Wśród toksyn białkowych wyróżnić można:
- toksyny związane z komórką i uwalniane po jej rozpadzie,
- toksyny związane z komórką i jednocześnie wydzielane do środowiska.
- toksyny nie związane z komórką i wydzielane do środowiska.
Toksyny białkowe wydzielane do środowiska odpowiadają dotychczasowemu pojęciu egzotoksyny.
Toksyny o strukturze lipopolisacharydu -dawniej endotoksyny - są częścią błony zewnętrznej ściany komórkowej bakterii Gram-ujemnych uwalnianą dopiero po rozpadzie
komórki