kry 6

58

3. Obliczanie kątów torsyjnych.

Strukturę przestrzenną związków chemicznych charakteryzować można w pierwszym przybliżeń® jakościowo. Na przykład pierścienie zbudowane z 6 atomów oprócz konformacji płaskiej przybierać mogą konformacje: krzesłową, łodziową itd. Ilościowo konformację cząsteczek można wyrazić poprzez kąty torsyjne. Kąt torsyjny dla danego wiązania chemicznego A—B (z uwzględnieniem czterech połączonych atpmów A—B—C—D) ma znak dodatni, jeśli dla kierunku rzutowania B > C (atom B nad atomem Q wiązanie A—B pokryje się z wiązaniem C—D przy obrocie w kierunku zgodnym z mchem wskazówek zegara o kąt mniejszy od 180*.

Obliczenie „wszystkich” kątów torsyjnych powoduje instrukcja CONF. Zawężenie się tylko do kątów torsyjnych interesujących użytkownika nastąpi po napisaniu obok instrukcji CONF nazw 4 atomów tworzących dany kąt torsyjny.

4. Obliczanie kątów międzyptazyznowych - badanie planamości grup atomów.

Bywa często lak, że w cząsteczkach związków chemicznych grupy pewnych atomów są płaskie te pierścienie fenylowej. Plaskośó grup można charakteryzować średnią płaszczyzną przechodzącą przez atomy oraz odległościami od niej poszczególnych atomów. Ułożenie w przestrzeni względem siebie poszczególnych grup nie jest na ogól dowolne. Można je opisaó przez obliczenie np. kątów węftypbszez/wwch (np. kąty między czterema płaskimi grupami fenylowymi w kationie tetra-feajfbumowp).