■Podczas gdy uzyskane wyniki pomiarów ekologicznych (np. system określania jakości wody) często bazują na zanikaniu pewnych gatunków w warunkach stresowych (a zatem wykorzystują 'fakt końcowy toksyczności), podejście do biomarkerów wykorzystuje odpowiedzi organizmów nadai żyjących w warunkach niekorzystnych jako wczesne ostrzeżenia przed poważnym zniszczeniem populacji lub ekosystemów.
Biomarkery reagują w sposób szybki na środowiskowe czynniki stresowe. przed wystąpieniem skutków ekologicznych, są wykorzystywane do wykrywania tych skutków na wczesnych etapach.