Firmicutes. Tutaj wyróżnia się dwie główne grupy:
1. Fakultatywne beztlenowce, jak bakterie mlekowe (Lactobacillaceae, Aerococcaceae, carnabacteriaceae, Enterococcaceae, Leuconostocaceae, Streptococcaceae)
2. Beztlenowce, jak klasa Clostridia i Erysipelotrichia.
Są szeroko rozpowszechnione w środowisku i odpowiadają za degradację polimerycznej materii organicznej (celuloza, lignoceluloza, pektyny, białka, aminokwasy)
Nilrospira. Typ ten zawiera Thermodesulfovibrio, zdolny do redukcji siarczanów, wykorzystuje do wzrostu mleczan i pirogronian. utleniając je do octanu.
Proteobacteria. Gramujemne pałeczki. Wiele z nich to fototrofy - purpurowe bakterie bezsiarkowe (Rhodospirillales), zawierające Bchl a lub b oraz purpurowe bakterie siarkowe (Chromatiaceae), zawierające barwniki brązowe, czerwone, różowe czy beżowe. Mogą rosnąc fotoorganoheterotroficznie, ale także jako fotolitoautotrofy wykorzystujące wodór, siarczki lub żelazo jako donory elektronów. Procesy fermentacji prowadzą w ciemności. a-Proteobacteria
1. Rhodospirillaceae — Rhodospirllum, Phacospirillum, Rhodocista, Rhodospira, Rhodovibrio, Skermanella, Thalossospira
2. Rhodobacteraceae — Rhodobacter, Rhodobaca, Rhodothalassium, Rhodovulum
3. Bradyrhizobiaceae — Rhodoblastus, Rhodopseudomonas
4. Hyphomicrobiaceae — Blastochloris, Rhodomicrobium, Rhodoplanes
35