W wyniku takią cyklicznej reakcji otrzymujemy więc łańcuch podstawowy . Każde białko ma ściśle określoną genetycznie uwarunkowaną kolejność aminokwasów aminokwasów łańcuchu Łańcuch taki może się układać w przestrzeni na różne sposoby, jednak najczęściej zwija się on najpierw najpierw spiralę w ten sposób, że reszty węglowe aminokwasów ustawiaj a się na zewnątrz spirali. Strukturę tę zwiemy:Cłlfa-heliks. Posiada ją większość białek enzymatycznych. Spirala taka układa się następnie przestrzennie w ścisłe określony sposób Zmiana tego przestrzennego ułożenia łańcucha (np.pod wpływem ogrzewania) powoduje z reguły utratę specyficznych właściwości danego białka. Również jeśli dojdzie do zmiany jakiegoś aminokwasu w łańcuchu na inny (np.w skutek mutacji genetycznej), białko może utracić swoje specjalne biologiczne właściwości
Procesy trawienia białek to rozbijanie łańcucha białkowego powrotem na aminokwasy. Aminokwasy są wchłaniane w jelitach i transportowane do komórek gdzie są zużywane albo jako budulec-do budowy własnych białek, albo jako paliwo. W procesie rozkładu aminokwasów wyróżnić można dwa etapy.
Pierwszy to usunięcie azotu, czyli grupy aminowej oraz dalsze losy tegoż azotu prowadzące ostatecznie do zsyntezowania mocznika i wydalenia go z moczem Mechanizmów usuwania grupy aminowej jest kilka, jednak zawsze jako produkt tej reakcji powstaje odpowiedni ketokwas. Grupa aminowa- -NH2 jest więc zamieniana na tkn-0 R-CH(NH2KOOH->R-COO-COOH
Szkielety węglowe stanowią o wartości energetyczną aminokwasów.
Aminokwasy podzielić można według rodzaju grup dodatkowych przyłączających się do łańcucha węglowego. Innego podziału można dokonać według ich wpływu na pH; kwaśne (-COOH), obojętne i zasadowe(-H2). oraz weefiug rozpuszczalności: dobrze rozpuszczalne w wodzie(-OH. -SH, -COOH, -NH2) i dobrze rozpuszczalne w tłuszczach (bez grup dodatkowych).
Ogólny schemat włączania się aminokwasów do cyklu Kresa. Wśród aminokwasów wyróżnić można zasadniczo trzy grupy
te które w procesie spalania dochodzą do acetyło-CoA
2. te które w procesie spalania dochodzą do pirogronianu
te które przekształcają się do któregoś ze związków pośrednich cyklu Kresa.
Taki podział aminokwasów wynika z odmiennych losów jakie mogą te aminokwasy spotkać. Aminokwasy metabolizujące się bezpośrednio do acetylo-CoA mogą (podobnie jak tłuszcz) ulec tylko i wyłącznic spaleniu Aminokwasy metabolizujące się do związków cyklu Kresa SA dobrym dawcą 34.REAKCJE FAZY JASNEJ FOTOSYNTEZY:
NADPH2 do syntezy kwasów tłuszczowych, łatwo tez mogą zamienić się na glukozę Los aminokwasów przekształcających się do pirogronianu zalez natomiast od tego czy pirogronian
w' pcnfcBZtlicpsy
do acetyło-CoA, czy tez szczawiooctanu Ponieważ Ponieważ warunkach dostatku energii i pożywienia pierwsza z tych reakcji jest silnie hamowana a druga pobudzona, można powiedzieć że prawie w całości zamieniają się one wtedy na szczawiooctan-metabołizm cyklu kresa. W warunkach braku energii- zmieniają się one na acetylo-CoA i ulegaj a spaleniu.
Reakcja jasna fotosyntezy: Błony tyiakoidów zawierają rybosomy barwników PS I i PS II zdolnych do absorbeji energii świetlną oraz wiele zw. białokowych stanowiących układy oksydacyjno-redukcyjne zdolne do transportu S wybitych z PS I i PS II przez kwanty świetlne. PS I barwniki ułożone są następującej kolejności: (PS I fotosystemu I), p karoten, chlorofil B, chlorofil A, P 700 PS II: ksamofile, chlorofil B, chlorofil A.P680 Barwniki PS I i PS U pełnią rolę łzw. anten energetycznych tzn. przekazują zabsorbowaną energię do centrów reakcji w PS I — barwnik P700i w PS U— P680 ( są
to specjalne formy chlorofilu A o maksimum absorbeji: 700 nm i 680 nrn ) P700 i P680 stanowią tzw antenę energetyczną. En. Pochłonięta przez ten barwnik umożliwia przepływ energii, w barwnikach tych powstaje luka ć Takie zw. są silnymi utleniaczami czyli dążą do uzupełnienia tą luki. 6 wybite z barwników są przekazywane przez szereg zw. a w wyniku tego transportu wyzwala się en którą rośliny wykorzystują do syntezy ATP i NADPH2, w transporcie 8 biorą udział formy utlenione i zredukowane zw. białkowych.
