Mikrobiologia przemysłowa w przemyśle farmaceutycznym.
Wyselekcjonowane szczepy mikroorganizmów stosowane są do produkcji: antybiotyków, leków steroidowych, witamin.
Wyselekcjonowane kultury bakterii i drożdży stosowane są do produkcji probiotyków -preparatów farmaceutycznych przywracających naturalną mikroflorę ukfadu pokarmowego. Prebiotyk - substancja obecna lub wprowadzana do pożywienia w celu stymulacji rozwoju prawidłowej flory jelit, poprawiająca w ten sposób zdrowie. Prebiotykiem może być naturalny składnik diety np. skrobia, błonnik pokarmowy lub dodatki do żywności (suplementy diety) o charakterze prozdrowotnym.
W odróżnieniu od probiotyku nie zawiera żadnych mikroorganizmów, a jedynie substancje stymulujące. Prebiotyki to nietrawione - oporne na działanie enzymów trawiennych w przewodzie pokarmowym - składniki żywności, które korzystnie oddziałują na gospodarza przez selektywną stymulację wzrostu i/lub aktywności jednego rodzaju lub ograniczonej liczby bakterii w okrężnicy i w ten sposób poprawiają zdrowie gospodarza. Tymi substancjami mogą być białka, tłuszcze, oligo- lub polisacharydy, które nie ulegają trawieniu i w formie niezmienionej docierają do światła jelita, by tam rozwijać swoje działanie.
Hodowle komórkowe i tkankowe są wykorzystywane przy produkcji: szczepionek, przeciwciał monoklonalnych stosowanych w diagnostyce medycznej i badaniach naukowych. Rekombinantowe szczepy mikroorganizmów stosowane są przy produkcji: szczepionek, insuliny, hormonu wzrostu.
Mikrobiologia przemysłowa w przemyśle chemicznym.
a. Produkcja aminokwasów: l-lizyny. L-cysteiny, kwasu L-glutaminowego i kwasu L-asparaginowego.
b. Produkcja rozpuszczalników: butanolu, acetonu
c. Produkcja dekstranu
d. Produkcja kwasu glukonowego
e. Produkcja kwasu itakonowego
Diagnostyka mikrobiologiczna w ujęciu mikrobiologii przemysłowej.
Produkcja odczynników, leków diagnostycznych i aparatury diagnostyki mikrobiologicznej w przemyśle spożywczym, farmaceutycznym i weterynarii. Opracowanie zasad kontroli czystości mikrobiologicznej dla poszczególnych procesów technologicznych, np. w przemyśle spożywczym, zapewniających ochronę produktów przed psuciem lub zakażeniem mikroorganizmami szkodliwymi lub patogennymi.
Mikrobiologia przemysłowa w ochronie środowiska.
Pozyskiwanie cennych pierwiastków z użyciem technologii „przyjaznych" dla środowiska naturalnego: mikrobiologiczne ługowanie metali np.. uranu z zastosowaniem bakterii Ihiobacillus ferroxidans i Thiobacillus thiooxidans; mikrobiologiczne zatężanie metali z wód kopalnianych lub wody morskiej, np. złota, miedzi, srebra, plutonu, uranu z zastosowaniem biosorbentów z żywymi kulturami mikrobiologicznymi.
Oczyszczanie ścieków i bioremediacja gleby: bioremediacja gleb skażonych produktami ropopochodnymi z zastosowaniem wybranych szczepów bakterii glebowych, np. z rodzaju Acinetobacter lub Pseudomonos; stosowanie „stopnia biologicznego" w oczyszczalniach ścieków powiązanego z produkcją biogazu oraz produkcja bioetanolu.
Produkcja preparatów enzymatycznych:
Izolacja enzymu z hodowli jego naturalnego producenta. Produkcja enzymu z wykorzystaniem mikroorganizmu rekombinowanego: