PCR - VNTR (ang. variable number of tandem repeats)
- Metodyka:
• Specyficzne startery amplifikujące mini- i mikrosatelitarne loci
• Rozdział produktu PCR na żelu poliakrylamidowym
• Wy barwienie bromkiem etydyny, SYBR Green bądź srebrem
• Brak wyniku ilościowego - oszacowanie optyczne
PCR - STR (ang. short tandem repeats; krótkie tandemowe powtórzenia)
- Metodyka:
• Reakcja PCR z jednoczesnym znakowaniem barwnikami fluorescencyjnymi
* Rozdział produktów w żelu poliakryamidowym -elektroforeza kapilarna, aparat sekwencyjny
PCR - STR (ang. short tandem repeats; krótkie tandemowe powtórzenia)
- W genomie ludzkim 104 STR
- Wybór zestawu STRs:
• Poziom heterozygotyczności danego locus
• Ilość możliwych alleli i częstość ich występowania
• Długość powtarzającego się fragmentu
• Czułość detekcji populacji komórek będących w mniejszości: 1-5%
- Amplifikacja kilku do kilkunastu STR naraz