CrO^-łCO,
d
Ct-k
COo«
FA5V\
Biotyna (wit. H)jest czynnikiem wzrostowym bakterii i drożdży w tkankach zwierzęcych, występuje w niewielkich ilościach, w roślinach zacznie więcej. Głównymi źródłami są drożdże i wątroba Dzienne zapotrzebowanie człowieka to 100 mg, przy spożywaniu surowych jaj wzrasta. Awitaminoza na skutek braku biotyny u ludzi występuje rzadko, objawia się zmianami w skórze, bólem mięśni, osłabieniem. Biotyna pełni rolę koenzymu przenoszącego grupy karboksylowe, jest związana z karboksylazami tak stale, że nie daje się od nich oddzielić przez dializę. Aktywną formą o charakterze enzymu jest karboksybiotyna, która tworzy się z udziałem COj i ATP
Synteza DNA (replikacja) - musi ją poprzedzać podział kom. w celu wyposarzenia kom. potomnych w kompletny materiał genetyczny. Replikacja dokonuje się w drodze rozplecenia się podwójną hełiksy na dwie nici i dobudowaniu do każdą nici nową zgodnie z zasadą dopełniał ności zasad.
Przy udziale widełek replikacyjnych i enzymu hdiksazy następuje rozwinięcie się hełiksy i rozpoczęcie syntezy DNA, która przebiega w kierunku widełek replikacyjnych poruszających się na jedną nici DNA (3’+—*5’), kierunek syntezy nowego
łańcucha (5’-»3‘)je« zgodny z kierunkiem przemieszczania się widełek replikacyjnych na drugiej nici DNA (5’—*3’) jest przeciwny (3’+-*5’).
Pierwsza z nid wydłuża się w sposób ciągły przy udziale I cz. połimerazy DNA III, a druga potrzebuje wielu cząstek tego enzymu gdyż proces ten jest nieciągły i zaczyna się w widu miejscach. Fragmenty okazaki są następnie spajane z udziałem lipazy DNA (tworzy się wiązanie estrowe miedzy grupa OH). Przy nieciągłej syntezie są potrzebne krótkie odcinki startowe RN A komplementarne do matrycy DNA, wytwarza je enzym primaza Hełiksaza jest enzymem, który powoduje rozplecenie się podwójną hełiksy
pozostającą na różnych stopniach utlenienia, czyli mrówczan grupy metylenową lub hydro- ksyroetyłenową oraz aldehydu mrówkowego
GD,
oh-ow-cH-cT
Fosforylacja substratowa jest to zdolność organizmów do regeneracji ATP- polega na utlenianiu pochodną fosforanową, dzięki czemu związanie z resztą PO,H2 zostaje podniesiony na wyższy poziom energetyczny i przekształca się w wiązanie makroergiczne. Jednakże ten mechanizm ma ograniczone znaczenie w porównaniu z fosforylacja oksydacyjną czy fotosyntezą Reakcja z udziałem enzymu- suntetza karbomoilofosforanowa Reakcja ta jest odwracalna a przebieg jej ze strony prawą do lewą prowadzi do fosforylacji substratową, w wyniku którą tworzy się karbamoilofosforan -CP używany przy biosyntezie nukleotydów pirymidyno wyc
Faza ciemna fotosyntezy(cykl CalvinaBensona)
Ij.Karboksyiaza rybulozobifosforanowa
2) .Kinaza fosfoglicerynianowa
3) .Dehydrogenaza triozofosforanowa.
4) .Izomeraza trioza.
5) . Aldoza (kondensacja C 1 aldehydu fosfoglicerynowego z C1 fosforanu trihydroksyacetalu)
6) Fosfataza
7) .Transketolaza (przeniesienie reszty glikolowej wydzielenie fosforanu kryłułozy).
8) .Aldołaza (kondensacja Cl fosforanu erytrozy z C1 fosforanu dihydroksyacetahi
)
9)
10) .Transketolaza (przeniesienie reszty glikolową z fosforanu seroksyiazy na aldehyd fosfogłicerynowy ).
1 l).Eptmeraza (fosforan ksyłulozy »fosforanu rybulozy).
12) .Izomcraza pcntozofbsforanowa
13) Fosforoybulokinaza (estryfikaąa ATP) 41.KOENZYM F REAKCJE:
Koenzym F- w jego skład wchodzi kw. foliowy (wit. B*X nie jest on czynny biologicznie sam ale w wyniku dwukrotnego działania reduktazy dihydrofolianową współdziałającą z NADPH; przekształca się w koenzym CoF, FH4-Pte-Ghi lub THF. Z reakcją wiąże się działanie dwóch rodzajów inhibitorów współzawodniczących z PAB przy syntezie kw. Foliowego. Innym przykładem inhibitora blokującego reakcje reduktazy dihydrofolianową jest diammo-pteryna Koenzym F współdziała z enzymami przenoszącymi jednowęglową jednostkę
-to
42.CYKL PENTOZOWY:
Mechanizm bezpośredniego utlenienia glukozy: 1 )6-fosforan glukozy, 2)lakion kw 6-fosfoghiko- zowego,3)kw 6-fosfogłukonowy,4)kw. 3okso-6-
Białka mają zasadnicze znaczenie w przemianach żywych organizmów Podstawowe czynniki katabo- iiczne-enzymy, czyli katalizatory biologiczne umoź- liwiające przebieg reakcji biochemicznych z dostate- czną szybkością w łagodnych warunkach fujołogicz- nych komórki są białkami
Roztwory białek mają charakter koloidalny, rozproszone cz. mają charakter hydrofilny i otaczają się płaszczem wodnym co chroni je przed łączeniem się w większe zespoły. 46. BU DO W A 1 ROLA FAD:
(FAD) dinuklcotyd flawinoadeninowy Jego składnikiem jest ryboflawina wit B2 zapobiega zmianom w obrębie błon śluzowych i tworzeniu «ę zajadów Dzienne zapotrzebowanie człowieka na wit. B2 to 1,8 mg, najwięcej je zawierają warzywa liściaste, mięta, mleko, białko jaj, wątroba, nerki.
