1) Pobranie próby ze środowiska
2) Hodowla wzbogacająca
3) Testy selekcyjne
4) Testy fermentacyjne
5) Identyfikacja gatunkowa wybranego mikroorganizmu
Pobranie próby ze środowiska - środowisko (naturalne lub przekształcone przez człowieka), to wybrane przez nas na drodze racjonalnego wyboru źródło mikroorganizmów, z którego spodziewamy się wyizolować, z zastosowaniem klasycznych technik mikrobiologicznych, mikroorganizmy o właściwościach, które stanowiąo ich atrakcyjności biotechnologicznej
Kryterium wyboru miejsca pobrania próby - założenia pro jektowe
Powodzenie skriningu zależy w dużym stopniu od maksymalnej koncentracji poszukiwanych drobnoustrojów, przy jednoczesnym zmniejszeniu udziału niepożądanych.
W celu osiągnięcia takiego efektu stosuje się:
1) odpowiednie oddziaływanie na środowisko przed pobraniem próby
2) wprowadzenie do środowiska wabików - pułapek
3) wstępną obróbkę fizyczną lub mechaniczną próby
4) hodowlę wzbogacającą
1. Pobranie próbki środowiskowej z gleby
i
2. Inkubacja
i
3. Pobranie próby środowiskowej
Posiew
Pobranie próby ze środowiska
1. Wprowadzenie środka selekcyjnego (antrazyna zwiększenie liczby promieniowców)
^ 2. Inkubacja w pożywce
zawierającej czynnik selekcyjny
Niektóre z metod zmiany normalnego składu populacji:
- wprowadzenie do środowiska odpowiednich związków chemicznych, powodujących wzrost liczby jednego rodzaju mikroorganizmów lub szkodzących wzrostowi innych
- użycie tzw. wabików - pułapek wprowadzanych do środowiska na określony czas
Hodowla wzbogacająca (z zastosowaniem podłoży wzbogacających) -metoda opiera się na wprowadzeniu do próbki pobranej ze środowiska związków chemicznych pełniących rolę czynnika selekcyjnego, pozwalającego na zmiany liczebności mikroorganizmów tworzących populację drobnoustrojów zawartych w badanej próbce, podczas jej inkubacji w określonych warunkach fizykochemicznych.
- do wstępnej obróbki zasiedlanych przez mikroorganizmy materiałów podczas izolacji różnych grup fizjologicznych można wykorzystać działanie czynników fizycznych
Kluczową rolę w namnażaniu się określonych grup drobnoustrojów odgrywa skład chemiczny podłoża. Stosowane są podłoża kompleksowe lub syntetyczne wzbogacane.
Istotnym czynnikiem selekcyjnym w podłożach stosowanych do namnażania grup drobnoustrojów jest obecność różnych substanc ji o swoiste j toksyczności , głównie antybiotyków.
Czynnik hamujący wzrost :
grzybów - cykloheksimid, nystatyna bakterii - streptomycyna lub tetracykliny, bakterii gram „+" - penicylina lub D-cykloseryna bakterii gram - polimyksyny
... potencjał oksydacyjno-redukcyjny ... czas trwania hodowli ... hodowlę ciągłą.
... związki chemiczne powszechnie uważane jako obce dla metabolizmu drobnoustrojów
... obecność ksenobiotyku