I w dwunastnicy jest zobojętnienie kwaśnego odczynu treśa pokarmowej | ipTT 3,5-4,5) przechodzącej z żołądka. Enzymy soku trzustkowego działają [najwydajniej w środowisku obojętnym lub lekko zasadowym. Kwaśna tresc pokarmowa zobojętniana jest przez wodorowęglany soku trzustkowego, soku Fiełitowego oraz żółć. Komórki trzustki pobudzane są do wydzielania alkalicznego płynu, z wysoką koncentracją jonów HCO3-, przez hormony — sefcrety-nę i naczynioaktywny peptyd jelitowy (VTP). Hormony te produkowane są w śluzówce dwunastnicy i dostają się do trzustki drogą krwionośną. Im ; więcej zakwaszonej treści pokarmowej wpływa do dwunastnicy, tym bardziej zwiększa się wydzielanie sekretyny i VEP. Komórki trzustki syntetyzują j wydzielają enzymy soku trzustkowego pod wpływem innego hormonu śluzówki dwunastnicy — cholecystokminy (CCK), a także są pobudzane przez acetylocholinę - mediator nerwu błędnego. Z kolei hormon somatostatyna hamuje wydzielanie soku trzustkowego.
Gruczoły dwunastnicze obecne w błonie podśluzowej wydzielają sok jelitowy. Krótkimi przewodami wyprowadzającymi spływa on do krypt jelitowych i zagłębień między kosmkami jelitowymi. Zawiera on enzym - enterokina-zę, która uczynnia trypsynogen i chymotrypsynogen do aktywnej formy tych enzymów — trypsyny i chymotrypsyny. Duża zawartość wodorowęglanów soku jelitowego alkalizuje środowisko w dwunastnicy. Czynnikami, które pobudzają wydzielanie soku jelitowego są składniki chemiczne treści pokarmowej oraz mechaniczne drażnienie ściany dwunastnicy przez przesuwającą się miazgę pokarmową.
W dwunastnicy kontynuowane jest trawienie polipeptydów, które powstały w wyniku hydrolizy białek przez pepsynę soku żołądkowego oraz białek, które nie zostały rozłożone. Trypsyna i chymotrypsyna - enzymy soku trzustkowego — atakują wiązania peptydowe w wewnętrznych partiach cząsteczki białka, dlatego należą do grupy endopeptydaz. Trypsyna rozbija wiązania peptydowe przyległe do argininy lub lizyny, natomiast chymotrypsyna - wiązania peptydowe przyległe do aminokwasów aromatycznych. Peptydy powstałe pod wpływem działania endopeptydaz są dalej hydrolizowane przez egzo-peptydazy soku trzustkowego - karboksypeptydazy. Odcinają one od cząsteczki peptydu końcowe aminokwasy z wolną grupą karboksylową. Enzymy proteolityczne soku trzustkowego są bardzo aktywne, dlatego w wyniku ich działania w dwunastnicy, 50-70% białka pokarmowego ulega strawieniu.
W jelicie czczym i biodrowym dłuższe i krótsze peptydy atakowane są przez egzopeptydazy produkowane przez enterocyty i wydzielane na powierzchnię pokrytą mikrokosmkami. Trawienie odbywa się więc w obrębie rąbka prążkowanego (trawienie przyścienne). Do enzymów należą - ami-