Część fiawtnowa nie może być zanurzona w nukleotyd gdyż nie zawiera typowego wiązania N-glikozydowego.
Ru- rybuloza, Ksu- ksyhiloza. Ryb- ryboza. Tri- trioza. Su- sudoheptułoza, Eryt-erytroza. Fruktoza.
Cykl pentozowy ma znaczenie ze względu na dostarczanie produktów pośrednich, np pentoz, które są użytkowane przy budowie kw. nukleinowych: koenzymów a także
erytrazy.
43.1 RN A:
T RNA transportujący występuje z reguły w cytoplazmie podstawową; wykazujący masę cząsteczkową ok. 25000 Da. Jego funkcja polega na wiązaniu i przenoszeniu aktywowanych aminokw do miejsca syntezy białka czyli rybosomów, t RNA jest jednym z 3 rodzajów kw. rybonukleinowych i stanowi ok. 15% ogólną zawartości RNA w komórce.
Fosforylacja oksydacyjna (sprzężenie chem konforma- cyjne) Teoria Mitcheła zakłada wytwarzanie osmotycznego gradientu kationów wodorowych podczas przepływu 8 przez łańcuch oddechowy; wytwarza się gradient protonowy powodując, że pH po zewnętrzną stronie półprzepuszczalną wewnętrzną błony mitochondrialną jest mniejsza o 1,4 jednostki mż po zewnętrzną stronie błony. Tworzy się w ten sposób potencjał transportowy, za którego pośrednictwem łańcuch przenośników 8 oddziały wujo z kompleksem syntetazy ATP, która przeprowadza kompleks mitochondrialny etapami, składa się on z dwóch części: Fr część hydrofobowa, którą można oddzielić i działa wtedy jako hydrataza ATP, natomiast syntetaza ATP z udziałem czynnika AT nie jest ponana Fo* kanał protonowy połączony kilkoma białkami, synteza ATP zachodzi podczas powrotu protonów przez kanał protonowy z cytochromową na matriksową stronę błony mitochondrialną.
Białka są to zw. złożone z co najmniej 100 aminokwasów a pewna ich grupa dodatkowo zawiera składnik niebiałkowy, co dzieli je na proste i złożone Ze względu na kształt rozróżnia się białka globulame czyli sferyczne i włókniste czyli fibry!ame Białka fibryiame - b. Czynne o charakterze enzymów, antygenów, itp.
Białka włókniste- b. Strukturalne podporowe jak kreatyna, fibroina. miozyna, kołegen
Budowa przestrzenna białek może być przedstawiona w postaci kolejno po sobie następujących grup aminową, karboksylową i węgla 2 z występującymi na zewnątrz rodnikami poszczegółr^h aminokwasów. Składniki te są powiązane wiązaniami peptydowymi i stanowią strukturę pierw&zorzędową białka.
Koenzymy flawinowe współdziałają z enzymami przenoszącymi elektrony i protony ze zredukowanego NAD+, czyli z reduktazami łub w niektórych wypadkach bezpośrednio z substratu czyli z dcchydrogcnazami Grypą czynna przy przenoszeniu protonów i elektronów jest układ izoalłoksazynowy, który odwracalnie może przyłączyć do atomów azotu w pozycjach 1 i 5.
Dram mac ja aminokwasów: powoduje wydzielanie się amoniaku, w wyniku czego powstaje 2-oksokwas lub rzadziej kw. nienasy- eony. Wyróżnia się 2 typy dcaminaąi: 1) deaminację oksydacyjną gdzie enzymy mogą współdziałać z NAD+ lub NADP+, FAD lub FMN Reakcja deaminacji jest nieodwracalna:
Uważa się, że głównym enzymem katalizującym deaminację aminokw jestdehydrogenaza L-ghitaminianowa współdziałająca z FAD Reakcja ta jest odwracalna.
Inne typy deaminacji:
derakuracja (amoniak oliazy) deaminazy, asparaginowa, fenyloalaninowa u roślin fenyloałanina-»kw cytrynowy.
c)
redukcyjna przebiega w glebach w warunkach beztlenowych, powstaje kw i
amoniak