nośniki do chromatografii IDA (Ni2^) i Talon (Co2^) w buforze startowym
B) Bufor startowy - 25 mM Tris-HCl, 0,3 M NaCl, pH 7,4
C) Bufor startowy jw. z 10 mM imidazolem
D) Bufor startowy j.w z 50 mM imidazolem
E) Bufor startowy j.w z 125 mM imidazolem
F) Bufor startowy j.w z 200 mM imidazolem
G) Odwirowany lizat bakteryjny zawierający 6xHis-GFP w buforze startowym
H) Około 50 mM roztwór EDTA.2Na
I) Około 50 mM roztwór CoCF
2